MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	TTCAAT	2	12	11237	11248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011246	TCTTAT	2	12	12988	12999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011246	TCTTCA	2	12	17436	17447	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011246	TAACAT	2	12	17633	17644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011246	AAATTA	2	12	18024	18035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011246	TATTTT	2	12	18150	18161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011246	ATAAAA	2	12	19191	19202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011246	ATAAAA	2	12	23785	23796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011246	TATTTT	2	12	42989	43000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011246	ATTTAA	2	12	64989	65000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011246	TAAAAT	2	12	65324	65335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011246	TATACA	2	12	66590	66601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011246	ATTAAT	2	12	69482	69493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011246	ATTAAA	2	12	72154	72165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011246	TAAAAT	2	12	74157	74168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011246	GATGCA	2	12	78111	78122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011246	ACCTTA	2	12	83525	83536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011246	TTTTTA	2	12	94716	94727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011246	TATTAA	2	12	104267	104278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011246	TAAAGA	2	12	104976	104987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011246	ATATTT	2	12	105577	105588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011246	ATTCTA	2	12	107238	107249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011246	ATTTAG	2	12	109776	109787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011246	TAGGTA	2	12	112969	112980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011246	AAATTT	2	12	115351	115362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011246	ATTTAT	2	12	122688	122699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.