MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 6382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010816	GCC	2	6	180985	180990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_010816	TCCGGG	2	12	181016	181027	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010816	GTA	2	6	181079	181084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010816	GCCG	2	8	181114	181121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_010816	GGT	2	6	181126	181131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010816	GAT	2	6	181195	181200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010816	GCC	2	6	181267	181272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_010816	TGG	2	6	181291	181296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010816	AC	3	6	181394	181399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_010816	CGG	2	6	181575	181580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010816	CG	3	6	181823	181828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_010816	AGTGCA	2	12	181995	182006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
513	NC_010816	GAC	2	6	182027	182032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010816	CCGGTG	2	12	182067	182078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010816	TCG	2	6	182184	182189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010816	CGT	2	6	182264	182269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010816	GAG	2	6	182311	182316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010816	TCC	2	6	182608	182613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_010816	GCC	2	6	182698	182703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_010816	AGA	2	6	182739	182744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010816	GCG	2	6	182748	182753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010816	CGC	3	9	182853	182861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_010816	CA	3	6	182939	182944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_010816	TGC	2	6	183055	183060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010816	TG	3	6	183063	183068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010816	CGG	2	6	183077	183082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_010816	ATG	2	6	183229	183234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010816	CGA	2	6	183319	183324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010816	ACG	2	6	183385	183390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_010816	GCG	2	6	183479	183484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010816	TTCC	2	8	183487	183494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_010816	TGGT	2	8	183497	183504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010816	CTGG	2	8	183512	183519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_010816	TGG	3	9	183522	183530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010816	TAC	2	6	183555	183560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_010816	GTG	2	6	183610	183615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010816	TGA	2	6	183636	183641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010816	T	6	6	183651	183656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010816	TCCT	2	8	183664	183671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_010816	TTTTG	2	10	183691	183700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010816	T	7	7	183732	183738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010816	GGC	2	6	183773	183778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010816	TGG	2	6	183823	183828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010816	GACC	2	8	183858	183865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_010816	GGT	2	6	183898	183903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010816	TCT	2	6	183933	183938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010816	ATGGG	2	10	183956	183965	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010816	CGG	2	6	183986	183991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010816	GCA	2	6	184084	184089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010816	CGC	2	6	184131	184136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_010816	GAGT	2	8	184190	184197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010816	CAG	2	6	184232	184237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010816	ATT	2	6	184273	184278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010816	TCG	2	6	184303	184308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010816	CGGG	2	8	184356	184363	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
556	NC_010816	GAA	2	6	184424	184429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010816	GAG	2	6	184471	184476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010816	GCG	2	6	184654	184659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_010816	GAA	2	6	184688	184693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010816	GGT	2	6	184761	184766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010816	GTC	3	9	184772	184780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010816	TCGTG	2	10	184784	184793	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
563	NC_010816	CCG	2	6	184873	184878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_010816	GGA	2	6	184889	184894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010816	ATC	2	6	184913	184918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010816	AC	3	6	185110	185115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_010816	GCA	2	6	185139	185144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_010816	CCT	2	6	185254	185259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_010816	CG	3	6	185305	185310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_010816	GGC	2	6	185325	185330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010816	CGT	2	6	185351	185356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010816	CCG	2	6	185367	185372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_010816	GGTG	2	8	185380	185387	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010816	GGT	2	6	185392	185397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010816	CGT	2	6	185462	185467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_010816	GCCG	2	8	185476	185483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_010816	TGGCG	2	10	185497	185506	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
578	NC_010816	GTG	2	6	185511	185516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010816	TCGAA	2	10	185583	185592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
