MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	CCTT	2	8	2	9	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011264	AAAT	2	8	1060	1067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011264	TTTA	2	8	1491	1498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011264	TTTA	2	8	1808	1815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011264	TTCC	2	8	2684	2691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011264	TCTT	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011264	TTTC	2	8	3356	3363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011264	CTAT	2	8	3449	3456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011264	AAAT	2	8	4707	4714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011264	TTAC	2	8	5934	5941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011264	AAAT	2	8	7128	7135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011264	ATTA	2	8	7251	7258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011264	TTAT	2	8	7304	7311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011264	CTCC	2	8	7910	7917	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_011264	CTTA	2	8	7923	7930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011264	CTTA	2	8	7995	8002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011264	AATA	2	8	8334	8341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011264	TAAA	2	8	8384	8391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011264	TTTA	2	8	9679	9686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011264	TCGC	2	8	9949	9956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011264	ATTT	2	8	10386	10393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011264	ATTC	2	8	10750	10757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011264	CTTT	2	8	10830	10837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011264	TACA	2	8	10900	10907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011264	ATTA	2	8	11001	11008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011264	ATTA	2	8	11016	11023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011264	TTAT	2	8	11069	11076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011264	TCTT	2	8	11255	11262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011264	TCTT	2	8	11279	11286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011264	CTTT	2	8	11540	11547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011264	TTTA	2	8	11770	11777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011264	ATTT	2	8	12079	12086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011264	ATTT	2	8	14168	14175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011264	ATTT	2	8	15081	15088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011264	ATTA	2	8	15273	15280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011264	AAAG	2	8	15848	15855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011264	CTTC	2	8	16566	16573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011264	AATC	2	8	17566	17573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011264	ATTT	2	8	17832	17839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011264	ATCT	2	8	17923	17930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011264	CTTT	2	8	18175	18182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011264	CTTA	2	8	18185	18192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011264	TTGC	2	8	18212	18219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011264	TCCA	2	8	18421	18428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011264	ATCA	2	8	18855	18862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011264	CTAT	2	8	19463	19470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011264	TTAT	2	8	19511	19518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011264	ATTT	2	8	22431	22438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011264	TAAT	2	8	22530	22537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011264	AGAT	2	8	22777	22784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011264	AGAT	2	8	22843	22850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011264	TTTG	2	8	24606	24613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011264	ATTT	2	8	24673	24680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011264	AGGA	2	8	24696	24703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011264	AATT	2	8	24773	24780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011264	AAGA	2	8	25784	25791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011264	AAAG	2	8	25941	25948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011264	AATC	2	8	26210	26217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011264	TAAG	2	8	26456	26463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011264	AGCT	2	8	26496	26503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011264	ATAA	6	24	26579	26602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011264	TTAT	2	8	26627	26634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011264	GAAT	2	8	26669	26676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011264	TTGG	2	8	27069	27076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011264	CAAG	2	8	27275	27282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011264	AAAT	2	8	27298	27305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011264	TAAC	2	8	28737	28744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011264	AATT	2	8	29299	29306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011264	AATT	2	8	29978	29985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011264	TAAT	2	8	31572	31579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.