MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY02

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010627	CCGG	2	8	263	270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010627	GGCT	2	8	394	401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010627	GAAA	2	8	846	853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010627	GAGC	2	8	980	987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010627	TGGT	2	8	1280	1287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010627	CAAC	2	8	1444	1451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010627	GGCC	2	8	1882	1889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010627	CCTA	2	8	1967	1974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010627	GAAC	2	8	2123	2130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010627	CCGA	2	8	2301	2308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010627	GGCG	2	8	2540	2547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010627	TACT	2	8	2731	2738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010627	GGGC	2	8	2836	2843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010627	ACGA	2	8	2930	2937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010627	GCAC	2	8	3285	3292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010627	GCCG	2	8	3396	3403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010627	TACA	2	8	3404	3411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010627	CCTG	2	8	3435	3442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010627	GGCG	2	8	9521	9528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010627	AACG	2	8	17738	17745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010627	GTTC	2	8	19587	19594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010627	TCGA	2	8	19652	19659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010627	TCCA	2	8	20083	20090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010627	TCGA	2	8	22209	22216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010627	GACG	2	8	25870	25877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010627	CGAA	2	8	26279	26286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010627	TGCC	2	8	26387	26394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010627	GCGA	2	8	26472	26479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010627	CTCC	2	8	26808	26815	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_010627	CCTG	2	8	26830	26837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010627	GCCC	2	8	26888	26895	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_010627	GGGC	2	8	27109	27116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010627	TGCC	2	8	28628	28635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010627	TTCA	2	8	29032	29039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010627	ATAG	2	8	34734	34741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010627	CGAC	2	8	34772	34779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010627	TGCA	2	8	34815	34822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010627	CGCC	2	8	36072	36079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_010627	GTTC	2	8	36168	36175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010627	TGCT	2	8	36310	36317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010627	GGAT	2	8	36928	36935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010627	GCAG	2	8	39987	39994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010627	GCTG	2	8	40444	40451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010627	GATC	2	8	40754	40761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010627	CGGG	2	8	41339	41346	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010627	ATGC	2	8	41995	42002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010627	ATCG	2	8	42121	42128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010627	CGCA	2	8	42300	42307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010627	GAAG	2	8	43829	43836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010627	GCGG	2	8	43853	43860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010627	CCCG	2	8	44035	44042	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_010627	CGCC	2	8	44129	44136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_010627	TGAA	2	8	44619	44626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010627	GAAC	2	8	45460	45467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010627	CCTG	2	8	46535	46542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010627	GGAC	2	8	52495	52502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010627	CGTC	2	8	54807	54814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010627	CTGA	2	8	55191	55198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010627	CATC	2	8	56515	56522	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010627	TCAG	2	8	61403	61410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010627	CGTT	2	8	62836	62843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010627	GGTC	2	8	63961	63968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010627	TCGC	2	8	77301	77308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010627	GCCA	2	8	86397	86404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010627	CCAT	2	8	88081	88088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010627	TGGC	2	8	92199	92206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010627	CATC	2	8	92211	92218	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010627	TGAC	2	8	97843	97850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010627	GGAT	2	8	97947	97954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010627	CCGG	2	8	98765	98772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010627	CTGA	2	8	98805	98812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010627	TTCC	2	8	101927	101934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010627	TCTT	2	8	101958	101965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010627	GCCA	2	8	109438	109445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010627	TCCG	2	8	113399	113406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010627	TAAC	2	8	113618	113625	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010627	CTGT	2	8	124533	124540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010627	CACC	2	8	124936	124943	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_010627	ATGC	2	8	125072	125079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010627	TCGT	2	8	125242	125249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010627	TGAC	2	8	125405	125412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010627	GCAC	2	8	127581	127588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010627	GCAG	2	8	131336	131343	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010627	GGCC	2	8	131859	131866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010627	AAGC	2	8	131912	131919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010627	TGCT	2	8	133421	133428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010627	CGGG	2	8	133802	133809	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010627	TCGG	2	8	133933	133940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010627	TGCC	2	8	133965	133972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010627	CGCA	2	8	135470	135477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010627	TTCT	2	8	135584	135591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010627	ACCC	2	8	136570	136577	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_010627	AACC	2	8	136711	136718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010627	ATGG	2	8	137113	137120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010627	TTCG	2	8	137335	137342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010627	GAGC	2	8	137776	137783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010627	GAAG	2	8	138605	138612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010627	CAAG	2	8	139467	139474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010627	TGCA	2	8	139959	139966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010627	AAAT	2	8	140656	140663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010627	CTGT	2	8	140685	140692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010627	CGAA	2	8	140789	140796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010627	GATT	2	8	141930	141937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010627	TCGT	2	8	141981	141988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010627	TGAC	2	8	147352	147359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010627	GTTG	2	8	148382	148389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010627	AGAA	2	8	148601	148608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010627	ATCC	2	8	151232	151239	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010627	CAGC	2	8	152955	152962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010627	GTGA	2	8	159915	159922	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010627	GTCG	2	8	160444	160451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010627	GAAG	2	8	160519	160526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010627	ATGG	2	8	160637	160644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010627	GGCA	2	8	163638	163645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010627	TTCG	2	8	163746	163753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010627	TGTC	2	8	169021	169028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010627	GGCA	2	8	171777	171784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010627	TGGC	2	8	171868	171875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010627	GCAC	2	8	172770	172777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010627	TCAT	2	8	172829	172836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010627	TGAT	2	8	173216	173223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010627	GCGT	2	8	173333	173340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010627	CTTT	2	8	174165	174172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010627	TCGT	2	8	174183	174190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010627	GAGC	2	8	174830	174837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010627	TGTT	2	8	175372	175379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010627	TCCG	2	8	179792	179799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010627	TGTC	2	8	180125	180132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010627	GAGC	2	8	180304	180311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010627	CGGC	2	8	180326	180333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010627	TCTG	2	8	181127	181134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010627	GGCG	2	8	181421	181428	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010627	AGAA	2	8	183729	183736	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010627	CGGC	2	8	184602	184609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010627	CGAC	2	8	187730	187737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010627	TCAA	2	8	189298	189305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010627	TATC	2	8	190193	190200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010627	AGGT	2	8	190313	190320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010627	AGCC	2	8	193370	193377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010627	CAGC	2	8	193466	193473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010627	CGTC	2	8	193998	194005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010627	CAGC	2	8	195364	195371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010627	GTGG	2	8	195794	195801	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010627	TGCG	2	8	196427	196434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010627	GCGG	2	8	196828	196835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010627	CCGA	2	8	200032	200039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010627	GCCT	2	8	201192	201199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010627	CGTT	2	8	201464	201471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010627	AACA	2	8	203977	203984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010627	CAGG	2	8	204994	205001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010627	CTGT	2	8	205588	205595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010627	ACCC	2	8	205638	205645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
153	NC_010627	CGTT	2	8	209821	209828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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260	NC_010627	TGCG	2	8	348369	348376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
261	NC_010627	GAGC	2	8	350179	350186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_010627	GGAT	2	8	353265	353272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_010627	CCTT	2	8	404812	404819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.