MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH chromosome

Total Repeats: 842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010673	TTC	2	6	534	539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010673	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010673	CTA	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010673	TAA	2	6	800	805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010673	TAT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010673	AGA	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010673	TAA	2	6	909	914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010673	GAT	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010673	TAA	2	6	1008	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010673	ATT	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010673	TAA	2	6	3590	3595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010673	CTT	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010673	ATA	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010673	CTA	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010673	GAG	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010673	AAT	2	6	16037	16042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010673	CAA	2	6	16065	16070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010673	AAT	2	6	16117	16122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010673	ATT	3	9	20301	20309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010673	AAT	2	6	20323	20328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010673	TAA	2	6	22438	22443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010673	TAA	3	9	23136	23144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010673	TGC	2	6	23175	23180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010673	AAT	2	6	23181	23186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010673	TGA	2	6	23238	23243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010673	ATA	2	6	23249	23254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010673	ACT	2	6	23276	23281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010673	AAT	2	6	23476	23481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010673	TCA	2	6	23492	23497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010673	TTC	2	6	23636	23641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010673	CAT	2	6	25343	25348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010673	TAT	2	6	25366	25371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010673	TAA	2	6	25411	25416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010673	ATA	2	6	25432	25437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010673	AAT	2	6	29209	29214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010673	TTA	2	6	29242	29247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010673	TAC	2	6	31341	31346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010673	AGT	2	6	31360	31365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010673	TAT	2	6	37936	37941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010673	CAA	2	6	37948	37953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010673	AAC	2	6	39484	39489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010673	ATT	2	6	39545	39550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010673	TAA	2	6	39635	39640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010673	AAT	2	6	45166	45171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010673	TAT	2	6	45176	45181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010673	TAA	3	9	46204	46212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010673	ATG	2	6	46307	46312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010673	ATA	2	6	46379	46384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010673	ATA	2	6	46420	46425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010673	TAA	2	6	46465	46470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010673	CAG	2	6	46598	46603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010673	AGC	2	6	46621	46626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010673	TTA	2	6	46652	46657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010673	TTA	2	6	46668	46673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010673	AAG	2	6	46674	46679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010673	CTA	2	6	46712	46717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010673	AAT	2	6	46799	46804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010673	ACA	2	6	46817	46822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010673	TAA	2	6	46835	46840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010673	ATT	2	6	46848	46853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010673	ATT	2	6	49009	49014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010673	ATA	2	6	49021	49026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010673	TAA	2	6	49717	49722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010673	CTC	2	6	53094	53099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010673	TAT	2	6	53110	53115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010673	CTA	2	6	53116	53121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010673	ATT	2	6	53124	53129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010673	ATA	2	6	53132	53137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010673	TAT	2	6	56403	56408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010673	ATC	2	6	58704	58709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010673	AAT	2	6	62693	62698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010673	ACA	2	6	65389	65394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010673	AAT	2	6	72241	72246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010673	AAT	2	6	79111	79116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010673	ATA	2	6	80500	80505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010673	TTG	2	6	80570	80575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010673	ATT	2	6	83555	83560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010673	ATA	2	6	83574	83579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010673	ACA	2	6	83582	83587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010673	AAT	2	6	83612	83617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010673	AAT	2	6	83685	83690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010673	ATT	2	6	83695	83700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010673	AAT	2	6	85493	85498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010673	ATT	2	6	93799	93804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010673	TAA	2	6	98288	98293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010673	AGG	2	6	99772	99777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010673	AAT	2	6	100993	100998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010673	ATC	2	6	101103	101108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010673	TTA	2	6	101144	101149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010673	TTA	2	6	101250	101255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010673	CAA	2	6	109376	109381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010673	GAT	2	6	109405	109410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010673	ATA	2	6	109453	109458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010673	TAA	2	6	109479	109484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010673	ATC	2	6	109498	109503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010673	ATA	2	6	109537	109542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010673	TCT	2	6	111442	111447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010673	CCT	2	6	112201	112206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010673	ATT	2	6	112686	112691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010673	TAC	2	6	112788	112793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010673	ATG	2	6	112826	112831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010673	ATC	2	6	112909	112914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010673	TAA	2	6	112945	112950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010673	TAA	2	6	113061	113066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010673	AAT	2	6	115047	115052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010673	CCT	2	6	119221	119226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010673	CCT	2	6	120874	120879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010673	TTA	2	6	130829	130834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010673	TAA	2	6	131845	131850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010673	CTA	2	6	133118	133123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010673	ATA	2	6	134610	134615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010673	CTA	2	6	138495	138500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010673	AAT	2	6	138657	138662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010673	CCT	2	6	139024	139029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010673	AAT	2	6	144583	144588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010673	TAT	2	6	144597	144602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010673	AAC	2	6	144619	144624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010673	ATA	2	6	144629	144634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010673	ATA	2	6	144637	144642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010673	CTA	2	6	145848	145853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010673	TCC	2	6	149038	149043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010673	ACA	2	6	151155	151160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010673	ATT	2	6	151205	151210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010673	CTA	2	6	151227	151232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010673	AAC	2	6	151240	151245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010673	ATA	2	6	153463	153468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010673	CTC	2	6	154084	154089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010673	AAT	2	6	156812	156817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010673	ATA	2	6	156837	156842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010673	ATA	2	6	158939	158944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010673	ATA	3	9	163687	163695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010673	ATT	2	6	166611	166616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010673	ATT	2	6	166624	166629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010673	ATT	2	6	168216	168221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010673	TAT	2	6	168253	168258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010673	CCT	2	6	169835	169840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_010673	ATA	2	6	169841	169846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010673	ATG	2	6	169938	169943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010673	AGG	2	6	169984	169989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010673	TCA	2	6	177610	177615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_010673	AAG	2	6	187323	187328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_010673	CTT	2	6	192267	192272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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