MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 1115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011260	AGC	2	6	49576	49581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011260	GTG	2	6	49584	49589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011260	CAG	2	6	49638	49643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011260	AGC	2	6	49645	49650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011260	TAA	2	6	49660	49665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011260	GGT	2	6	49696	49701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011260	AAG	2	6	49706	49711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011260	CTA	2	6	49731	49736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011260	GTAA	2	8	49767	49774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011260	AT	3	6	49784	49789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011260	GCA	2	6	49852	49857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011260	ATTGCT	2	12	49861	49872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1013	NC_011260	AAAG	2	8	49911	49918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011260	AGG	2	6	49932	49937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011260	TGA	2	6	49986	49991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011260	CAAT	2	8	50009	50016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011260	ATAA	2	8	50035	50042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011260	AGG	2	6	50115	50120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011260	GA	3	6	50132	50137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011260	TAA	2	6	50171	50176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011260	TATAA	2	10	50181	50190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011260	AG	3	6	50208	50213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011260	CT	3	6	50223	50228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_011260	T	6	6	50228	50233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011260	T	8	8	50255	50262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011260	AGA	2	6	50275	50280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011260	A	8	8	50290	50297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011260	AGG	2	6	50300	50305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011260	GAT	2	6	50337	50342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011260	TGA	2	6	50360	50365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011260	ATG	2	6	50368	50373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011260	TAG	2	6	50375	50380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011260	TGG	2	6	50381	50386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011260	AGG	3	9	50432	50440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011260	ATG	2	6	50466	50471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011260	AG	3	6	50489	50494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011260	AGA	2	6	50560	50565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011260	ATT	2	6	50578	50583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011260	A	7	7	50639	50645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011260	AGGT	2	8	50650	50657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011260	GAA	2	6	50670	50675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011260	AGGT	2	8	50767	50774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011260	GTA	2	6	50784	50789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011260	GCA	2	6	50796	50801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011260	AGC	2	6	50819	50824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011260	A	6	6	50841	50846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011260	ATA	2	6	50944	50949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011260	AGGA	2	8	50950	50957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011260	AGC	2	6	50969	50974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011260	AGC	2	6	50990	50995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011260	AGC	3	9	51008	51016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011260	ATC	2	6	51023	51028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011260	AGGAGA	2	12	51068	51079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011260	AGC	2	6	51095	51100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011260	AGG	2	6	51140	51145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011260	AGTG	2	8	51188	51195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011260	GGT	2	6	51225	51230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011260	GCT	2	6	51237	51242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011260	AATGAT	2	12	51243	51254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011260	GAT	3	9	51252	51260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011260	AGT	2	6	51263	51268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011260	TAAA	2	8	51292	51299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011260	TAG	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011260	AGA	2	6	51314	51319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011260	CAAAA	2	10	51358	51367	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_011260	A	6	6	51364	51369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011260	A	7	7	51389	51395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011260	AATAA	2	10	51403	51412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011260	AGA	2	6	51445	51450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011260	TAGTT	2	10	51463	51472	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011260	CTT	2	6	51476	51481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011260	T	6	6	51480	51485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011260	AAAG	2	8	51491	51498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011260	AAG	2	6	51501	51506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011260	A	7	7	51519	51525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011260	AAGA	2	8	51637	51644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011260	GTTAAA	2	12	51727	51738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011260	TAA	2	6	51742	51747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011260	TAA	2	6	51788	51793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011260	TTA	2	6	51805	51810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011260	TGTCT	2	10	51821	51830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_011260	ATTAAA	2	12	51850	51861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011260	TA	3	6	51881	51886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011260	TA	4	8	51890	51897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011260	A	6	6	51897	51902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011260	GAA	2	6	51917	51922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011260	TTA	2	6	51960	51965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011260	T	7	7	52040	52046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011260	ATA	2	6	52054	52059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011260	GTAT	2	8	52099	52106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011260	AAGAA	2	10	52128	52137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011260	ATTAG	2	10	52144	52153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011260	TAG	2	6	52157	52162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011260	ATT	2	6	52173	52178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011260	TAT	2	6	52207	52212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011260	TAA	2	6	52237	52242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011260	TTAC	2	8	52278	52285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_011260	GAA	2	6	52363	52368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011260	AATA	2	8	52375	52382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011260	TAG	2	6	52396	52401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011260	T	6	6	52421	52426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011260	TA	3	6	52445	52450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011260	AAT	2	6	52451	52456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011260	T	8	8	52493	52500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011260	AGA	2	6	52525	52530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011260	ATTT	2	8	52612	52619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011260	ATTAT	2	10	52622	52631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011260	TCA	2	6	52655	52660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011260	T	7	7	52661	52667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011260	T	6	6	52677	52682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011260	A	6	6	52683	52688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011260	T	7	7	52689	52695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011260	TAAA	2	8	52709	52716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011260	A	6	6	52732	52737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011260	T	7	7	52752	52758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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