MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	ATTTT	2	10	20	29	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011247	GCTAT	2	10	215	224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011247	TAATA	2	10	10596	10605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011247	ATTTA	2	10	18750	18759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011247	ATTTA	2	10	19717	19726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011247	ATTTA	2	10	20694	20703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011247	TTTAA	2	10	26615	26624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011247	ATATA	2	10	26881	26890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011247	TTAAA	2	10	27420	27429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011247	ATATT	2	10	28694	28703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011247	TTTCA	2	10	29704	29713	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011247	ATAAA	2	10	29723	29732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011247	TTTCA	2	10	31716	31725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011247	AAAAT	2	10	31737	31746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011247	TTTCA	2	10	33707	33716	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011247	AAAAT	2	10	33728	33737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011247	ATAAA	2	10	33892	33901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011247	AAATA	2	10	39769	39778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011247	ATTAT	2	10	43387	43396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011247	ATTAT	2	10	46059	46068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011247	TTTAA	2	10	51077	51086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011247	TTACA	2	10	52025	52034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011247	ATATA	2	10	52143	52152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011247	AATAT	2	10	54942	54951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011247	AAATA	2	10	55204	55213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011247	TTAAA	2	10	56283	56292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011247	TAAAA	2	10	56389	56398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011247	GTATG	2	10	58035	58044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011247	TTAAA	2	10	59058	59067	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011247	TAAAG	2	10	60198	60207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011247	ATTAA	2	10	65848	65857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011247	TAATT	2	10	65874	65883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011247	ATACC	2	10	69550	69559	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011247	TATAA	2	10	69902	69911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011247	TTTAA	2	10	71396	71405	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011247	TATAA	2	10	74635	74644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011247	ATCAC	2	10	74672	74681	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011247	CAAAA	2	10	77533	77542	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011247	AATAT	2	10	78257	78266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011247	CTAAA	2	10	80380	80389	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011247	TATTT	2	10	80685	80694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011247	CAAAA	2	10	81022	81031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011247	ATTAA	2	10	82264	82273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011247	AATTT	2	10	85093	85102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011247	ATTTA	2	10	89929	89938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011247	TAAAT	2	10	89987	89996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011247	AAATT	2	10	92865	92874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011247	AAATT	2	10	94579	94588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011247	ATTAT	2	10	95776	95785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011247	TTAAC	2	10	103076	103085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011247	TAAAT	2	10	104894	104903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011247	TTAAT	2	10	106641	106650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011247	AAAAC	2	10	106751	106760	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011247	CAACA	2	10	106804	106813	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011247	AAATA	2	10	107435	107444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011247	ATTTA	2	10	107921	107930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011247	ATAAA	2	10	108014	108023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011247	TATAT	2	10	108921	108930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011247	TTAAA	2	10	109249	109258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011247	ATTAT	2	10	109289	109298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011247	TTAAA	2	10	110531	110540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011247	AAAAT	2	10	110573	110582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011247	ATAAA	2	10	111359	111368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011247	AAACA	2	10	111508	111517	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011247	TTATA	2	10	111960	111969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011247	TTATC	2	10	112529	112538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011247	AATAA	2	10	112591	112600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011247	AATAA	2	10	114070	114079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011247	GAAAA	2	10	114167	114176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011247	AAAAC	2	10	116869	116878	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011247	AAAAT	2	10	116929	116938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011247	AATAA	2	10	120611	120620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011247	AAATA	2	10	120621	120630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011247	ATTAA	2	10	124203	124212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011247	CTACA	2	10	124231	124240	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011247	AGATT	2	10	124553	124562	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011247	TTTTA	2	10	125551	125560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011247	TAATT	2	10	127564	127573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011247	TAATA	2	10	127780	127789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011247	CTTTA	2	10	137743	137752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011247	CTTTT	2	10	137939	137948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011247	TTTTG	2	10	138823	138832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011247	ATATA	2	10	141513	141522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011247	TTAAT	2	10	145258	145267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011247	TAAAT	2	10	145839	145848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011247	TTTTG	2	10	147917	147926	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011247	TTAAT	2	10	147983	147992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011247	ATAAG	2	10	153577	153586	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011247	ATTTT	2	10	155617	155626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011247	AATTT	2	10	161560	161569	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011247	TTTTA	2	10	162927	162936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011247	ATGAA	2	10	163130	163139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011247	TAAAT	2	10	163677	163686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.