MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 3

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011002	GCGCCG	2	12	68506	68517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011002	CGGGGC	2	12	69762	69773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011002	TCGGGC	2	12	75996	76007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011002	GACCGC	2	12	80878	80889	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011002	CGCCCG	2	12	164552	164563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011002	GGCTCG	2	12	167657	167668	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011002	TGCAAG	2	12	191174	191185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011002	CCTTGA	2	12	198372	198383	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011002	GCCGGC	2	12	200739	200750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011002	GTCAGC	2	12	257905	257916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011002	CGGGTT	2	12	273026	273037	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011002	TTCCGA	2	12	286850	286861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011002	CGGGAT	2	12	299131	299142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011002	TGCGGA	2	12	299194	299205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011002	GCGCGG	2	12	313026	313037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011002	TGCGGA	2	12	352796	352807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011002	TATGCG	2	12	357923	357934	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011002	TGTCAC	2	12	378809	378820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011002	TCGAAG	2	12	391043	391054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011002	CCGGGG	2	12	439278	439289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011002	TCCCGC	2	12	442303	442314	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011002	ACGACC	2	12	468354	468365	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011002	ACGAAT	2	12	500439	500450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011002	GCGATT	2	12	539849	539860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011002	CGACAC	2	12	543134	543145	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011002	GCCGCG	2	12	544546	544557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011002	GTGTCG	2	12	562245	562256	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011002	ATCGGT	2	12	566543	566554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011002	AGGCAC	2	12	598724	598735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011002	TCTGCC	2	12	607332	607343	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011002	TCGGGC	2	12	610554	610565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011002	CGAGCA	2	12	611419	611430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011002	AGCGCG	2	12	622301	622312	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011002	CGCGAT	2	12	642497	642508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011002	GCACCG	2	12	644902	644913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011002	CCGATT	2	12	669378	669389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011002	GGCGCC	2	12	684309	684320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011002	TAGCCG	2	12	706454	706465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011002	AGCGGC	2	12	706517	706528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011002	AACGCG	2	12	707991	708002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011002	GAGCCT	2	12	708636	708647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011002	ACGACC	2	12	709006	709017	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011002	GAACAC	2	12	719065	719076	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011002	GTCGAC	2	12	737769	737780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011002	GCCGTG	2	12	751590	751601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011002	TCGCCC	2	12	753778	753789	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011002	CGGACA	2	12	758926	758937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011002	GCACGC	2	12	838873	838884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011002	ATCGAT	2	12	841919	841930	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011002	GTCGGC	2	12	858570	858581	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011002	CGTTTT	2	12	859442	859453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.