MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	AAAG	2	8	77	84	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011252	TTAA	2	8	629	636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011252	ATCC	2	8	688	695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011252	ATCA	2	8	743	750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011252	ATTA	2	8	1110	1117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011252	CATA	2	8	1491	1498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011252	CAAA	2	8	1510	1517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011252	CATA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011252	ATTA	2	8	1623	1630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011252	TCAT	2	8	3335	3342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011252	TAAA	2	8	3462	3469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011252	TAAT	2	8	3510	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011252	ATTA	2	8	4092	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011252	TAAT	2	8	4591	4598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011252	TAAT	2	8	4892	4899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011252	ATCA	2	8	5036	5043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011252	TGAA	2	8	7612	7619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011252	TATT	2	8	7656	7663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011252	CAAA	2	8	8166	8173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011252	TAGA	2	8	8174	8181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011252	AGCA	2	8	8271	8278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011252	TAAA	2	8	8921	8928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011252	AATC	2	8	8960	8967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011252	ATTA	2	8	10272	10279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011252	AATT	2	8	10280	10287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011252	GATA	2	8	10529	10536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011252	CATA	2	8	10770	10777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011252	ATTT	2	8	10953	10960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011252	AGGG	2	8	11040	11047	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011252	TAAA	2	8	13535	13542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011252	TTAA	2	8	15869	15876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011252	TTAA	2	8	18832	18839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011252	TTTA	2	8	18866	18873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011252	TAAA	3	12	19148	19159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011252	AGTA	2	8	19903	19910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011252	TTAG	2	8	19967	19974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011252	TATG	2	8	20047	20054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011252	TAAA	2	8	20184	20191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011252	AGTA	2	8	21735	21742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011252	ATAA	2	8	21748	21755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011252	TGAT	2	8	21960	21967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011252	ATTT	2	8	22016	22023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011252	ATTT	2	8	22658	22665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011252	TAAA	2	8	22758	22765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.