MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 6382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010816	TTG	2	6	1239902	1239907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010816	AAT	2	6	1239980	1239985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_010816	CGG	2	6	1241655	1241660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_010816	CGC	2	6	1241931	1241936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_010816	TGCC	2	8	1245895	1245902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_010816	AGG	2	6	1245932	1245937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010816	TGG	2	6	1245950	1245955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010816	CTT	2	6	1247210	1247215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_010816	AGTT	2	8	1247245	1247252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010816	AT	3	6	1247283	1247288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010816	ACGC	2	8	1247300	1247307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_010816	TCG	2	6	1248377	1248382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_010816	GCC	2	6	1248386	1248391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_010816	ACCG	2	8	1248457	1248464	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_010816	ACG	3	9	1248483	1248491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010816	CA	3	6	1248523	1248528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_010816	ACT	2	6	1248571	1248576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_010816	AATC	2	8	1249695	1249702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_010816	GGA	2	6	1249748	1249753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010816	CAAT	2	8	1250722	1250729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_010816	CCT	2	6	1251015	1251020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_010816	TAG	2	6	1251082	1251087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_010816	TTGGT	2	10	1251091	1251100	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010816	TGA	2	6	1251114	1251119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010816	TGT	2	6	1251144	1251149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010816	TCT	2	6	1251180	1251185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_010816	CGG	2	6	1251186	1251191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_010816	GA	3	6	1251249	1251254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010816	CT	3	6	1255650	1255655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_010816	CGGC	2	8	1255672	1255679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_010816	TTC	2	6	1256317	1256322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_010816	AGA	2	6	1256341	1256346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010816	TCA	2	6	1256348	1256353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_010816	CTTGT	2	10	1256374	1256383	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3035	NC_010816	CCG	2	6	1256394	1256399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_010816	TCGA	2	8	1256408	1256415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_010816	CGC	2	6	1256430	1256435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_010816	CGA	2	6	1256442	1256447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_010816	GCTC	2	8	1256457	1256464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_010816	ATA	2	6	1256478	1256483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010816	GCG	2	6	1256523	1256528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_010816	CGC	2	6	1256562	1256567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_010816	GC	3	6	1256566	1256571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_010816	AGGCTT	2	12	1257391	1257402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3045	NC_010816	TA	3	6	1259375	1259380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010816	GGT	2	6	1259382	1259387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010816	GTG	2	6	1259402	1259407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010816	GGC	2	6	1259496	1259501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_010816	TAC	3	9	1259511	1259519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_010816	GTCCA	2	10	1259541	1259550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3051	NC_010816	ATT	2	6	1260710	1260715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010816	GGC	2	6	1260743	1260748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_010816	TGG	2	6	1260789	1260794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010816	AGA	2	6	1260826	1260831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010816	GCG	2	6	1260893	1260898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_010816	CAA	2	6	1260923	1260928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_010816	A	6	6	1260927	1260932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010816	GCC	2	6	1260945	1260950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_010816	CTG	2	6	1261743	1261748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010816	CG	3	6	1261783	1261788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_010816	TG	3	6	1261808	1261813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010816	TG	3	6	1261816	1261821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010816	AATGG	2	10	1261824	1261833	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010816	ACCA	2	8	1261846	1261853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_010816	GAC	2	6	1263268	1263273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_010816	ATA	2	6	1263302	1263307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010816	GCC	2	6	1264204	1264209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_010816	GA	3	6	1264256	1264261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_010816	TC	3	6	1265513	1265518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_010816	ACC	2	6	1265572	1265577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_010816	A	6	6	1265587	1265592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010816	ACAAAG	2	12	1265625	1265636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3073	NC_010816	TCCTT	2	10	1266779	1266788	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3074	NC_010816	TTG	2	6	1266858	1266863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_010816	TG	3	6	1266897	1266902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_010816	