MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus S19 chromosome 2

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010740	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010740	GCCGC	2	10	4432	4441	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_010740	GCCGA	2	10	14989	14998	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010740	AGCGG	2	10	21997	22006	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010740	ACGGC	2	10	27105	27114	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010740	GGCCT	2	10	37344	37353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010740	ATGAA	2	10	39915	39924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010740	TTTGT	2	10	41076	41085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010740	CGCTC	2	10	43285	43294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010740	TGAAA	2	10	44141	44150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010740	TGCGG	2	10	60650	60659	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010740	TATCT	2	10	72919	72928	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010740	TCGGT	2	10	81580	81589	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010740	TTCTC	2	10	81609	81618	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010740	ACTTG	2	10	87138	87147	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010740	CGGTA	2	10	97003	97012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010740	CCAAG	2	10	97178	97187	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010740	TGCTG	2	10	100352	100361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010740	ATGAA	2	10	103264	103273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010740	CTTGC	2	10	107836	107845	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010740	CCTGC	2	10	112510	112519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_010740	CGGTG	2	10	114679	114688	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010740	GCCCG	2	10	115703	115712	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_010740	GCACA	2	10	116718	116727	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010740	GTTCG	2	10	116739	116748	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010740	GCCCG	2	10	121238	121247	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_010740	AGATA	2	10	134019	134028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010740	GCCGC	2	10	141125	141134	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_010740	TTGGC	2	10	144659	144668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010740	CCGGG	2	10	151809	151818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010740	CGGAT	2	10	162400	162409	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010740	TGGGC	2	10	162531	162540	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010740	TGTTT	2	10	162984	162993	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010740	CCCGT	2	10	163709	163718	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_010740	GGATA	2	10	190819	190828	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010740	TGACG	2	10	194565	194574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010740	AGCAG	2	10	206363	206372	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010740	TTTTG	2	10	211946	211955	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010740	ATCAA	2	10	212114	212123	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010740	TGAAA	2	10	212124	212133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010740	TAAGT	2	10	217241	217250	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010740	GCGCA	2	10	222178	222187	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_010740	CGCAA	2	10	222817	222826	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010740	CGGGG	2	10	227877	227886	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010740	TGCCG	2	10	233142	233151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010740	ATTGT	2	10	239874	239883	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010740	AAGGG	2	10	243577	243586	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010740	TAGGG	2	10	247340	247349	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010740	GGCCT	2	10	248166	248175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010740	TGGTT	2	10	249598	249607	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010740	GTTCC	2	10	253337	253346	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010740	GGCAT	2	10	254752	254761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010740	CTGAA	2	10	254764	254773	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010740	AGATG	2	10	261704	261713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010740	CAGGC	2	10	262352	262361	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010740	CCGGC	4	20	262889	262908	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_010740	GCCCG	2	10	291512	291521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_010740	TTTGT	2	10	295110	295119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010740	TATCA	2	10	328454	328463	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010740	AGGCG	2	10	333032	333041	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010740	AAACC	2	10	335420	335429	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010740	GGCCG	2	10	338874	338883	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010740	CTTTT	2	10	343368	343377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010740	AATTG	2	10	348554	348563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010740	TGATC	2	10	354523	354532	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010740	CGCCC	2	10	359132	359141	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67	NC_010740	TTGCC	2	10	375473	375482	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010740	GGTGC	2	10	375912	375921	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010740	TTCAA	2	10	381396	381405	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010740	ATGAA	2	10	409775	409784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010740	GAATG	2	10	411749	411758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010740	ATGGC	2	10	412840	412849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010740	TCCTC	2	10	417470	417479	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_010740	AGGGG	2	10	425797	425806	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010740	TTTGT	2	10	434590	434599	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010740	ATGCC	2	10	435931	435940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010740	TTTGA	2	10	438065	438074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010740	TGCGC	2	10	463368	463377	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010740	CACGG	2	10	477882	477891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_010740	GCTTT	2	10	489738	489747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010740	CCTGA	2	10	496366	496375	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_010740	CGTAA	2	10	507618	507627	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010740	GATTA	2	10	512928	512937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010740	CCCCG	2	10	542277	542286	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
