MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl6

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011263	TAT	2	6	46	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011263	TAT	3	9	130	138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011263	ATT	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011263	GAG	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011263	TTA	2	6	1778	1783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011263	ATT	2	6	1794	1799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011263	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011263	AGA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011263	AAG	2	6	1926	1931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011263	TCC	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011263	ATC	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011263	TAT	2	6	2083	2088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011263	CAT	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011263	TTA	2	6	2905	2910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011263	TAA	2	6	3078	3083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011263	CAA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011263	ATT	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011263	ATA	2	6	3582	3587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011263	TAA	2	6	3619	3624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011263	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011263	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011263	TAT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011263	AAT	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011263	ATT	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011263	ATA	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011263	TCA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011263	TCA	2	6	4451	4456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011263	CAA	2	6	4494	4499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011263	CAA	2	6	4620	4625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011263	CAT	2	6	4723	4728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011263	ATT	2	6	4750	4755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011263	ATT	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011263	ATA	2	6	4829	4834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011263	TAA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011263	AAG	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011263	CTT	2	6	5035	5040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011263	TAT	3	9	5046	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011263	ATA	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011263	ATA	2	6	5200	5205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011263	AAT	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011263	TAA	3	9	5216	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011263	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011263	TAA	2	6	5261	5266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011263	TCC	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011263	CCG	3	9	5297	5305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011263	CCT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011263	AAC	2	6	5531	5536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011263	CGA	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011263	CTC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011263	GCC	2	6	5729	5734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011263	CTC	2	6	5748	5753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011263	CGG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.