MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH chromosome

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010673	AT	3	6	699	704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010673	TA	3	6	938	943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010673	TA	3	6	5516	5521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010673	AT	3	6	7682	7687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010673	AT	5	10	8670	8679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010673	AT	3	6	8688	8693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010673	TA	3	6	8705	8710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010673	TA	3	6	8723	8728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010673	AT	3	6	20344	20349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010673	TC	3	6	23516	23521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010673	CA	3	6	25393	25398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010673	TA	3	6	31975	31980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010673	TA	3	6	42655	42660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010673	TA	3	6	46361	46366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010673	CT	3	6	46606	46611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010673	TA	3	6	80482	80487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010673	AT	3	6	83658	83663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010673	TC	3	6	87054	87059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010673	TA	3	6	93825	93830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010673	TA	3	6	107945	107950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010673	AT	3	6	109369	109374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010673	TA	3	6	112699	112704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010673	CT	3	6	112806	112811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010673	AT	3	6	112973	112978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010673	TC	3	6	113042	113047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010673	TA	3	6	114869	114874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010673	CT	3	6	124839	124844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010673	TA	3	6	131829	131834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010673	TA	3	6	131921	131926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010673	AT	3	6	144605	144610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010673	CA	3	6	145855	145860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010673	AT	3	6	151197	151202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010673	AC	3	6	151211	151216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010673	GA	3	6	152559	152564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010673	AT	3	6	153375	153380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010673	TA	3	6	169877	169882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010673	TA	3	6	170221	170226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010673	AT	3	6	181616	181621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010673	AT	3	6	192305	192310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010673	TA	3	6	192400	192405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010673	TA	3	6	205469	205474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010673	TA	3	6	205480	205485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010673	AG	3	6	207758	207763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010673	TA	3	6	230745	230750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010673	CT	3	6	234734	234739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010673	TA	4	8	241529	241536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010673	AT	3	6	241585	241590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010673	TA	3	6	244993	244998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010673	AT	3	6	247829	247834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010673	TA	3	6	249262	249267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010673	TA	3	6	249293	249298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010673	TA	3	6	254231	254236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010673	AT	3	6	276353	276358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010673	AT	3	6	276361	276366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010673	AC	3	6	330459	330464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010673	TC	3	6	330729	330734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010673	CA	3	6	330746	330751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010673	GA	3	6	332226	332231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010673	AT	3	6	333614	333619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010673	TA	3	6	339092	339097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010673	TC	3	6	340938	340943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010673	TA	3	6	342952	342957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010673	AT	3	6	342986	342991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010673	AT	3	6	348412	348417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010673	AT	3	6	348428	348433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010673	TA	3	6	388423	388428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010673	AT	3	6	393804	393809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010673	TC	3	6	395964	395969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010673	TA	3	6	396052	396057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010673	CT	3	6	396094	396099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010673	TA	3	6	398214	398219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010673	AT	3	6	399181	399186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010673	AT	3	6	407291	407296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010673	CT	3	6	409750	409755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010673	CT	3	6	418982	418987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010673	AT	3	6	438519	438524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010673	TC	3	6	439679	439684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010673	GC	3	6	439685	439690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010673	TA	3	6	441052	441057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010673	AT	3	6	441469	441474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010673	AC	3	6	441554	441559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010673	TA	3	6	441610	441615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010673	AT	3	6	446695	446700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010673	GT	3	6	447418	447423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010673	GT	3	6	447587	447592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010673	AT	3	6	450702	450707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010673	AT	3	6	450714	450719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010673	AT	3	6	452493	452498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010673	AT	3	6	453179	453184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010673	TA	3	6	460141	460146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010673	TA	3	6	468670	468675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010673	AT	3	6	468682	468687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010673	AT	3	6	468692	468697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010673	TG	3	6	469864	469869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010673	TA	3	6	475319	475324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010673	TA	3	6	475836	475841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010673	GA	3	6	485444	485449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010673	TC	3	6	485525	485530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010673	GA	3	6	486623	486628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_010673	TA	3	6	499473	499478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010673	GT	3	6	504286	504291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010673	AT	3	6	537831	537836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010673	AT	4	8	554592	554599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010673	AG	3	6	554617	554622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010673	AG	3	6	558976	558981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010673	GA	3	6	559190	559195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010673	AT	3	6	559260	559265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010673	TG	3	6	562297	562302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010673	AT	3	6	589775	589780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010673	TA	3	6	592750	592755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010673	AT	3	6	595543	595548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010673	TA	4	8	595573	595580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010673	AG	3	6	598613	598618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010673	AT	3	6	609480	609485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010673	AG	3	6	609518	609523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010673	AT	3	6	610437	610442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010673	AT	3	6	619983	619988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010673	AT	3	6	619994	619999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010673	TA	3	6	627388	627393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010673	AT	3	6	627395	627400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010673	TA	3	6	630752	630757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010673	AT	3	6	635879	635884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010673	GT	3	6	641241	641246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010673	AT	3	6	642917	642922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010673	AT	4	8	642946	642953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_010673	TA	3	6	665827	665832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010673	AT	4	8	668516	668523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010673	TA	3	6	668546	668551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_010673	GA	4	8	682035	682042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010673	AT	3	6	682523	682528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010673	TA	3	6	682533	682538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010673	TA	3	6	694378	694383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010673	AT	3	6	696916	696921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_010673	AT	3	6	707196	707201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010673	AT	3	6	707204	707209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_010673	TA	3	6	736857	736862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.