85	NC_010740	GTCCG	2	10	545978	545987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_010740	AGCGA	2	10	579986	579995	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010740	TTTGT	2	10	586503	586512	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010740	CAAAA	2	10	598662	598671	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010740	AAGGC	2	10	609058	609067	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010740	TGCTC	2	10	610504	610513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010740	ATGAA	2	10	614400	614409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010740	GCAAA	2	10	617234	617243	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010740	TTTGT	2	10	617695	617704	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010740	TTTGT	2	10	641167	641176	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010740	CCGCT	2	10	643473	643482	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_010740	ATTCA	2	10	676599	676608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010740	AATGA	2	10	676862	676871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010740	TGCGA	2	10	681598	681607	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010740	TGAAT	2	10	691045	691054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010740	CGAAT	2	10	692361	692370	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010740	GGCCG	2	10	703022	703031	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_010740	AAGAC	2	10	707191	707200	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010740	CCAGT	2	10	712028	712037	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010740	GCCTG	2	10	713576	713585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_010740	TCTCA	2	10	713802	713811	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_010740	ATTTT	2	10	717829	717838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010740	GGCTT	2	10	738879	738888	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010740	GGGAT	2	10	758726	758735	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010740	TCACT	2	10	763305	763314	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010740	ATCAG	2	10	766154	766163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010740	CGGCG	2	10	766232	766241	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_010740	GCTGG	2	10	771122	771131	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010740	TTCCG	2	10	771285	771294	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010740	ACGTC	2	10	817486	817495	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_010740	CGGCC	2	10	819780	819789	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_010740	ACAAA	2	10	823796	823805	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010740	ACAAA	2	10	847964	847973	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010740	AAAGC	2	10	865953	865962	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010740	GGCGA	2	10	896318	896327	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010740	CACAT	2	10	896402	896411	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_010740	CGCGC	2	10	896505	896514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_010740	CAGCG	2	10	917648	917657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_010740	TCCCC	2	10	964065	964074	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_010740	CATTG	2	10	966754	966763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010740	AGCGA	2	10	978836	978845	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010740	CGCTT	2	10	988677	988686	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010740	TGCGC	2	10	992388	992397	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010740	CGCCT	2	10	1008034	1008043	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_010740	ATTAA	2	10	1009442	1009451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010740	AACCG	2	10	1011271	1011280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010740	TTTTC	2	10	1021210	1021219	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010740	CTATT	2	10	1049614	1049623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010740	TCGAC	2	10	1054027	1054036	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010740	TTCTG	2	10	1054099	1054108	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010740	GAAAG	2	10	1056072	1056081	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010740	TTCAA	2	10	1059830	1059839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010740	CCTCT	2	10	1059848	1059857	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_010740	GCTGT	2	10	1061459	1061468	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010740	CGAAG	2	10	1062272	1062281	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010740	AGCCC	2	10	1062826	1062835	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_010740	CACGA	2	10	1062971	1062980	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_010740	TTATT	2	10	1068769	1068778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010740	CGGCC	2	10	1071957	1071966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_010740	CCACG	2	10	1074566	1074575	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_010740	CGGCA	2	10	1075639	1075648	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010740	ATCGC	2	10	1075994	1076003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_010740	TGCGG	2	10	1090305	1090314	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010740	TTCTG	2	10	1104977	1104986	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010740	CAGGC	2	10	1108197	1108206	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_010740	GGAAG	2	10	1136842	1136851	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010740	AAAGC	2	10	1148430	1148439	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_010740	GCTTT	2	10	1148445	1148454	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_010740	ACGGC	2	10	1148716	1148725	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_010740	GTTAC	2	10	1151363	1151372	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_010740	GATCG	2	10	1154539	1154548	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_010740	GCGCC	2	10	1154707	1154716	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_010740	AGCCA	2	10	1155636	1155645	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.