MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 6382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010816	GAC	2	6	1443527	1443532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_010816	TTG	2	6	1443711	1443716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_010816	GCAC	2	8	1444050	1444057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_010816	CA	3	6	1444098	1444103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_010816	CG	3	6	1444122	1444127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_010816	CGGC	2	8	1445008	1445015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_010816	ACCGGC	2	12	1445030	1445041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_010816	ATA	2	6	1445046	1445051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_010816	TCT	3	9	1450979	1450987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_010816	TCT	2	6	1451015	1451020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_010816	CTT	2	6	1451039	1451044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_010816	GAA	2	6	1451049	1451054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_010816	AAG	2	6	1451087	1451092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_010816	GTGA	2	8	1451157	1451164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_010816	GTT	2	6	1451191	1451196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_010816	CAT	2	6	1451217	1451222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_010816	A	7	7	1451250	1451256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_010816	CAAT	2	8	1451284	1451291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_010816	GCA	3	9	1451292	1451300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_010816	CAG	2	6	1451304	1451309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_010816	GCC	2	6	1451336	1451341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_010816	GAC	2	6	1451365	1451370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_010816	AC	3	6	1451911	1451916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_010816	A	6	6	1452010	1452015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_010816	TTGGC	2	10	1452116	1452125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3526	NC_010816	GTT	2	6	1452142	1452147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010816	CGT	2	6	1452148	1452153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_010816	GCT	2	6	1452245	1452250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_010816	CG	3	6	1452316	1452321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_010816	ACC	2	6	1452620	1452625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_010816	GCG	2	6	1452697	1452702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_010816	TCA	2	6	1452732	1452737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_010816	GGAA	2	8	1452812	1452819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_010816	CG	4	8	1454363	1454370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_010816	AGC	2	6	1454383	1454388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_010816	CTC	2	6	1454390	1454395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_010816	TGCC	2	8	1454469	1454476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_010816	TTTTC	2	10	1454478	1454487	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3539	NC_010816	AAAAG	2	10	1454504	1454513	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_010816	CGAT	2	8	1454741	1454748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_010816	CAC	2	6	1454805	1454810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_010816	ATT	2	6	1454821	1454826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_010816	TTG	2	6	1454835	1454840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_010816	GAA	2	6	1454861	1454866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010816	ATG	2	6	1454868	1454873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_010816	GAA	2	6	1456108	1456113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_010816	ATG	2	6	1456128	1456133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_010816	TCA	2	6	1456160	1456165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_010816	TAT	2	6	1456178	1456183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_010816	GGA	2	6	1457141	1457146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_010816	CCA	2	6	1458124	1458129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_010816	CAG	2	6	1458181	1458186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_010816	AG	3	6	1458287	1458292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_010816	GCC	2	6	1458985	1458990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_010816	GAA	2	6	1459029	1459034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_010816	ACA	2	6	1459156	1459161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_010816	CAT	2	6	1459162	1459167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_010816	GTT	2	6	1461276	1461281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_010816	AT	3	6	1461333	1461338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_010816	AAT	2	6	1461353	1461358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_010816	AGC	2	6	1461394	1461399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_010816	AGG	2	6	1461465	1461470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010816	CCA	2	6	1461826	1461831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_010816	C	7	7	1461834	1461840	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3565	NC_010816	CGG	2	6	1461860	1461865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_010816	AGG	2	6	1461901	1461906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_010816	CAA	2	6	1463190	1463195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_010816	ACC	2	6	1463241	1463246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_010816	TG	3	6	1464812	1464817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_010816	GTG	2	6	1464828	1464833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010816	GGC	2	6	1464835	1464840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_010816	CGC	2	6	1464844	1464849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_010816	AGGG	2	8	1464930	1464937	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_010816	CTTT	2	8	1466568	1466575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_010816	GAC	2	6	1466607	1466612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_010816	GGT	2	6	1466627	1466632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_010816	ACCC	2	8	1466642	1466649	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3578	NC_010816	CAGT	2	8	1466651	1466658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_010816	TG	3	6	1467271	1467276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_010816	TC	3	6	1467304	1467309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_010816	TCA	2	6	1467341	1467346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_010816	G	6	6	1467349	1467354	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_010816	CGG	2	6	1469284	1469289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_010816	CAG	2	6	1469326	1469331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_010816	AAT	2	6	1469404	1469409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_010816	AC	3	6	1472527	1472532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_010816	ATA	2	6	1472548	1472553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_010816	CCG	2	6	1472582	1472587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_010816	CAA	2	6	1473677	1473682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_010816	CGA	3	9	1473687	1473695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_010816	GCTGC	2	10	1473701	1473710	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3592	NC_010816	CCG	2	6	1473731	1473736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_010816	TCAT	2	8	1473769	1473776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_010816	CA	3	6	1473860	1473865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_010816	TGC	2	6	1473888	1473893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_010816	CAGCG	2	10	1473968	1473977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3597	NC_010816	GC	3	6	1473989	1473994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_010816	ACCA	2	8	1474010	1474017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_010816	AAG	2	6	1474047	1474052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_010816	A	6	6	1474077	1474082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_010816	CTT	2	6	1474158	1474163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_010816	TCG	2	6	1474168	1474173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_010816	AGG	2	6	1474248	1474253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_010816	GAA	2	6	1474330	1474335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_010816	ACA	2	6	1476574	1476579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_010816	TCC	2	6	1478551	1478556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_010816	TG	3	6	1478562	1478567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_010816	GCA	2	6	1478700	1478705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_010816	CTA	2	6	1478706	1478711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_010816	TTC	2	6	1478753	1478758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_010816	CAG	2	6	1478856	1478861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_010816	CGC	2	6	1480422	1480427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_010816	GAG	2	6	1480679	1480684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_010816	CCA	2	6	1481353	1481358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_010816	GTT	2	6	1481377	1481382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_010816	GTAA	2	8	1481440	1481447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_010816	AGG	2	6	1482611	1482616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_010816	TCG	2	6	1482621	1482626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_010816	TA	3	6	1482627	1482632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_010816	CTTG	2	8	1483235	1483242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_010816	TTAC	2	8	1483246	1483253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_010816	ATT	2	6	1483255	1483260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_010816	TTC	2	6	1484055	1484060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_010816	ACGCAA	2	12	1484087	1484098	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_010816	GTT	2	6	1484166	1484171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_010816	GGC	2	6	1484208	1484213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_010816	CATC	2	8	1484216	1484223	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_010816	CTT	3	9	1484309	1484317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_010816	CT	3	6	1484319	1484324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_010816	CCTTTT	2	12	1484355	1484366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_010816	GCA	2	6	1485849	1485854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3749	NC_010816	CTGC	2	8	1535474	1535481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3752	NC_010816	ACTGG	2	10	1536634	1536643	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3756	NC_010816	CGG	2	6	1538357	1538362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3757	NC_010816	GCGG	2	8	1538445	1538452	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3758	NC_010816	ACT	2	6	1538487	1538492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3760	NC_010816	TGCG	2	8	1540094	1540101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3762	NC_010816	GTAT	2	8	1540140	1540147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3997	NC_010816	GACC	2	8	1625159	1625166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3999	NC_010816	GC	3	6	1625266	1625271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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