MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 6382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010816	GGC	2	6	597964	597969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010816	CGG	2	6	597977	597982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_010816	ATG	2	6	598001	598006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010816	CA	4	8	598024	598031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_010816	TAG	3	9	598213	598221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010816	GTG	2	6	598223	598228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010816	GAG	2	6	598248	598253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010816	AACA	2	8	599467	599474	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_010816	AG	3	6	601276	601281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010816	CAA	2	6	601337	601342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_010816	GAC	2	6	602034	602039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_010816	AGTA	2	8	603012	603019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010816	CAG	2	6	603033	603038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010816	GACT	2	8	603131	603138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_010816	CCTT	2	8	604292	604299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_010816	CGC	2	6	604331	604336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_010816	TCA	2	6	604345	604350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010816	CTACTT	2	12	604506	604517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010816	TGC	2	6	604838	604843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010816	TAA	2	6	604857	604862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010816	A	6	6	604861	604866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010816	AC	3	6	607486	607491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_010816	TTC	2	6	611398	611403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_010816	TGC	2	6	611526	611531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_010816	TA	3	6	614774	614779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010816	TTGG	2	8	615794	615801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010816	CAG	2	6	615852	615857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_010816	GCG	2	6	615866	615871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_010816	GCGCC	2	10	615886	615895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1530	NC_010816	TCC	2	6	619126	619131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_010816	GT	3	6	619862	619867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010816	GGTGA	2	10	621028	621037	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010816	CAA	2	6	621789	621794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_010816	CG	3	6	621826	621831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_010816	TGGC	2	8	622311	622318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_010816	GTT	2	6	622728	622733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010816	TCG	2	6	622735	622740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_010816	TC	3	6	622820	622825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_010816	GCA	2	6	623846	623851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_010816	GCAG	3	12	623910	623921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_010816	CG	3	6	623922	623927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_010816	ATG	2	6	624007	624012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010816	GC	3	6	624997	625002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_010816	TTG	2	6	625040	625045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010816	CCT	2	6	627314	627319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_010816	GTA	2	6	627350	627355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_010816	ATC	2	6	627374	627379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_010816	TTA	2	6	628053	628058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010816	ATC	2	6	628127	628132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_010816	TCA	3	9	628184	628192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010816	TGG	2	6	628248	628253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010816	CTCCC	2	10	628704	628713	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1553	NC_010816	CAG	2	6	628763	628768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_010816	AAGC	2	8	628808	628815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_010816	TTA	2	6	628886	628891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010816	AAC	2	6	628929	628934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_010816	GCC	2	6	628957	628962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_010816	TCC	2	6	628969	628974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_010816	TGT	2	6	629128	629133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010816	TGA	2	6	629214	629219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010816	CAG	2	6	629256	629261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_010816	TCG	2	6	629282	629287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_010816	TCA	2	6	629393	629398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010816	TTC	2	6	629414	629419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_010816	TCT	2	6	629576	629581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_010816	CGT	2	6	629582	629587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_010816	GCG	2	6	629803	629808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_010816	CAG	2	6	629832	629837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_010816	GTT	2	6	629842	629847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010816	GAC	2	6	631988	631993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_010816	TTC	2	6	632056	632061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_010816	TGA	2	6	632073	632078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010816	GCTG	2	8	632088	632095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_010816	ACG	2	6	632156	632161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_010816	CAT	2	6	634379	634384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_010816	GCT	2	6	634826	634831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_010816	ACC	3	9	634854	634862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_010816	ATA	2	6	634868	634873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010816	GACG	2	8	634898	634905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_010816	CGG	2	6	634908	634913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_010816	ACA	2	6	635107	635112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_010816	CA	3	6	635195	635200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_010816	GGC	2	6	635338	635343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_010816	GTC	2	6	635386	635391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_010816	CCT	2	6	635539	635544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_010816	TGC	2	6	635610	635615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_010816	AGG	2	6	635721	635726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010816	GGT	2	6	636573	636578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010816	AAC	2	6	636644	636649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_010816	TTGA	2	8	637077	637084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010816	CT	3	6	637089	637094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_010816	CCG	2	6	637111	637116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_010816	AGT	2	6	637184	637189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010816	CAT	2	6	637202	637207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_010816	GTCA	2	8	637246	637253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_010816	CA	3	6	637252	637257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_010816	CG	3	6	637305	637310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_010816	CTCAG	2	10	637329	637338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1599	NC_010816	GCA	2	6	637371	637376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_010816	CG	3	6	637380	637385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_010816	GAT	2	6	637394	637399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_010816	TTCCG	2	10	637407	637416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1603	NC_010816	CTC	2	6	637418	637423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_010816	ATG	2	6	637474	637479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010816	GCA	2	6	637518	637523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010816	CGG	2	6	637572	637577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_010816	CCT	2	6	637762	637767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_010816	TA	3	6	637779	637784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010816	ACT	2	6	637800	637805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_010816	TCC	2	6	637820	637825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_010816	C	12	12	638722	638733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1612	NC_010816	GTG	2	6	638763	638768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010816	GTT	2	6	638815	638820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010816	CCT	2	6	640105	640110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_010816	GAA	2	6	640172	640177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010816	TAC	2	6	641060	641065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_010816	GAC	2	6	641082	641087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_010816	AG	3	6	641120	641125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010816	G	6	6	641178	641183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010816	AGAA	2	8	642477	642484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010816	CTT	2	6	642494	642499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_010816	CGT	2	6	642537	642542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_010816	ACT	2	6	643049	643054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_010816	TTG	2	6	643073	643078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010816	CGG	2	6	643097	643102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_010816	CCA	2	6	643110	643115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_010816	TG	3	6	643132	643137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010816	GCTC	2	8	645094	645101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_010816	CTG	2	6	645124	645129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_010816	ACC	2	6	645136	645141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_010816	G	9	9	645174	645182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010816	CTGT	2	8	645189	645196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_010816	TTA	2	6	645197	645202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_010816	TC	3	6	646855	646860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_010816	CGT	2	6	646874	646879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_010816	CTC	2	6	790056	790061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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