MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly

Total Repeats: 2113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011229	CTAA	2	8	890251	890258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_011229	TAT	2	6	890267	890272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_011229	TTA	2	6	890638	890643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_011229	AT	3	6	890656	890661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_011229	ATA	3	9	890670	890678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_011229	T	7	7	890684	890690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_011229	CAT	2	6	892562	892567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_011229	TAG	2	6	892575	892580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_011229	AAAG	2	8	892587	892594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_011229	AAAT	2	8	892595	892602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_011229	T	6	6	892616	892621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_011229	GTTA	2	8	894088	894095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_011229	ATA	2	6	894132	894137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_011229	TTTA	2	8	894138	894145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_011229	TA	6	12	899190	899201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_011229	CAA	2	6	899235	899240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_011229	ATT	2	6	903347	903352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_011229	T	7	7	904959	904965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_011229	TA	4	8	905004	905011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_011229	ATT	2	6	912909	912914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_011229	AATTA	2	10	912944	912953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_011229	ATA	2	6	912958	912963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_011229	ATT	2	6	912983	912988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_011229	TAA	2	6	914994	914999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_011229	GAG	2	6	915001	915006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_011229	TTTA	2	8	921306	921313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_011229	TA	3	6	921331	921336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_011229	A	6	6	921336	921341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_011229	TTTAAT	2	12	921359	921370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_011229	TA	3	6	921385	921390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_011229	T	6	6	921396	921401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_011229	AT	3	6	923596	923601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_011229	ATTT	2	8	923608	923615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_011229	TAT	2	6	923616	923621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_011229	TAT	2	6	923644	923649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_011229	T	6	6	923649	923654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_011229	T	6	6	923675	923680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_011229	TAT	2	6	923694	923699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_011229	TA	5	10	923706	923715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_011229	T	7	7	923739	923745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_011229	T	6	6	923750	923755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_011229	TAT	2	6	926023	926028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_011229	TAT	2	6	926035	926040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_011229	GA	3	6	926062	926067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_011229	GTATA	2	10	928476	928485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_011229	ATC	2	6	928490	928495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_011229	A	8	8	928502	928509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_011229	GATG	2	8	928538	928545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_011229	CATT	2	8	928567	928574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2050	NC_011229	TAT	2	6	928590	928595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_011229	ATT	2	6	928637	928642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_011229	T	7	7	928656	928662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_011229	TTC	2	6	928679	928684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_011229	TGTA	2	8	928735	928742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_011229	TAA	2	6	930098	930103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_011229	ACT	2	6	930132	930137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_011229	T	6	6	930191	930196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_011229	TTTG	2	8	930205	930212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_011229	ATG	2	6	930213	930218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_011229	TAA	2	6	930224	930229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_011229	AGT	2	6	930233	930238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2063	NC_011229	AAAT	2	8	930425	930432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_011229	TGTAC	2	10	930462	930471	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2065	NC_011229	GGA	2	6	930472	930477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_011229	TGG	2	6	930491	930496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_011229	TTA	2	6	930521	930526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_011229	CAG	2	6	930534	930539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2070	NC_011229	A	7	7	930605	930611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_011229	TGA	3	9	930648	930656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_011229	A	7	7	930660	930666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_011229	ATA	2	6	930684	930689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_011229	AATC	2	8	930731	930738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2075	NC_011229	T	6	6	930793	930798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2080	NC_011229	A	7	7	930950	930956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_011229	ATAA	2	8	930966	930973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_011229	GAAA	2	8	930982	930989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_011229	TAA	2	6	931028	931033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_011229	TA	3	6	931115	931120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2088	NC_011229	TTTTAA	2	12	931224	931235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2097	NC_011229	ATA	2	6	931395	931400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_011229	A	8	8	931405	931412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_011229	AATG	2	8	931427	931434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_011229	T	7	7	931457	931463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_011229	A	6	6	931469	931474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_011229	ATT	2	6	931476	931481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_011229	GA	3	6	931499	931504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_011229	AGA	2	6	931533	931538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_011229	AGT	2	6	931548	931553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_011229	AGA	2	6	931554	931559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_011229	GAA	2	6	931576	931581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_011229	A	6	6	931596	931601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_011229	AGA	2	6	931608	931613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_011229	A	7	7	931621	931627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_011229	A	9	9	931635	931643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_011229	A	7	7	931645	931651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_011229	TAA	3	9	931655	931663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.