MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 1

Total Repeats: 14245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010681	TCG	2	6	140672	140677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010681	GGA	2	6	140719	140724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010681	AGC	2	6	140726	140731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_010681	CTG	2	6	140806	140811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_010681	CGG	2	6	141031	141036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010681	A	6	6	141047	141052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010681	TGCG	2	8	141122	141129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_010681	CCTT	2	8	141625	141632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_010681	GATGA	2	10	141671	141680	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010681	ACCG	2	8	141682	141689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
511	NC_010681	GCG	2	6	141732	141737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010681	CGC	2	6	141749	141754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_010681	GCT	2	6	141800	141805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010681	TCG	2	6	141822	141827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010681	TGC	2	6	141830	141835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010681	TGCT	2	8	141844	141851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_010681	CCA	2	6	141857	141862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_010681	CGA	2	6	142003	142008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010681	TCG	2	6	142021	142026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_010681	TGA	2	6	142039	142044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010681	ACGAAT	2	12	142062	142073	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
522	NC_010681	CGA	2	6	142093	142098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010681	GTG	2	6	142118	142123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010681	CGA	2	6	142233	142238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010681	TGA	2	6	142279	142284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010681	ACAGG	2	10	142294	142303	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
527	NC_010681	TCG	2	6	142359	142364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_010681	CGG	2	6	142471	142476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010681	CGATC	2	10	142500	142509	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
530	NC_010681	GCA	2	6	142517	142522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010681	ACC	2	6	142655	142660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_010681	GC	3	6	142725	142730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_010681	CTC	2	6	144287	144292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_010681	ACG	2	6	144311	144316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_010681	GCG	2	6	144331	144336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_010681	AGG	2	6	144354	144359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010681	CGG	2	6	144404	144409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_010681	ATG	2	6	145071	145076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010681	CT	3	6	147633	147638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_010681	GCG	2	6	147647	147652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010681	CCGCG	2	10	147655	147664	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
542	NC_010681	G	6	6	147701	147706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010681	GCGG	2	8	147722	147729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
544	NC_010681	CGT	2	6	148353	148358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010681	GCT	2	6	148404	148409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_010681	TGA	2	6	148482	148487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010681	CGT	2	6	148507	148512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010681	GAAT	2	8	148525	148532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010681	GAT	2	6	148599	148604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010681	GA	3	6	148647	148652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010681	GCT	2	6	148678	148683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_010681	ACG	2	6	148749	148754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010681	CG	3	6	148753	148758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_010681	CCG	2	6	148798	148803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_010681	GCG	2	6	148809	148814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010681	GCC	2	6	148843	148848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_010681	CCT	2	6	151577	151582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_010681	AGG	2	6	159222	159227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010681	GTT	2	6	159230	159235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010681	CGG	2	6	159259	159264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010681	ATC	2	6	161650	161655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010681	ATC	2	6	161666	161671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010681	ATC	2	6	161712	161717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_010681	CGT	2	6	161940	161945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_010681	TGG	2	6	162796	162801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010681	GACT	2	8	162880	162887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_010681	CATT	2	8	167524	167531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_010681	GTCA	2	8	169561	169568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_010681	GC	3	6	169570	169575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_010681	CGT	2	6	170667	170672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010681	GGTCG	2	10	170673	170682	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
572	NC_010681	GCC	2	6	170746	170751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_010681	CGC	2	6	170775	170780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_010681	TGT	2	6	170782	170787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010681	TG	3	6	170828	170833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010681	GCT	2	6	170846	170851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_010681	GCC	2	6	171506	171511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_010681	GAA	2	6	171520	171525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010681	GCC	2	6	171559	171564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_010681	CAT	2	6	171615	171620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_010681	CG	3	6	171644	171649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_010681	ACC	2	6	171716	171721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_010681	TGG	2	6	171757	171762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010681	ATC	2	6	172438	172443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010681	TA	3	6	172451	172456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010681	T	7	7	172607	172613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010681	CAA	2	6	172714	172719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010681	CACG	2	8	172739	172746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010681	ACG	2	6	172790	172795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_010681	GCAC	2	8	184257	184264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
591	NC_010681	CTGC	2	8	188380	188387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_010681	AGG	2	6	191590	191595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010681	TGC	2	6	192922	192927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010681	CCGGA	2	10	192957	192966	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
595	NC_010681	TGAC	2	8	192997	193004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_010681	CAG	2	6	193024	193029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010681	CTG	2	6	193090	193095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010681	GCAG	2	8	193222	193229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_010681	GCAG	2	8	193293	193300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
600	NC_010681	TTG	2	6	193308	193313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010681	GAT	2	6	193327	193332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010681	TCCG	2	8	193345	193352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
