MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 6382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010816	CGGC	2	8	1761496	1761503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_010816	CCG	2	6	1761505	1761510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_010816	AG	3	6	1761521	1761526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_010816	CGGCG	2	10	1761528	1761537	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4505	NC_010816	CCT	2	6	1761604	1761609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_010816	C	6	6	1761610	1761615	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4507	NC_010816	CTG	2	6	1761619	1761624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_010816	C	8	8	1761636	1761643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4509	NC_010816	CA	3	6	1761851	1761856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_010816	CA	3	6	1761910	1761915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_010816	GCT	2	6	1762023	1762028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_010816	AC	3	6	1762048	1762053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_010816	CAC	2	6	1767184	1767189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_010816	CTG	2	6	1767201	1767206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_010816	CGG	2	6	1767291	1767296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_010816	TGA	2	6	1767326	1767331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_010816	GTC	2	6	1767354	1767359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_010816	CTGAGA	2	12	1767366	1767377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4519	NC_010816	TG	3	6	1768258	1768263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_010816	CAAC	2	8	1768342	1768349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_010816	CAT	2	6	1768356	1768361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_010816	ATC	2	6	1768776	1768781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_010816	TGG	2	6	1768805	1768810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_010816	GCGG	2	8	1769596	1769603	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4525	NC_010816	TTGT	2	8	1769611	1769618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_010816	GTT	2	6	1769671	1769676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_010816	TTG	2	6	1769789	1769794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4529	NC_010816	AAG	2	6	1769850	1769855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_010816	CGA	2	6	1769936	1769941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_010816	CCG	2	6	1771391	1771396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_010816	A	6	6	1771398	1771403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_010816	GCAC	2	8	1771411	1771418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_010816	CA	3	6	1771428	1771433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_010816	TGG	2	6	1771520	1771525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4537	NC_010816	TGAT	3	12	1772624	1772635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4539	NC_010816	TA	3	6	1772703	1772708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_010816	AGA	2	6	1772727	1772732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_010816	AGG	3	9	1772925	1772933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4544	NC_010816	GCG	2	6	1774708	1774713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_010816	TC	3	6	1775455	1775460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_010816	GCG	2	6	1775469	1775474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_010816	CT	3	6	1775493	1775498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4549	NC_010816	G	6	6	1775614	1775619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_010816	TA	3	6	1775653	1775658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_010816	ATC	2	6	1775700	1775705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_010816	AAT	2	6	1775709	1775714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_010816	GA	3	6	1775775	1775780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_010816	GCT	2	6	1778990	1778995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_010816	TG	3	6	1779027	1779032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_010816	T	7	7	1779072	1779078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_010816	TGG	2	6	1779095	1779100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_010816	GTG	3	9	1779112	1779120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_010816	ACCTG	2	10	1779141	1779150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4561	NC_010816	T	6	6	1779197	1779202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_010816	AGG	2	6	1779311	1779316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4565	NC_010816	CGTT	2	8	1782336	1782343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4568	NC_010816	GTTG	2	8	1783106	1783113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_010816	GTT	2	6	1783129	1783134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_010816	AGAGA	2	10	1787874	1787883	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_010816	TGGC	2	8	1789434	1789441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4590	NC_010816	A	6	6	1796277	1796282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_010816	ATC	2	6	1796288	1796293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4593	NC_010816	AGCG	2	8	1800213	1800220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_010816	CAA	2	6	1800280	1800285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_010816	GCT	2	6	1800305	1800310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_010816	GTT	2	6	1800402	1800407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_010816	TGT	2	6	1800414	1800419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4599	NC_010816	TTG	2	6	1800632	1800637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_010816	GT	3	6	1801210	1801215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_010816	AAT	2	6	1801267	1801272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_010816	GC	3	6	1801294	1801299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_010816	GTCT	2	8	1801312	1801319	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_010816	GAC	2	6	1801396	1801401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_010816	GT	3	6	1801451	1801456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_010816	GCG	2	6	1801526	1801531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_010816	GAATGG	2	12	1801546	1801557	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4609	NC_010816	TC	3	6	1802118	1802123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_010816	CTG	2	6	1802133	1802138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_010816	CCTC	2	8	1802149	1802156	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4612	NC_010816	AGGTAA	2	12	1802166	1802177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_010816	GTAA	2	8	1802228	1802235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_010816	AACC	2	8	1802321	1802328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_010816	CAAC	2	8	1802329	1802336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_010816	AGCG	2	8	1804314	1804321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_010816	ACAGC	2	10	1804328	1804337	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4618	NC_010816	TC	3	6	1804364	1804369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_010816	CCT	2	6	1804389	1804394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_010816	TCA	2	6	1804395	1804400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_010816	GAGG	2	8	1804401	1804408	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_010816	CTGA	2	8	1806354	1806361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4623	NC_010816	TGA	2	6	1806413	1806418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_010816	GC	3	6	1807588	1807593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_010816	GCC	2	6	1808990	1808995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_010816	GCC	2	6	1809051	1809056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_010816	GTG	2	6	1809082	1809087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_010816	TGC	2	6	1809129	1809134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_010816	GCG	2	6	1809139	1809144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_010816	TTG	2	6	1809233	1809238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_010816	CATT	2	8	1809356	1809363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_010816	CGC	2	6	1809487	1809492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4636	NC_010816	CTG	2	6	1811710	1811715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4638	NC_010816	ATG	2	6	1811812	1811817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4640	NC_010816	GCGT	2	8	1811869	1811876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4641	NC_010816	GC	3	6	1811921	1811926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4693	NC_010816	TGAA	2	8	1824772	1824779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4694	NC_010816	CACT	2	8	1824781	1824788	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4725	NC_010816	GTGG	2	8	1839831	1839838	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4742	NC_010816	CAG	2	6	1842807	1842812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4759	NC_010816	TG	3	6	1845322	1845327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4760	NC_010816	TTG	2	6	1846334	1846339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_010816	GCAA	2	8	1846378	1846385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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