MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010679	GGCA	2	8	8446	8453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010679	TGCC	2	8	8465	8472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010679	CACT	2	8	9919	9926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010679	TGCC	2	8	10026	10033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010679	CCGG	2	8	10190	10197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010679	TCAA	2	8	12026	12033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010679	AAGT	2	8	12689	12696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010679	AATT	2	8	16753	16760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010679	GCGG	2	8	20188	20195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010679	CAGA	2	8	22447	22454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010679	CAGA	2	8	23205	23212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010679	ATTC	2	8	23354	23361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010679	GACC	2	8	23615	23622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010679	CTAT	2	8	28890	28897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010679	TTGT	2	8	31132	31139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010679	GTTG	2	8	34263	34270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010679	GGTT	2	8	34618	34625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010679	GGCG	2	8	35569	35576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010679	GGCG	2	8	38726	38733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010679	CGGG	2	8	40513	40520	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010679	CGGC	2	8	41693	41700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010679	CAAT	2	8	41753	41760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010679	CGGC	2	8	43635	43642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010679	CAAT	2	8	43695	43702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010679	GGGC	2	8	44825	44832	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010679	CGGC	2	8	45080	45087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010679	CGGC	2	8	45310	45317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010679	CAAT	2	8	45370	45377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010679	GCCG	2	8	46676	46683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010679	GGCC	2	8	47097	47104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010679	CTGC	2	8	47130	47137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010679	GGAA	2	8	47250	47257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010679	GGCC	2	8	48688	48695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010679	CAAT	2	8	48747	48754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010679	CCGC	2	8	49555	49562	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_010679	CCGG	2	8	49695	49702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010679	AGGA	2	8	49930	49937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010679	CGGC	2	8	49941	49948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010679	CAAT	2	8	50001	50008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010679	TGAC	2	8	51718	51725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010679	CCGC	2	8	51856	51863	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010679	CCGG	2	8	51996	52003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010679	AGGA	2	8	52231	52238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010679	CGGC	2	8	52242	52249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010679	CAAT	2	8	52302	52309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010679	CCGC	2	8	59935	59942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_010679	CCGG	2	8	60075	60082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010679	AGGA	2	8	60310	60317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010679	CGGC	2	8	60321	60328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010679	CAAT	2	8	60381	60388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010679	GTTT	2	8	62403	62410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010679	GCTG	2	8	62445	62452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010679	GCCG	2	8	62525	62532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010679	CCGC	2	8	62589	62596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_010679	TTTC	2	8	64103	64110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010679	TGCG	2	8	64245	64252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010679	ATCA	2	8	73172	73179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010679	GGCA	2	8	98545	98552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010679	CGCA	2	8	98647	98654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010679	CAGA	2	8	103297	103304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010679	GGCC	2	8	105017	105024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010679	AAGG	2	8	108076	108083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010679	CATA	2	8	109401	109408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010679	GGCC	2	8	110465	110472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010679	GCCG	2	8	111652	111659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010679	GGCC	2	8	112711	112718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010679	GCCG	2	8	113718	113725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010679	TCCG	2	8	113986	113993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010679	GCCG	2	8	114156	114163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010679	CCCA	3	12	114260	114271	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_010679	CCGG	2	8	114275	114282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010679	CCCG	2	8	114456	114463	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_010679	CCCG	2	8	114510	114517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_010679	TTCC	2	8	115676	115683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010679	ACCT	2	8	115686	115693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010679	TTTC	2	8	117030	117037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010679	GCCG	2	8	117116	117123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010679	CGGC	2	8	118327	118334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010679	GCCG	2	8	119142	119149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010679	GTCG	2	8	119575	119582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010679	GGCG	2	8	120862	120869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010679	GAAA	2	8	120873	120880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.