603	NC_010681	CCG	2	6	193448	193453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_010681	CGA	2	6	193841	193846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010681	TCT	2	6	193853	193858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_010681	CGT	3	9	193867	193875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010681	GGCA	2	8	193916	193923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
608	NC_010681	ACG	2	6	193960	193965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010681	TTC	2	6	193986	193991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010681	CAGC	2	8	194063	194070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_010681	GC	4	8	194069	194076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_010681	GCC	2	6	194081	194086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_010681	CGC	2	6	194089	194094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_010681	GGC	2	6	194164	194169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010681	CCCA	2	8	194182	194189	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
616	NC_010681	GCG	2	6	194273	194278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010681	GAC	2	6	194325	194330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010681	AGG	2	6	194386	194391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010681	CG	3	6	194457	194462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_010681	GGC	2	6	194552	194557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010681	CTC	2	6	194590	194595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_010681	TCC	2	6	195398	195403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_010681	GTCT	2	8	195429	195436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_010681	GGA	2	6	195437	195442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010681	ACC	2	6	195457	195462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_010681	GATGC	2	10	195473	195482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
627	NC_010681	GCC	2	6	195625	195630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_010681	GGC	2	6	195650	195655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010681	GC	3	6	195654	195659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_010681	CCGCC	2	10	195758	195767	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
631	NC_010681	AGCC	2	8	195871	195878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
632	NC_010681	GAC	2	6	195900	195905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_010681	ATG	2	6	195916	195921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010681	CAT	2	6	195942	195947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_010681	CGA	2	6	195968	195973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_010681	TGGCGA	2	12	196052	196063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
637	NC_010681	TCG	2	6	196064	196069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_010681	CGA	2	6	196187	196192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_010681	AGA	2	6	196205	196210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010681	AGCGCC	2	12	196240	196251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
641	NC_010681	AGC	2	6	196299	196304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_010681	CCA	2	6	196328	196333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_010681	TGT	2	6	196396	196401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_010681	TCC	2	6	196444	196449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
645	NC_010681	TCC	2	6	196453	196458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_010681	AGA	2	6	196469	196474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_010681	TGG	2	6	196490	196495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
648	NC_010681	ACC	2	6	196510	196515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
649	NC_010681	GCA	3	9	196667	196675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_010681	TGCA	2	8	196678	196685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
651	NC_010681	AGC	2	6	196705	196710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_010681	GAG	2	6	196819	196824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
653	NC_010681	GAC	2	6	196875	196880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_010681	GC	3	6	196888	196893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
655	NC_010681	GGC	2	6	196922	196927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_010681	CAA	2	6	196940	196945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_010681	GTC	2	6	196955	196960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_010681	TG	3	6	196966	196971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
659	NC_010681	CGA	2	6	196996	197001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_010681	GGC	2	6	197090	197095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_010681	CGTGC	2	10	197133	197142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
663	NC_010681	CCGACG	2	12	197205	197216	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
664	NC_010681	CTG	2	6	197225	197230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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667	NC_010681	CGC	3	9	197304	197312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
668	NC_010681	CGCGA	2	10	197327	197336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
669	NC_010681	GC	3	6	197356	197361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
670	NC_010681	TCG	2	6	197386	197391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_010681	GCC	2	6	197437	197442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
672	NC_010681	CGC	2	6	197478	197483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
673	NC_010681	TGG	2	6	197485	197490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
674	NC_010681	CCG	2	6	197537	197542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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676	NC_010681	ATGCA	2	10	197681	197690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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678	NC_010681	ATT	2	6	197792	197797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
679	NC_010681	GAA	2	6	197883	197888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
680	NC_010681	CG	3	6	197901	197906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
681	NC_010681	GAT	2	6	197983	197988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
682	NC_010681	CGT	2	6	198014	198019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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684	NC_010681	AGA	2	6	200262	200267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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755	NC_010681	GACG	2	8	216675	216682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
756	NC_010681	CGAA	2	8	216701	216708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
757	NC_010681	GC	3	6	216712	216717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
758	NC_010681	CTTC	2	8	216789	216796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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761	NC_010681	TGA	2	6	216845	216850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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764	NC_010681	ATG	2	6	222380	222385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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768	NC_010681	CG	3	6	223110	223115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
769	NC_010681	TTC	2	6	223126	223131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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771	NC_010681	AGC	2	6	227210	227215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_010681	GTG	2	6	227236	227241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
773	NC_010681	GCGT	2	8	227249	227256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
774	NC_010681	TCGAC	2	10	232103	232112	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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780	NC_010681	GCA	2	6	235943	235948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_010681	GTA	2	6	235954	235959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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786	NC_010681	CCG	2	6	236115	236120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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908	NC_010681	CGA	2	6	257885	257890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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910	NC_010681	TCG	2	6	258019	258024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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912	NC_010681	CTG	2	6	258063	258068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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