MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	AT	3	6	1654	1659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011246	AT	3	6	1722	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011246	TA	3	6	3864	3869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011246	AT	3	6	3975	3980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011246	TA	4	8	3992	3999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011246	AT	3	6	4897	4902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011246	AT	3	6	6189	6194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011246	AT	3	6	6272	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011246	AT	3	6	7457	7462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011246	CT	3	6	7573	7578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011246	TA	3	6	8990	8995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011246	AT	3	6	10227	10232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011246	CA	3	6	10335	10340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011246	AT	3	6	10350	10355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011246	TA	3	6	10828	10833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011246	CA	3	6	11084	11089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011246	AT	3	6	12419	12424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011246	AT	3	6	12675	12680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011246	TG	3	6	12793	12798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011246	AT	3	6	12872	12877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011246	TA	3	6	13216	13221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011246	TA	3	6	14133	14138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011246	TA	3	6	15195	15200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011246	CA	3	6	15351	15356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011246	TA	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011246	TA	3	6	16540	16545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011246	TC	3	6	16672	16677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011246	AC	3	6	17557	17562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011246	CA	3	6	17706	17711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011246	AT	3	6	17941	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011246	AT	3	6	18215	18220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011246	TG	3	6	19476	19481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011246	TA	5	10	21522	21531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011246	AT	3	6	21533	21538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011246	TA	3	6	21659	21664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011246	TA	3	6	21695	21700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011246	AT	3	6	21718	21723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011246	AT	3	6	21775	21780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011246	TA	3	6	21810	21815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011246	AT	3	6	22034	22039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011246	AC	3	6	22351	22356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011246	TA	3	6	22513	22518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011246	TA	5	10	23607	23616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011246	AT	3	6	23618	23623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011246	AT	3	6	23805	23810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011246	AT	3	6	23834	23839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011246	AT	3	6	23895	23900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011246	AT	3	6	24346	24351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011246	TA	3	6	24669	24674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011246	AT	3	6	24845	24850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011246	TA	4	8	24989	24996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011246	AT	3	6	25931	25936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011246	AT	3	6	26976	26981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011246	AT	3	6	29554	29559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011246	CA	3	6	29901	29906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011246	TA	3	6	29950	29955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011246	AT	4	8	30065	30072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011246	TA	3	6	30196	30201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011246	TC	3	6	30277	30282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011246	CT	3	6	30961	30966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011246	TA	3	6	31360	31365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011246	TA	3	6	33368	33373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011246	AT	4	8	33398	33405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011246	TA	4	8	33407	33414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011246	TC	4	8	34861	34868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011246	TA	3	6	35869	35874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011246	TC	3	6	36270	36275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011246	TC	3	6	36326	36331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011246	AC	3	6	36716	36721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011246	TA	5	10	36817	36826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011246	AT	3	6	36828	36833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011246	TA	3	6	37473	37478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011246	AT	3	6	39257	39262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011246	AT	3	6	42125	42130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011246	AT	3	6	42478	42483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011246	TA	3	6	42784	42789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011246	AT	3	6	42870	42875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011246	TA	3	6	44062	44067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011246	AT	3	6	45985	45990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011246	TA	3	6	47090	47095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011246	TA	3	6	47100	47105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011246	AT	3	6	51587	51592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011246	AT	3	6	54608	54613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011246	AC	3	6	55425	55430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011246	CT	3	6	55592	55597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011246	AG	4	8	55607	55614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011246	AT	3	6	55793	55798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011246	AT	3	6	56057	56062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011246	CT	3	6	64556	64561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011246	TC	3	6	64676	64681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011246	AT	3	6	64970	64975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011246	CA	3	6	65063	65068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011246	GA	3	6	65691	65696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011246	TC	3	6	65774	65779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011246	TA	3	6	65986	65991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011246	AT	3	6	66255	66260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011246	TA	3	6	66410	66415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011246	AT	3	6	68257	68262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011246	TA	3	6	70890	70895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011246	AT	4	8	71019	71026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011246	AC	3	6	71578	71583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011246	TA	4	8	71760	71767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011246	AC	3	6	71864	71869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011246	CA	3	6	71903	71908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011246	AT	3	6	72097	72102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011246	AT	3	6	74128	74133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011246	TA	3	6	74257	74262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011246	GA	3	6	74277	74282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011246	TA	3	6	77771	77776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011246	AT	3	6	77789	77794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011246	AG	3	6	77981	77986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011246	TA	3	6	79009	79014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011246	TC	3	6	81449	81454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011246	TA	3	6	81580	81585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011246	AC	3	6	83694	83699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011246	TA	3	6	84225	84230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011246	TA	3	6	85227	85232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011246	AT	3	6	86505	86510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011246	AC	3	6	87447	87452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011246	AT	3	6	87457	87462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011246	TA	3	6	87668	87673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011246	AT	3	6	89849	89854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011246	GA	3	6	89946	89951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011246	AT	3	6	90095	90100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011246	AT	3	6	95001	95006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011246	CA	3	6	98180	98185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011246	TA	3	6	98361	98366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011246	TA	3	6	98516	98521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011246	AT	3	6	98741	98746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011246	AT	3	6	98998	99003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011246	AT	3	6	100410	100415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011246	TA	3	6	100457	100462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011246	CT	3	6	100477	100482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011246	TG	3	6	100485	100490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011246	AT	3	6	100536	100541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011246	AT	3	6	101890	101895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011246	TA	3	6	102235	102240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011246	GT	3	6	104555	104560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011246	AG	3	6	104688	104693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011246	AT	3	6	105193	105198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011246	TA	3	6	105328	105333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011246	GT	3	6	105443	105448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011246	TA	3	6	105471	105476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011246	TA	3	6	106100	106105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011246	TA	3	6	106119	106124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011246	AT	3	6	106846	106851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_011246	AT	4	8	107538	107545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011246	TA	3	6	109529	109534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011246	TG	3	6	109545	109550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011246	AT	3	6	109586	109591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011246	AT	4	8	109818	109825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011246	GA	3	6	110224	110229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011246	TC	3	6	110435	110440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_011246	TA	4	8	110533	110540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011246	AG	3	6	110723	110728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011246	GA	3	6	112718	112723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011246	AT	3	6	112828	112833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011246	TA	3	6	113729	113734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011246	TA	3	6	113843	113848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011246	TA	4	8	113889	113896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011246	AT	3	6	114837	114842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011246	AT	3	6	115061	115066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011246	AT	3	6	115312	115317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011246	TA	3	6	117156	117161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011246	TA	3	6	121242	121247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_011246	TA	3	6	123796	123801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.