MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl37

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011258	TTAA	2	8	677	684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011258	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011258	TAAA	2	8	945	952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011258	AAGG	2	8	1056	1063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011258	ACAA	2	8	2206	2213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011258	TAGT	2	8	3808	3815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011258	AAGT	2	8	3837	3844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011258	TGAT	2	8	4104	4111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011258	TAAA	2	8	4289	4296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011258	ATTT	2	8	4349	4356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011258	TATT	2	8	4497	4504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011258	ATTA	2	8	5147	5154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011258	AAAC	2	8	5715	5722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011258	TTGT	2	8	5789	5796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011258	TCTT	2	8	5889	5896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011258	ATTA	2	8	7187	7194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011258	ATTA	2	8	8044	8051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011258	ATTT	2	8	8243	8250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011258	TTTA	2	8	9365	9372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011258	TGAT	2	8	12104	12111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011258	AATT	2	8	12119	12126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011258	TAAA	2	8	12150	12157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011258	TATG	2	8	12345	12352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011258	TTTG	2	8	12449	12456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011258	CTTT	2	8	12667	12674	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011258	CCTT	2	8	12802	12809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011258	TCCT	2	8	12824	12831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011258	TCCT	2	8	12953	12960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011258	CAAA	2	8	13040	13047	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011258	AATA	2	8	13054	13061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011258	TAAA	2	8	13104	13111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011258	CTTC	2	8	14206	14213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011258	CTAT	2	8	14271	14278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011258	AGTA	2	8	14515	14522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011258	ATCA	2	8	14526	14533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011258	TGAA	2	8	14614	14621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011258	AGCA	2	8	15869	15876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011258	AAAT	2	8	15892	15899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011258	CTAA	2	8	15981	15988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011258	TCAT	2	8	16658	16665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011258	ATTT	2	8	16804	16811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011258	AAAC	2	8	17098	17105	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011258	ATTT	2	8	17282	17289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011258	ATAA	2	8	17801	17808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011258	TTTA	2	8	18101	18108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011258	ATTT	2	8	20261	20268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011258	GAAA	2	8	21296	21303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011258	ATTC	2	8	22785	22792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011258	TTTG	2	8	22797	22804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011258	TTAT	2	8	23731	23738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011258	ATTC	2	8	23740	23747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011258	TCTT	2	8	23758	23765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011258	AATT	2	8	24982	24989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011258	AAAC	2	8	25123	25130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011258	AAGA	2	8	25183	25190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011258	GTAA	2	8	25904	25911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011258	TAAA	2	8	26153	26160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011258	TAAA	2	8	26336	26343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011258	AAAG	2	8	26622	26629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011258	GAGT	2	8	27071	27078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011258	TAAA	2	8	27083	27090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011258	AATA	2	8	29378	29385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011258	AATT	2	8	30029	30036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011258	TTAG	2	8	30093	30100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011258	AGTA	2	8	30518	30525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011258	TAAA	2	8	30654	30661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011258	AATT	2	8	31001	31008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011258	TAAT	2	8	31034	31041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011258	TGAT	2	8	31301	31308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011258	ATGG	2	8	31327	31334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011258	TAAA	2	8	31680	31687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011258	AAAG	2	8	32037	32044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011258	AGAA	2	8	32730	32737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011258	GAAG	2	8	32976	32983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011258	TTAA	2	8	33366	33373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011258	TGAG	2	8	33698	33705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011258	GTAA	2	8	34151	34158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011258	AAAG	2	8	34295	34302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011258	CAAT	2	8	34393	34400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011258	ATAA	2	8	34419	34426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011258	AGGT	2	8	35034	35041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011258	AGGT	2	8	35151	35158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011258	AGGA	2	8	35334	35341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011258	AGTG	2	8	35572	35579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011258	TAAA	2	8	35676	35683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011258	AAAG	2	8	35875	35882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011258	AAGA	2	8	36021	36028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011258	GTAT	2	8	36483	36490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011258	TTAC	2	8	36662	36669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011258	AATA	2	8	36759	36766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.