MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	TATT	2	8	1793	1800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011259	ACTT	2	8	2813	2820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011259	AAGA	2	8	3061	3068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011259	ATGT	2	8	3302	3309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011259	AATT	2	8	6236	6243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011259	TTGT	2	8	7685	7692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011259	AAAT	2	8	8071	8078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011259	TTAA	2	8	8177	8184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011259	AGAT	2	8	8189	8196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011259	ATTA	2	8	8203	8210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011259	TTTA	2	8	8268	8275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011259	TTGT	2	8	8838	8845	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011259	TTTA	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011259	AATT	2	8	10482	10489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011259	ATAA	2	8	10542	10549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011259	TTAT	2	8	10607	10614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011259	TATT	3	12	10619	10630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011259	ATTA	2	8	10637	10644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011259	TGCT	2	8	11322	11329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011259	AAAG	2	8	11524	11531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011259	ATTA	2	8	11558	11565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011259	GTTT	2	8	11676	11683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011259	ATTT	2	8	13257	13264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011259	GAAG	2	8	13517	13524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011259	AAAG	2	8	13631	13638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011259	AAAG	2	8	14060	14067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011259	TAAT	2	8	14309	14316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011259	TAAA	2	8	15215	15222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011259	ACAA	2	8	15330	15337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011259	TGAG	2	8	15794	15801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011259	TAAG	2	8	16027	16034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011259	AAGT	2	8	16295	16302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011259	AGTG	2	8	16317	16324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011259	AAAG	2	8	16470	16477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011259	AAGG	2	8	16519	16526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011259	TTTG	3	12	18301	18312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011259	TGTT	2	8	18483	18490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011259	TAGG	2	8	18615	18622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011259	TTAT	2	8	19863	19870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011259	AATT	2	8	21061	21068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011259	TTAG	2	8	21080	21087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011259	TCAT	3	12	21151	21162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011259	TAAA	2	8	21214	21221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011259	CTTT	2	8	21638	21645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011259	GAGG	2	8	21798	21805	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011259	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011259	AAAT	2	8	22131	22138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011259	GTAT	2	8	22229	22236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011259	AATA	2	8	22396	22403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011259	AAAT	2	8	22499	22506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011259	GTAA	2	8	22573	22580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011259	ATTT	2	8	22732	22739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011259	TAAA	2	8	22831	22838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.