MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 2

Total Repeats: 11705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011001	GCCGC	2	10	3145943	3145952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11502	NC_011001	CGT	2	6	3145960	3145965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_011001	CGT	3	9	3148043	3148051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_011001	AT	3	6	3148120	3148125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_011001	TG	3	6	3148134	3148139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_011001	GC	3	6	3148159	3148164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11507	NC_011001	TGT	2	6	3148176	3148181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_011001	TCC	2	6	3148213	3148218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_011001	C	6	6	3148246	3148251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11510	NC_011001	CG	4	8	3149730	3149737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11511	NC_011001	GCC	2	6	3149750	3149755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11512	NC_011001	TCG	2	6	3150958	3150963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_011001	GTCG	2	8	3150972	3150979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11514	NC_011001	GGCG	2	8	3152252	3152259	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11515	NC_011001	CAGG	2	8	3152285	3152292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11516	NC_011001	ATA	2	6	3152323	3152328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_011001	TGC	2	6	3152336	3152341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_011001	TGAA	2	8	3152342	3152349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_011001	GCC	2	6	3152362	3152367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11520	NC_011001	TTC	2	6	3152387	3152392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_011001	ATGA	2	8	3152889	3152896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_011001	CGGC	2	8	3152907	3152914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11523	NC_011001	GCCG	2	8	3152929	3152936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_011001	GTTCG	2	10	3154691	3154700	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11525	NC_011001	CG	3	6	3155891	3155896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_011001	GC	3	6	3155905	3155910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_011001	A	6	6	3155915	3155920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_011001	GTCG	2	8	3157160	3157167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_011001	CG	3	6	3157184	3157189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11530	NC_011001	CCG	3	9	3157190	3157198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11531	NC_011001	GC	3	6	3157214	3157219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_011001	GCC	2	6	3157237	3157242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11533	NC_011001	CCG	2	6	3157280	3157285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_011001	GGCC	2	8	3157293	3157300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11535	NC_011001	TTG	3	9	3157316	3157324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_011001	TGCT	2	8	3157330	3157337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11537	NC_011001	TGC	2	6	3157344	3157349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_011001	CGTG	2	8	3157351	3157358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11539	NC_011001	GTC	2	6	3160709	3160714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_011001	TGCCT	2	10	3160718	3160727	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11541	NC_011001	GCT	2	6	3160759	3160764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_011001	TCGT	2	8	3161622	3161629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11543	NC_011001	TGC	2	6	3161659	3161664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_011001	GAC	2	6	3161666	3161671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_011001	GCG	2	6	3161748	3161753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_011001	GC	3	6	3161799	3161804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11547	NC_011001	CGT	2	6	3161823	3161828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_011001	TGGA	2	8	3162359	3162366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_011001	CGT	2	6	3162396	3162401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_011001	CG	3	6	3162423	3162428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_011001	GCG	2	6	3162445	3162450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_011001	GGC	2	6	3163395	3163400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_011001	TCGCC	2	10	3166034	3166043	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11554	NC_011001	TG	3	6	3167094	3167099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_011001	AATC	2	8	3167104	3167111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11556	NC_011001	TCG	2	6	3167114	3167119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_011001	CG	4	8	3167118	3167125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11558	NC_011001	TCGT	2	8	3167127	3167134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_011001	GC	5	10	3167141	3167150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_011001	GCCG	2	8	3169069	3169076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11561	NC_011001	CGG	2	6	3169124	3169129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_011001	CGC	2	6	3169142	3169147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_011001	CGATAT	2	12	3170999	3171010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11564	NC_011001	TGG	2	6	3172531	3172536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_011001	ATT	2	6	3172571	3172576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_011001	CGG	2	6	3173245	3173250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_011001	GCG	2	6	3174346	3174351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_011001	CGC	2	6	3174358	3174363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11571	NC_011001	ATCGC	2	10	3174403	3174412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11572	NC_011001	T	7	7	3174416	3174422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11575	NC_011001	CGG	2	6	3178970	3178975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_011001	CG	3	6	3178977	3178982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11577	NC_011001	CCG	2	6	3178983	3178988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11578	NC_011001	AGG	2	6	3178998	3179003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11581	NC_011001	GCC	2	6	3179054	3179059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11588	NC_011001	GC	3	6	3181351	3181356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11589	NC_011001	TA	3	6	3181414	3181419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11596	NC_011001	TCC	2	6	3186097	3186102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11598	NC_011001	ATCG	2	8	3187145	3187152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11599	NC_011001	ACC	2	6	3187172	3187177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11601	NC_011001	GCC	2	6	3187206	3187211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11602	NC_011001	CG	3	6	3187243	3187248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_011001	GCC	2	6	3187249	3187254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_011001	TGG	2	6	3187259	3187264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11612	NC_011001	CCG	2	6	3193887	3193892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11613	NC_011001	CGCA	2	8	3194023	3194030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_011001	CG	3	6	3194035	3194040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11615	NC_011001	TCG	2	6	3194079	3194084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11622	NC_011001	CGC	3	9	3195913	3195921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11623	NC_011001	GGCCG	2	10	3195937	3195946	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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11628	NC_011001	CCCG	2	8	3198102	3198109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11629	NC_011001	CG	3	6	3198108	3198113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11631	NC_011001	CG	3	6	3199779	3199784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.