MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011253	GGAT	2	8	23886	23893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011253	TGA	3	9	23937	23945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011253	GAAGG	2	10	23981	23990	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011253	T	6	6	24013	24018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011253	TTA	2	6	24104	24109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011253	GAT	2	6	24115	24120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011253	GTA	2	6	24320	24325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011253	ATA	2	6	24338	24343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011253	CTG	2	6	24344	24349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011253	TGC	2	6	24351	24356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011253	AGT	2	6	24357	24362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011253	GAA	2	6	24367	24372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011253	GAA	2	6	24394	24399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011253	TGG	2	6	24459	24464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011253	GAG	2	6	24479	24484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011253	CTG	2	6	24500	24505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011253	TGC	3	9	24519	24527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011253	TGGTGC	2	12	24528	24539	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_011253	AGCT	2	8	24548	24555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_011253	TGAT	2	8	24587	24594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011253	A	6	6	24600	24605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011253	ATGCTA	2	12	24632	24643	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
523	NC_011253	CTA	2	6	24704	24709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_011253	AGC	3	9	24720	24728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_011253	TGC	3	9	24771	24779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011253	CAG	2	6	24803	24808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011253	TAA	2	6	24845	24850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011253	AAG	2	6	24887	24892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011253	TAAA	2	8	24969	24976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011253	GTT	2	6	25035	25040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011253	T	6	6	25045	25050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011253	ATTG	2	8	25075	25082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011253	T	6	6	25083	25088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011253	T	6	6	25121	25126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011253	T	7	7	25136	25142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011253	CAA	2	6	25175	25180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_011253	AGGAG	2	10	25231	25240	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011253	AG	3	6	25247	25252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011253	AAT	2	6	25258	25263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011253	GAT	3	9	25270	25278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011253	TGA	2	6	25281	25286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011253	GAG	2	6	25315	25320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011253	AGC	2	6	25325	25330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011253	AGG	3	9	25331	25339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011253	CTG	2	6	25371	25376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011253	GAAA	2	8	25455	25462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011253	CAA	2	6	25473	25478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011253	GGT	2	6	25503	25508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011253	A	6	6	25585	25590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011253	TGC	2	6	25612	25617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_011253	CAG	2	6	25678	25683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011253	TCT	2	6	26253	26258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011253	ATA	2	6	26265	26270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011253	T	7	7	26279	26285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011253	T	6	6	26290	26295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011253	ATAA	2	8	26303	26310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011253	ATT	2	6	26321	26326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011253	T	6	6	26417	26422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011253	TA	3	6	26429	26434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011253	AAT	2	6	26435	26440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011253	AGA	2	6	26446	26451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011253	AAG	2	6	26544	26549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011253	TAT	2	6	26563	26568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011253	AT	3	6	26567	26572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011253	TGA	2	6	26573	26578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011253	A	7	7	26709	26715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011253	A	6	6	26747	26752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011253	AGT	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011253	TTA	2	6	26837	26842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011253	A	6	6	26875	26880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011253	GCT	2	6	26893	26898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011253	GGT	2	6	26899	26904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011253	TGC	2	6	26937	26942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011253	A	6	6	27009	27014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011253	GAT	3	9	27046	27054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011253	GTT	2	6	27072	27077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011253	AT	3	6	27155	27160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011253	CAG	2	6	27191	27196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011253	AGG	2	6	27297	27302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011253	GGT	2	6	27328	27333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011253	CTA	2	6	27341	27346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011253	CAAT	2	8	27371	27378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_011253	TAA	2	6	27419	27424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011253	A	6	6	27456	27461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011253	AAG	2	6	27491	27496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011253	AGTA	2	8	27530	27537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011253	ATA	2	6	27562	27567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011253	ATA	2	6	27583	27588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011253	AATT	2	8	27596	27603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011253	AAT	2	6	27610	27615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011253	CTT	2	6	27628	27633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011253	CT	3	6	27637	27642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_011253	T	7	7	27642	27648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011253	TAT	2	6	27657	27662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011253	TA	3	6	27669	27674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011253	AAT	2	6	27675	27680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011253	ATT	3	9	27691	27699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011253	T	8	8	27706	27713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011253	TAG	2	6	27721	27726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011253	AAAC	2	8	27737	27744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_011253	AGG	2	6	27746	27751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011253	GAA	2	6	27762	27767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011253	TAG	2	6	27776	27781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011253	AG	3	6	27787	27792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011253	AAGA	2	8	27797	27804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011253	GA	3	6	27811	27816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011253	TAA	2	6	27836	27841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011253	AGT	2	6	28463	28468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011253	AT	3	6	28487	28492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011253	T	6	6	28502	28507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011253	GTAA	2	8	28517	28524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011253	TAA	2	6	28540	28545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011253	GTTTTT	2	12	28574	28585	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011253	TTA	2	6	28586	28591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011253	TGA	2	6	28651	28656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011253	AGG	2	6	28668	28673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011253	GGT	2	6	28699	28704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011253	TAG	2	6	28719	28724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011253	TGA	2	6	28725	28730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011253	TAG	2	6	28748	28753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011253	TAAA	2	8	28766	28773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011253	TTACT	2	10	28777	28786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
623	NC_011253	TCT	2	6	28809	28814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011253	TCT	2	6	28823	28828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011253	ACT	2	6	28829	28834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011253	AAT	2	6	28838	28843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011253	TAG	2	6	28868	28873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011253	TAAA	2	8	28949	28956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011253	AGA	2	6	28964	28969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011253	TAA	2	6	28989	28994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011253	CAG	2	6	29021	29026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011253	AAG	2	6	29069	29074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011253	ACT	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011253	AGG	2	6	29166	29171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011253	AAG	2	6	29176	29181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011253	GCA	2	6	29215	29220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011253	AAAG	2	8	29235	29242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011253	CTA	2	6	29276	29281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011253	GCAAGT	2	12	29299	29310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
640	NC_011253	AGC	2	6	29391	29396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_011253	GAG	2	6	29440	29445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_011253	AGA	2	6	29472	29477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_011253	AT	3	6	32318	32323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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