MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011244	ATCATT	2	12	1378	1389	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011244	ATGTTG	2	12	3876	3887	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011244	CATCAA	2	12	8213	8224	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011244	CAGCAT	2	12	9874	9885	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011244	TCCTTC	2	12	12145	12156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011244	ATCACC	2	12	12184	12195	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011244	AAAAAT	2	12	69814	69825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011244	TGGAAT	2	12	107645	107656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011244	TATAAT	2	12	110470	110481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011244	ACAATA	2	12	120071	120082	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011244	TTACTA	2	12	125003	125014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011244	CTTCAC	2	12	125795	125806	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011244	ACCAAT	2	12	140130	140141	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011244	AAATAA	2	12	160110	160121	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011244	ATATTT	2	12	165604	165615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011244	AATCAA	2	12	179206	179217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011244	TAAGAA	2	12	217231	217242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011244	ATAACA	2	12	243412	243423	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011244	AAATGT	2	12	257756	257767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011244	ACAAAA	2	12	257829	257840	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011244	AAAGGA	2	12	258752	258763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011244	AGAAAA	2	12	285929	285940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011244	ATTAAT	2	12	286470	286481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011244	AAACAT	2	12	327784	327795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011244	TAAAAT	2	12	349804	349815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011244	ATTGAA	2	12	359507	359518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011244	ATTATA	2	12	361984	361995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011244	ATCTTT	2	12	362247	362258	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011244	ATATTT	2	12	380692	380703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011244	TTTACA	2	12	380812	380823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011244	AAATTG	2	12	380858	380869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011244	TAACAA	2	12	381219	381230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011244	TATAAT	2	12	398417	398428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011244	CTAAAT	2	12	399849	399860	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011244	ATTTAT	2	12	435978	435989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011244	AAACAT	2	12	436412	436423	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011244	TTAAAA	2	12	437983	437994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011244	AAAAAT	2	12	448527	448538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011244	ATTAGT	2	12	455980	455991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011244	ATATTT	2	12	458472	458483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011244	TTCGCC	2	12	465300	465311	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011244	TTATTT	2	12	466027	466038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011244	TTATAT	2	12	467399	467410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011244	TATCAT	2	12	469176	469187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011244	TCAAAA	2	12	476449	476460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011244	GTATTT	2	12	504261	504272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011244	TTTTAA	2	12	504387	504398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011244	AGATAT	2	12	512577	512588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011244	TAATAT	2	12	514577	514588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011244	TAATTT	2	12	552190	552201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011244	GGTAAT	2	12	561570	561581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011244	TTATTT	2	12	569626	569637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011244	TATTTT	2	12	606664	606675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011244	TATATT	2	12	608885	608896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011244	TTAGTT	2	12	622807	622818	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011244	TTTTTG	2	12	673126	673137	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011244	ATTTCC	2	12	676441	676452	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011244	TTAAAA	2	12	694575	694586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011244	TATAAA	2	12	757636	757647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011244	GGTGTT	2	12	793302	793313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011244	AATTCT	2	12	803877	803888	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011244	AGTATG	2	12	813730	813741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011244	TTGATT	2	12	815454	815465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011244	AGATTT	2	12	815515	815526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011244	TAATTA	2	12	822507	822518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011244	ATTTAA	2	12	840596	840607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011244	TTGATT	2	12	866163	866174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011244	TTATTT	2	12	884298	884309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011244	GATGGT	2	12	904972	904983	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011244	TTGAAA	2	12	905215	905226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.