MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011244	CCTA	2	8	175	182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011244	ATAC	2	8	519	526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011244	GAAA	2	8	650	657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011244	AATA	2	8	662	669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011244	TTCA	2	8	818	825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011244	TCTT	2	8	1460	1467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011244	ACTA	2	8	1900	1907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011244	ATTT	2	8	1908	1915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011244	TAAT	2	8	2143	2150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011244	ATCT	2	8	2157	2164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011244	TTTA	2	8	3325	3332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011244	ATAC	2	8	3437	3444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011244	ATAA	2	8	3607	3614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011244	ACAA	2	8	3635	3642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011244	TAAA	2	8	3696	3703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011244	TCAT	2	8	4052	4059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011244	TTGC	2	8	4169	4176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011244	AAAT	2	8	4268	4275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011244	CTCC	2	8	4472	4479	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_011244	TTCT	2	8	4782	4789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011244	AATG	2	8	4885	4892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011244	ATTA	2	8	5092	5099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011244	TAAA	3	12	5188	5199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011244	ATTT	2	8	5418	5425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011244	ACGA	2	8	5719	5726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011244	TGAT	2	8	5765	5772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011244	TCCA	2	8	5893	5900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011244	AATT	2	8	5912	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011244	TTTC	2	8	6124	6131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011244	GATA	2	8	6187	6194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011244	TGCT	2	8	6564	6571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011244	CCTT	2	8	6630	6637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011244	CTTT	2	8	6698	6705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011244	TGAT	2	8	8166	8173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011244	ATTT	2	8	9123	9130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011244	CACT	2	8	9135	9142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011244	TCTT	2	8	9636	9643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011244	TTCT	2	8	10112	10119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011244	TTGT	2	8	11865	11872	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011244	CTTT	2	8	11908	11915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011244	TACC	2	8	12022	12029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011244	ATTT	2	8	12346	12353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011244	AATG	3	12	12377	12388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011244	ATTA	2	8	12551	12558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011244	ATTA	2	8	12760	12767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011244	ATTA	2	8	12885	12892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011244	ATTA	2	8	20299	20306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011244	TAAT	2	8	32892	32899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011244	AGAA	2	8	37473	37480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011244	TAAA	2	8	43392	43399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011244	TAAT	2	8	51709	51716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011244	TAAA	2	8	54817	54824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011244	AATA	2	8	57337	57344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011244	TACT	2	8	58314	58321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011244	AAAT	2	8	58905	58912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011244	AAAC	2	8	58924	58931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011244	TAAA	2	8	61093	61100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011244	AATT	2	8	65301	65308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011244	ATTA	2	8	68546	68553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011244	AAGC	2	8	74847	74854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011244	TTTA	2	8	74879	74886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011244	ATAA	2	8	92685	92692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011244	ATGA	2	8	106508	106515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011244	GTCT	2	8	106974	106981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011244	TTTC	2	8	107031	107038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011244	TTGC	2	8	107241	107248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011244	AATC	2	8	108235	108242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011244	AATT	2	8	125149	125156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011244	AAAT	2	8	125159	125166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011244	AATA	2	8	125170	125177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011244	TAAC	2	8	125203	125210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011244	CAAT	2	8	125214	125221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011244	TAAA	2	8	125336	125343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011244	ATTA	2	8	126343	126350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011244	TGGA	2	8	127733	127740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011244	GCTA	2	8	127832	127839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011244	TAAA	2	8	134796	134803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011244	CTTG	2	8	139786	139793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011244	ATTT	2	8	140285	140292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011244	TTAT	2	8	144134	144141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011244	AACA	2	8	150843	150850	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011244	ACAA	2	8	157996	158003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011244	ATAA	2	8	163395	163402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011244	TTAT	2	8	163429	163436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011244	TAAA	2	8	171097	171104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011244	TAAA	2	8	179849	179856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011244	ATCT	2	8	180059	180066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011244	TTAA	2	8	180363	180370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011244	ATTT	2	8	182460	182467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011244	ATAA	2	8	193781	193788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011244	TTTA	2	8	199563	199570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011244	ATAC	2	8	200875	200882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011244	TTAT	2	8	204675	204682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011244	ATTT	2	8	213566	213573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011244	ACTA	2	8	213673	213680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011244	CAAA	2	8	213805	213812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011244	ATAA	2	8	217156	217163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011244	ATTT	2	8	217216	217223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011244	TAAA	2	8	217258	217265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011244	ATTA	2	8	217274	217281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011244	ACAA	2	8	217314	217321	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011244	TTTA	2	8	217473	217480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011244	TTTC	2	8	232465	232472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011244	ATTT	2	8	241018	241025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011244	AATT	2	8	243333	243340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011244	AAAT	2	8	243367	243374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011244	ATTA	2	8	244175	244182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011244	AACA	2	8	257314	257321	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011244	TAAT	2	8	257350	257357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011244	AATC	2	8	257467	257474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011244	AATA	2	8	257689	257696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011244	TCAA	2	8	257714	257721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011244	GTTT	2	8	257843	257850	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011244	GTTA	2	8	257863	257870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011244	AATC	2	8	259401	259408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011244	GAAG	2	8	259672	259679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011244	ATTA	2	8	260272	260279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011244	AAAT	2	8	263130	263137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011244	TAAA	2	8	263151	263158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011244	ATTA	2	8	264499	264506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011244	ATCA	2	8	266608	266615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011244	TAAA	2	8	284679	284686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011244	AACA	2	8	284724	284731	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011244	TCAA	2	8	285038	285045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011244	TAAA	2	8	285075	285082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011244	CAAT	2	8	285129	285136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011244	AATT	2	8	285362	285369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011244	CAAA	2	8	285568	285575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011244	TAAC	2	8	285602	285609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011244	AAAC	2	8	285642	285649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011244	AAAG	2	8	285680	285687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011244	ATTT	2	8	285899	285906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011244	CAAA	2	8	286207	286214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011244	AAAC	2	8	286735	286742	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011244	AAAT	2	8	287045	287052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011244	TCTT	2	8	287236	287243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011244	TTTG	2	8	287525	287532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011244	ATTT	2	8	287558	287565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011244	TAAT	2	8	295629	295636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011244	TTTA	2	8	295662	295669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011244	CCCT	2	8	327575	327582	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_011244	TTCA	2	8	327593	327600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011244	TCAG	2	8	327945	327952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011244	ATAA	2	8	328399	328406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011244	CAAT	2	8	339927	339934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011244	AAAT	2	8	349793	349800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011244	TCAA	2	8	349879	349886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011244	AAAC	2	8	352695	352702	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011244	TTTA	3	12	358216	358227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011244	TCTT	2	8	358340	358347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011244	TAAA	2	8	358665	358672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011244	ATTA	2	8	358801	358808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011244	AGAA	2	8	358942	358949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011244	CAAC	2	8	359282	359289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_011244	AACA	2	8	359924	359931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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333	NC_011244	TTTA	2	8	895674	895681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_011244	TGTA	2	8	930179	930186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.