MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 6382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010816	CGG	2	6	367898	367903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010816	CG	3	6	367919	367924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_010816	GGAA	2	8	367931	367938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010816	GTG	2	6	367944	367949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010816	AAT	2	6	367979	367984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010816	GGT	2	6	367996	368001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010816	GA	3	6	368068	368073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010816	AGG	2	6	368076	368081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010816	TGA	2	6	371870	371875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010816	GGT	2	6	371913	371918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010816	TC	3	6	371936	371941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_010816	TGC	2	6	371983	371988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_010816	ATC	2	6	371994	371999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010816	CCG	3	9	372018	372026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_010816	CAT	2	6	372049	372054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010816	CG	3	6	372066	372071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_010816	TGA	2	6	372156	372161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010816	CTA	2	6	373459	373464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010816	GAA	3	9	373489	373497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010816	CCT	2	6	380023	380028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_010816	TCTCT	2	10	380057	380066	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_010816	CTC	2	6	380090	380095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_010816	AAC	2	6	382962	382967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_010816	GTTT	2	8	383045	383052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010816	GTT	2	6	383076	383081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010816	AGGGG	2	10	383112	383121	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010816	CAC	2	6	385517	385522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_010816	CTT	2	6	385543	385548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_010816	TA	4	8	385627	385634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010816	GAC	2	6	385652	385657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010816	TGA	2	6	386468	386473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010816	CAA	2	6	386477	386482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_010816	ATG	2	6	386497	386502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010816	GAGG	2	8	386557	386564	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010816	AG	3	6	388925	388930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010816	TTG	2	6	388984	388989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010816	TTA	2	6	388998	389003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010816	TGT	2	6	389342	389347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010816	TGG	2	6	389373	389378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010816	TTCG	2	8	392647	392654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_010816	GCCA	2	8	392717	392724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_010816	AAC	2	6	392752	392757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_010816	GTT	2	6	393035	393040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010816	GAT	2	6	393055	393060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010816	CGT	2	6	393179	393184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010816	GCG	2	6	393187	393192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010816	CGTCG	2	10	393205	393214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1048	NC_010816	CG	3	6	393217	393222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_010816	ATGC	2	8	395405	395412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_010816	A	7	7	395428	395434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010816	ATC	2	6	396337	396342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010816	CAA	2	6	396363	396368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010816	TGT	2	6	396405	396410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010816	GCT	2	6	397006	397011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010816	AAC	2	6	398167	398172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010816	ACG	2	6	398198	398203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010816	CAG	2	6	398206	398211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_010816	CCAT	2	8	398356	398363	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_010816	CT	3	6	399349	399354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_010816	GT	3	6	399410	399415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010816	GT	3	6	399421	399426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010816	GGCAT	2	10	399444	399453	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_010816	TGG	2	6	400012	400017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010816	GCC	2	6	401322	401327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_010816	GAC	2	6	402344	402349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010816	GAC	2	6	404247	404252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010816	TTG	2	6	407249	407254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010816	GCC	2	6	407441	407446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_010816	GC	3	6	407455	407460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_010816	CAG	2	6	407464	407469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010816	GGA	2	6	408227	408232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010816	TGC	2	6	408233	408238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010816	GCG	2	6	408259	408264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010816	ATT	2	6	408282	408287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010816	GGA	2	6	408293	408298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010816	TGC	2	6	408417	408422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010816	GGC	2	6	408426	408431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010816	GAT	2	6	408432	408437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010816	GTG	2	6	408439	408444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010816	GCA	2	6	409956	409961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_010816	AGCC	2	8	409973	409980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_010816	CG	3	6	409998	410003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_010816	TGC	2	6	411433	411438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_010816	TG	3	6	411472	411477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010816	CTC	2	6	413066	413071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_010816	CT	3	6	413080	413085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_010816	AGG	2	6	413101	413106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010816	AGT	2	6	415686	415691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010816	TGA	2	6	415721	415726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010816	GTGTC	2	10	415731	415740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_010816	A	6	6	415763	415768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010816	CCGG	2	8	416001	416008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_010816	TGA	2	6	416225	416230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010816	AT	3	6	417885	417890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010816	GGC	2	6	418738	418743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010816	ACG	2	6	418750	418755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010816	AG	3	6	418787	418792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010816	AG	3	6	418797	418802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010816	TCAG	2	8	418823	418830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_010816	TCG	2	6	419868	419873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010816	TCGC	2	8	421706	421713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_010816	TCCT	2	8	423548	423555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_010816	GAT	2	6	423563	423568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010816	CGG	2	6	423584	423589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_010816	ATC	2	6	423601	423606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_010816	CG	3	6	423623	423628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_010816	GAT	2	6	423650	423655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010816	CCG	2	6	423657	423662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_010816	GGT	2	6	424407	424412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010816	CGG	3	9	424421	424429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_010816	GGC	2	6	424437	424442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010816	CGC	2	6	424448	424453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_010816	CCA	2	6	424509	424514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_010816	CGA	2	6	424647	424652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_010816	GCC	2	6	424662	424667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_010816	GCC	2	6	424677	424682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_010816	CCG	2	6	424714	424719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_010816	CAG	2	6	424728	424733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_010816	GGC	2	6	424766	424771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_010816	CG	3	6	426187	426192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_010816	GGCC	2	8	426259	426266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_010816	CGT	2	6	426290	426295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_010816	TCCA	2	8	426629	426636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_010816	GCCG	2	8	426639	426646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_010816	A	6	6	426700	426705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010816	GGAA	2	8	426707	426714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010816	CGAA	2	8	426717	426724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_010816	A	7	7	429399	429405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010816	GAA	2	6	429429	429434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010816	ATC	2	6	429451	429456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010816	GAG	2	6	429693	429698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010816	TCC	2	6	432401	432406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_010816	ATC	2	6	432464	432469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_010816	AAT	2	6	432475	432480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010816	TC	3	6	433369	433374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1266	NC_010816	GT	4	8	511301	511308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_010816	TGA	2	6	511383	511388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_010816	GCA	2	6	579940	579945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_010816	ATG	2	6	580441	580446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_010816	GCG	2	6	580461	580466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_010816	GAT	2	6	580527	580532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_010816	CATGT	2	10	580555	580564	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1413	NC_010816	GAT	2	6	580693	580698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_010816	TTCCT	2	10	581470	581479	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1417	NC_010816	AT	3	6	581539	581544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_010816	TGGT	2	8	581633	581640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_010816	TCG	2	6	582178	582183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1430	NC_010816	CTT	2	6	582598	582603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_010816	GTTC	2	8	583337	583344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1439	NC_010816	GCATC	2	10	583936	583945	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1441	NC_010816	AAC	2	6	584105	584110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_010816	CGG	2	6	584140	584145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_010816	ATG	2	6	584184	584189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_010816	CG	3	6	586212	586217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1451	NC_010816	CG	3	6	586274	586279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1452	NC_010816	GAA	2	6	586289	586294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1491	NC_010816	CTG	2	6	597547	597552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1498	NC_010816	C	6	6	597902	597907	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1499	NC_010816	CAC	2	6	597914	597919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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