MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	TAA	2	6	27	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011264	CTT	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011264	TAA	2	6	912	917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011264	ATT	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011264	TAA	2	6	949	954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011264	TGA	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011264	ATA	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011264	ATT	2	6	1077	1082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011264	TAT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011264	TAT	2	6	1193	1198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011264	ATA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011264	CTT	2	6	1593	1598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011264	TCA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011264	CTT	2	6	1628	1633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011264	TTG	3	9	1674	1682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011264	CTC	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011264	ACC	2	6	1735	1740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011264	CCT	2	6	1766	1771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011264	TCT	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011264	CTA	2	6	1798	1803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011264	CTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011264	CCT	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011264	TGA	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011264	TCC	2	6	1919	1924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011264	CTG	3	9	1931	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011264	CTT	2	6	1949	1954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011264	CCT	2	6	1975	1980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011264	GTT	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011264	CTG	3	9	2102	2110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011264	CAT	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011264	ATT	2	6	2184	2189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011264	CTA	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011264	TCT	2	6	2233	2238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011264	CTA	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011264	CGC	2	6	2325	2330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011264	ACA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011264	CTT	2	6	2447	2452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011264	AAT	2	6	2534	2539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011264	TTC	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011264	TAG	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011264	CTT	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011264	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011264	CTC	3	9	2672	2680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011264	CAT	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011264	CAT	3	9	2727	2735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011264	TAC	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011264	TTC	2	6	2795	2800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011264	ATT	2	6	2928	2933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011264	CAA	2	6	2939	2944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011264	CTG	2	6	2981	2986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011264	TCT	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011264	AGC	3	9	3045	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011264	TAG	2	6	3083	3088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011264	TAT	2	6	3153	3158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011264	CTG	3	9	3167	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011264	TTG	2	6	3177	3182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011264	CTA	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011264	AAC	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011264	AAT	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011264	ATT	2	6	3385	3390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011264	TCT	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011264	AAG	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011264	CAA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011264	ATG	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011264	CCT	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011264	ATT	2	6	5951	5956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011264	ATT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011264	TCA	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011264	CCT	2	6	7069	7074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011264	CAA	2	6	7436	7441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011264	CCT	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011264	CTT	2	6	7497	7502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011264	AGC	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011264	CAG	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011264	TTG	2	6	7646	7651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011264	TGC	3	9	7656	7664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011264	AAC	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011264	TAG	2	6	7742	7747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011264	CTG	2	6	7832	7837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011264	CTT	2	6	7901	7906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011264	TTC	2	6	7983	7988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011264	CTT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011264	ACC	2	6	8187	8192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011264	CAT	2	6	8205	8210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011264	CAT	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011264	ATT	2	6	8224	8229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011264	CTT	2	6	8246	8251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011264	TTC	2	6	8267	8272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011264	CCT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011264	ATT	2	6	8291	8296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011264	ATT	2	6	8357	8362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011264	TAA	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011264	CCT	2	6	9494	9499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011264	ATA	2	6	9575	9580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011264	TGC	2	6	9788	9793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011264	CTT	2	6	9799	9804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011264	TAT	2	6	9818	9823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011264	CAG	2	6	9874	9879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011264	AGT	2	6	9893	9898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011264	CAG	2	6	9904	9909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011264	CAT	2	6	9913	9918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011264	CTG	3	9	10075	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011264	TCT	2	6	10084	10089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011264	CAG	2	6	10099	10104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011264	AGC	2	6	10112	10117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011264	AAT	2	6	10125	10130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011264	CTT	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011264	ATC	2	6	10184	10189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011264	CAT	2	6	10195	10200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011264	TAC	2	6	10217	10222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011264	TCT	2	6	10223	10228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011264	TAT	2	6	10357	10362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011264	TTA	2	6	10454	10459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011264	AAT	2	6	10503	10508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011264	CCA	2	6	10557	10562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011264	ATG	2	6	10572	10577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011264	TTC	2	6	10631	10636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011264	ATC	3	9	10676	10684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011264	CAT	3	9	10687	10695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011264	ACT	2	6	10709	10714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011264	TTC	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011264	CCT	2	6	10816	10821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011264	AGA	2	6	10859	10864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011264	TCA	2	6	10891	10896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011264	CTA	2	6	11151	11156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011264	ATC	2	6	11182	11187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011264	CTG	2	6	11238	11243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011264	TAT	2	6	11245	11250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011264	CAT	2	6	11265	11270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011264	AAC	2	6	11302	11307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011264	CTG	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011264	CAC	2	6	11403	11408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011264	GCC	2	6	11438	11443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011264	ATC	3	9	11461	11469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011264	TAC	2	6	11551	11556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011264	CAA	2	6	11559	11564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011264	AGC	2	6	11608	11613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011264	CTT	2	6	11676	11681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011264	TTG	2	6	11706	11711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011264	TCA	2	6	11720	11725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011264	TTG	2	6	11787	11792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011264	CAT	2	6	11981	11986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011264	ATT	3	9	11991	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_011264	ATT	2	6	12960	12965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_011264	TAA	2	6	14387	14392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011264	TAA	2	6	15090	15095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011264	ATT	2	6	15108	15113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_011264	TTA	2	6	17917	17922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011264	ATT	2	6	17941	17946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011264	TAA	2	6	17952	17957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011264	TAA	2	6	18026	18031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011264	ATT	2	6	18076	18081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011264	TTA	2	6	18587	18592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_011264	TAG	2	6	18779	18784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011264	CAT	3	9	18803	18811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_011264	TAT	2	6	29868	29873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011264	GTT	2	6	29917	29922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011264	TTA	2	6	29927	29932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_011264	TAA	2	6	29953	29958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011264	TTA	2	6	29966	29971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011264	TAC	2	6	31018	31023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_011264	AAT	2	6	31049	31054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011264	ATA	2	6	31063	31068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011264	AAT	2	6	31070	31075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011264	TTA	2	6	31120	31125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011264	ATT	2	6	31426	31431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011264	TAA	2	6	31461	31466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011264	ATT	2	6	31477	31482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011264	AAT	2	6	31535	31540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_011264	TAT	2	6	31595	31600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_011264	TTA	2	6	31603	31608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.