GCG	2	6	1266912	1266917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_010816	TGT	3	9	1266924	1266932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010816	TC	3	6	1266950	1266955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_010816	GA	3	6	1266986	1266991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010816	AGC	2	6	1266996	1267001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_010816	TAG	2	6	1268498	1268503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010816	GCA	2	6	1270181	1270186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_010816	TGCG	2	8	1270239	1270246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_010816	CAC	2	6	1271847	1271852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_010816	CCGT	2	8	1271870	1271877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_010816	TCT	2	6	1271891	1271896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_010816	TTCT	2	8	1272910	1272917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_010816	GCGG	2	8	1272923	1272930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_010816	ACC	2	6	1272948	1272953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_010816	G	6	6	1272964	1272969	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010816	TCA	2	6	1274637	1274642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_010816	TAGTG	2	10	1274649	1274658	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010816	CAC	2	6	1275571	1275576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_010816	AAC	2	6	1276244	1276249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_010816	AT	3	6	1276276	1276281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_010816	CTATT	2	10	1279280	1279289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3097	NC_010816	ACA	2	6	1279315	1279320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_010816	CCG	2	6	1279614	1279619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_010816	AC	3	6	1279639	1279644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_010816	AT	3	6	1279655	1279660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010816	CGG	2	6	1279709	1279714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_010816	CG	3	6	1279719	1279724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_010816	AGT	2	6	1279798	1279803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010816	CAG	2	6	1279808	1279813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_010816	GCG	2	6	1279821	1279826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_010816	CCTT	2	8	1279871	1279878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_010816	ACG	2	6	1279953	1279958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_010816	AGG	2	6	1279960	1279965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010816	C	6	6	1281004	1281009	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3110	NC_010816	ATT	2	6	1281085	1281090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010816	CCG	2	6	1281094	1281099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_010816	CCCTA	2	10	1281117	1281126	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3113	NC_010816	GAG	2	6	1281164	1281169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010816	CCCTT	2	10	1282488	1282497	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3115	NC_010816	AGGG	2	8	1282501	1282508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010816	T	6	6	1282513	1282518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010816	GT	3	6	1282519	1282524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_010816	ACA	2	6	1283000	1283005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_010816	AG	3	6	1284499	1284504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010816	T	7	7	1286006	1286012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010816	T	6	6	1286014	1286019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010816	TCA	2	6	1286024	1286029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_010816	TAA	2	6	1286110	1286115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010816	TCATG	2	10	1287254	1287263	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3125	NC_010816	CCA	2	6	1287307	1287312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_010816	CGG	2	6	1287361	1287366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_010816	AGC	2	6	1287390	1287395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_010816	CCA	2	6	1287460	1287465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_010816	CAG	2	6	1287500	1287505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_010816	ACA	2	6	1287573	1287578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_010816	CTG	2	6	1287980	1287985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_010816	CGC	2	6	1288014	1288019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_010816	TCA	2	6	1288066	1288071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_010816	CCT	2	6	1288124	1288129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_010816	AAC	2	6	1288147	1288152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_010816	GCAT	2	8	1288164	1288171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3141	NC_010816	CAC	2	6	1288579	1288584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3165	NC_010816	CGG	2	6	1291156	1291161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3166	NC_010816	GGCT	2	8	1291191	1291198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3230	NC_010816	T	7	7	1319542	1319548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_010816	AATC	2	8	1321376	1321383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3254	NC_010816	TGG	2	6	1324419	1324424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_010816	CCG	2	6	1324440	1324445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3256	NC_010816	CTGG	2	8	1326463	1326470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3257	NC_010816	TCGT	2	8	1326557	1326564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3258	NC_010816	GCAG	2	8	1326586	1326593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_010816	TCCT	2	8	1328319	1328326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_010816	CGG	2	6	1338186	1338191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_010816	CGG	2	6	1338817	1338822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3263	NC_010816	GTT	2	6	1342071	1342076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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