MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl36

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011249	TA	3	6	590	595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011249	AT	4	8	664	671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011249	GT	3	6	917	922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011249	GA	3	6	1001	1006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011249	TA	5	10	2147	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011249	CT	3	6	2439	2444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011249	AT	3	6	2722	2727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011249	TC	3	6	2755	2760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011249	AT	3	6	3236	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011249	TA	3	6	3995	4000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011249	CT	4	8	4044	4051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011249	TA	4	8	4093	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011249	TC	3	6	4371	4376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011249	CT	3	6	5414	5419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011249	CT	4	8	5423	5430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011249	CT	3	6	5439	5444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011249	TA	3	6	5548	5553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011249	AT	3	6	5676	5681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011249	TC	3	6	5712	5717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011249	AT	3	6	6019	6024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011249	TA	3	6	6059	6064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011249	TA	3	6	7255	7260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011249	AT	3	6	7337	7342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011249	AT	3	6	7750	7755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011249	TC	3	6	8464	8469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011249	TA	3	6	11419	11424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011249	TA	3	6	11435	11440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011249	AT	3	6	13729	13734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011249	TG	3	6	14049	14054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011249	AT	3	6	14393	14398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011249	TA	4	8	15015	15022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011249	TC	3	6	15147	15152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011249	AT	3	6	15271	15276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011249	TA	3	6	15345	15350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011249	TA	3	6	15519	15524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011249	TG	3	6	15574	15579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011249	TG	3	6	18970	18975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011249	AT	3	6	19108	19113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011249	TA	3	6	19154	19159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011249	GA	3	6	19300	19305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011249	TA	3	6	20371	20376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011249	TA	4	8	20396	20403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011249	AT	3	6	20405	20410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011249	TA	3	6	20842	20847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011249	AT	4	8	21178	21185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011249	AT	3	6	21287	21292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011249	TA	3	6	22411	22416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011249	AT	3	6	23096	23101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011249	AG	3	6	23171	23176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011249	AT	4	8	23373	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011249	GT	3	6	23740	23745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011249	TA	3	6	24893	24898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011249	AT	3	6	24932	24937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011249	TA	3	6	25106	25111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011249	TA	3	6	25446	25451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011249	TA	3	6	25455	25460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011249	GT	3	6	26173	26178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011249	AT	3	6	27017	27022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011249	AC	3	6	27067	27072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011249	AT	5	10	27073	27082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011249	AG	3	6	27315	27320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011249	GT	3	6	27992	27997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011249	AT	3	6	28008	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011249	AT	3	6	28145	28150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011249	TG	3	6	28200	28205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011249	TA	3	6	28322	28327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011249	AT	3	6	29709	29714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011249	TA	3	6	31140	31145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011249	AG	3	6	31177	31182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011249	CT	3	6	31191	31196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011249	TA	3	6	31223	31228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011249	TA	3	6	31238	31243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011249	AG	3	6	31362	31367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011249	GA	4	8	31375	31382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011249	AT	3	6	32299	32304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011249	TA	3	6	32318	32323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011249	CT	3	6	32378	32383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011249	TA	3	6	32410	32415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011249	GA	3	6	32813	32818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011249	AT	3	6	32965	32970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011249	GA	3	6	33301	33306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011249	AG	3	6	34173	34178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011249	GT	3	6	34559	34564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011249	AT	3	6	34574	34579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.