580	NC_010816	TGA	2	6	185634	185639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010816	GTC	2	6	185643	185648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010816	GTG	2	6	185688	185693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010816	TG	3	6	185692	185697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010816	TTGC	2	8	185698	185705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_010816	TGG	2	6	185715	185720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010816	GCC	2	6	185778	185783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_010816	ACCG	2	8	185824	185831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_010816	G	6	6	185857	185862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010816	AGT	2	6	185913	185918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010816	GCGA	2	8	185920	185927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_010816	GAT	2	6	185933	185938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010816	GC	3	6	185975	185980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_010816	GCCG	2	8	186017	186024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_010816	GGGAG	2	10	186247	186256	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010816	GAT	2	6	186440	186445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010816	GGA	2	6	186484	186489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010816	G	6	6	186514	186519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010816	TC	3	6	186570	186575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_010816	CGG	2	6	186707	186712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010816	TCG	3	9	186723	186731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010816	CGT	2	6	186751	186756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010816	AGG	2	6	186813	186818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010816	AGC	2	6	186829	186834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010816	CAC	2	6	186907	186912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010816	GA	3	6	187024	187029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010816	GCC	2	6	187168	187173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_010816	TCCGGG	2	12	187199	187210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_010816	GTA	2	6	187262	187267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010816	GCCG	2	8	187297	187304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_010816	GGT	2	6	187309	187314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010816	GAT	2	6	187378	187383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010816	GCC	2	6	187450	187455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_010816	TGG	2	6	187474	187479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010816	CG	3	6	187584	187589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_010816	CGG	2	6	187758	187763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010816	CG	3	6	188006	188011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_010816	AGTGCA	2	12	188178	188189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_010816	GAC	2	6	188210	188215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010816	CCGGTG	2	12	188250	188261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010816	TCG	2	6	188367	188372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010816	CGT	2	6	188447	188452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010816	GAG	2	6	188494	188499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010816	TCC	2	6	188791	188796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_010816	GCC	2	6	188881	188886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_010816	AGA	2	6	188922	188927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010816	GCG	2	6	188931	188936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010816	CGC	3	9	189036	189044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_010816	CAA	2	6	189106	189111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010816	AGA	2	6	189173	189178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010816	GTA	2	6	190077	190082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010816	T	7	7	190152	190158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010816	TTA	2	6	190287	190292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010816	TGG	2	6	190328	190333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010816	CACG	2	8	191971	191978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
635	NC_010816	CGC	2	6	192014	192019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_010816	TTTC	2	8	194613	194620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_010816	GCG	2	6	194626	194631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_010816	CGC	2	6	194654	194659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_010816	CA	3	6	194677	194682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
640	NC_010816	CCAA	2	8	196080	196087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_010816	GAA	2	6	196811	196816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_010816	CTT	2	6	196822	196827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_010816	CCT	2	6	197618	197623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_010816	GTGCC	2	10	199104	199113	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
645	NC_010816	TGA	2	6	199157	199162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
646	NC_010816	GAT	2	6	200609	200614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_010816	CGG	2	6	200622	200627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_010816	TGG	2	6	200650	200655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
649	NC_010816	A	6	6	200700	200705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_010816	CGA	2	6	200719	200724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_010816	GTA	2	6	200733	200738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
652	NC_010816	CGAG	2	8	200739	200746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
653	NC_010816	AG	3	6	200755	200760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
654	NC_010816	AG	3	6	200767	200772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
655	NC_010816	CG	3	6	200801	200806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
656	NC_010816	CCGG	2	8	200809	200816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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659	NC_010816	CTG	2	6	201268	201273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_010816	CGC	2	6	207115	207120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
662	NC_010816	TGA	2	6	207192	207197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
663	NC_010816	TAA	2	6	207198	207203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_010816	AGA	2	6	207212	207217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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666	NC_010816	AAC	2	6	208789	208794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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669	NC_010816	TCA	2	6	208898	208903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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671	NC_010816	CATC	2	8	208928	208935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
672	NC_010816	A	6	6	209900	209905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_010816	ACCT	2	8	209944	209951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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679	NC_010816	GTT	2	6	211906	211911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_010816	GTT	2	6	211981	211986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_010816	GGT	2	6	212010	212015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_010816	GCG	2	6	258373	258378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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765	NC_010816	GAT	2	6	258552	258557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_010816	CAAT	2	8	261351	261358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
771	NC_010816	GT	3	6	261369	261374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
772	NC_010816	GTC	2	6	261388	261393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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774	NC_010816	GGA	2	6	261471	261476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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