MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 411

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011253	ATA	2	6	2	7	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011253	ATT	2	6	40	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011253	AAG	2	6	64	69	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011253	ACA	2	6	115	120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011253	TAA	2	6	347	352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011253	ATA	2	6	930	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011253	ATT	2	6	943	948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011253	TAA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011253	CAA	3	9	978	986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011253	ATA	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011253	TTA	2	6	1036	1041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011253	ATT	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011253	ACC	2	6	1418	1423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011253	ATC	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011253	TAC	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011253	TTA	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011253	AAG	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011253	TAA	2	6	1638	1643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011253	TAT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011253	TGT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011253	TAA	2	6	2075	2080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011253	CAA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011253	AAT	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011253	ATA	2	6	2219	2224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011253	TAA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011253	AAC	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011253	TTC	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011253	TTG	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011253	TTA	2	6	2557	2562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011253	GAT	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011253	ATC	2	6	2768	2773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011253	TAT	2	6	2794	2799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011253	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011253	TAT	2	6	3023	3028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011253	TTA	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011253	TAC	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011253	TAA	2	6	3118	3123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011253	CCA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011253	TTA	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011253	ATT	2	6	3276	3281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011253	TTA	2	6	3295	3300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011253	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011253	ATT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011253	GTT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011253	TTA	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011253	ATT	2	6	3599	3604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011253	CCA	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011253	CAC	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011253	CAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011253	CAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011253	CTT	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011253	TCT	2	6	3979	3984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011253	CTA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011253	CAC	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011253	TAC	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011253	CTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011253	AAC	2	6	4147	4152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011253	TAG	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011253	TAC	3	9	4221	4229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011253	AAT	2	6	4230	4235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011253	AAT	3	9	4324	4332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011253	CTC	2	6	4379	4384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011253	CTT	2	6	4530	4535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011253	TAT	2	6	4654	4659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011253	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011253	CAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011253	AAT	2	6	4814	4819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011253	TAA	2	6	4825	4830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011253	CAC	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011253	TAT	2	6	4941	4946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011253	CCA	3	9	4971	4979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011253	GAT	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011253	ATT	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011253	TTA	2	6	5023	5028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011253	CAT	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011253	CCT	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011253	AGC	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011253	ATC	2	6	5369	5374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011253	AGT	2	6	5387	5392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011253	CAT	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011253	ATC	2	6	5456	5461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011253	CTT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011253	CTA	2	6	5500	5505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011253	ACC	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011253	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011253	CTC	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_011253	GCA	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011253	TTA	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011253	CTA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011253	CTA	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011253	ACT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011253	TAA	2	6	6014	6019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011253	CAC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011253	ATT	2	6	6134	6139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011253	TAA	2	6	6319	6324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011253	TTA	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011253	CTT	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011253	TTA	2	6	6381	6386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011253	TAC	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011253	CAG	2	6	6457	6462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011253	ACT	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011253	CTT	2	6	6536	6541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011253	CTT	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011253	TTG	2	6	6653	6658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011253	ACC	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011253	AGC	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011253	AGC	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011253	GAA	2	6	6705	6710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011253	GCA	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011253	AAT	2	6	6794	6799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011253	AGA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011253	ATC	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011253	CAG	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011253	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011253	TCT	2	6	7054	7059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011253	CAA	2	6	7070	7075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011253	CAA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011253	TAC	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011253	TTC	2	6	7284	7289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011253	TAC	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011253	CTT	2	6	7337	7342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011253	TAA	2	6	7365	7370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011253	TAC	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011253	TTA	3	9	7496	7504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011253	AGT	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011253	ATA	2	6	7634	7639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011253	TAA	2	6	7660	7665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011253	ATT	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011253	TAA	2	6	7784	7789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011253	TAT	3	9	7907	7915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011253	TAT	2	6	7942	7947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011253	TTA	2	6	8061	8066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011253	TAG	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011253	AAT	2	6	8344	8349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011253	ATT	2	6	8368	8373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011253	ATT	2	6	11145	11150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011253	TAG	2	6	11186	11191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011253	TGA	2	6	11216	11221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011253	GAA	2	6	11335	11340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011253	GAA	2	6	11399	11404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011253	TGT	2	6	11499	11504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011253	TGA	2	6	11511	11516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011253	GTA	2	6	11657	11662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011253	ATT	2	6	11668	11673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011253	TTG	2	6	11711	11716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_011253	GAA	2	6	11767	11772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_011253	TGC	2	6	12009	12014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011253	CTG	2	6	12017	12022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011253	ATG	3	9	12026	12034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011253	TAA	2	6	12066	12071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011253	CTA	2	6	12086	12091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_011253	TAA	2	6	15284	15289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_011253	GAG	2	6	23861	23866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011253	TGA	3	9	23937	23945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_011253	GAT	2	6	24115	24120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.