MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY02

Total Repeats: 3491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010627	CA	3	6	492066	492071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_010627	AGA	2	6	496282	496287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_010627	AGC	2	6	496303	496308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_010627	CTGG	2	8	496330	496337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_010627	TG	3	6	496436	496441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010627	GAT	2	6	496471	496476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010627	GATTA	2	10	496481	496490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010627	GGC	2	6	496553	496558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_010627	ATG	2	6	496562	496567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010627	GCGG	2	8	496668	496675	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_010627	TCGC	2	8	496759	496766	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_010627	AT	3	6	497854	497859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010627	CAA	2	6	497931	497936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010627	TCG	2	6	497975	497980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_010627	TC	3	6	498001	498006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_010627	GCAGT	2	10	498093	498102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_010627	GA	3	6	498107	498112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010627	A	6	6	498124	498129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010627	TAA	2	6	498233	498238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010627	GTA	2	6	498282	498287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010627	T	6	6	498298	498303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010627	GC	3	6	498319	498324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_010627	GTT	2	6	498337	498342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010627	CGT	2	6	498397	498402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_010627	GAT	2	6	500231	500236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010627	GAC	2	6	500243	500248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_010627	TCG	2	6	500319	500324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_010627	CAGC	2	8	503236	503243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_010627	GGC	2	6	503716	503721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_010627	GACACT	2	12	504933	504944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_010627	TAC	2	6	504996	505001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_010627	GAT	2	6	505512	505517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010627	TTA	2	6	510858	510863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010627	TAA	2	6	510864	510869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010627	CCG	2	6	511087	511092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_010627	GAG	2	6	511101	511106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010627	GGCA	2	8	512723	512730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_010627	ATC	2	6	512765	512770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_010627	AGCC	2	8	514796	514803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_010627	GA	3	6	514813	514818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010627	GA	3	6	515430	515435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010627	CAG	2	6	515478	515483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_010627	TGG	2	6	515547	515552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010627	CTAT	2	8	515665	515672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_010627	GGC	2	6	515680	515685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_010627	AGC	2	6	515686	515691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_010627	GCC	2	6	515709	515714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_010627	TGC	3	9	515722	515730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_010627	CGG	2	6	517482	517487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_010627	CGA	2	6	517510	517515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_010627	CG	3	6	517554	517559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_010627	AGA	3	9	517589	517597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010627	GCG	2	6	518597	518602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_010627	CGTG	2	8	521739	521746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_010627	GTGCGC	2	12	521785	521796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_010627	CGG	2	6	521891	521896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_010627	AAG	2	6	521931	521936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010627	GCCC	2	8	521968	521975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3059	NC_010627	CGG	2	6	521983	521988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010627	CGG	2	6	522138	522143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_010627	CCGCGC	2	12	522145	522156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_010627	GCG	2	6	522199	522204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_010627	GCG	2	6	522223	522228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_010627	AAG	2	6	527769	527774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010627	CGT	2	6	527778	527783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_010627	GTT	3	9	528065	528073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010627	GTC	2	6	528087	528092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_010627	CAC	2	6	528174	528179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_010627	GTA	2	6	528180	528185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010627	TG	3	6	528192	528197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010627	GTG	2	6	528220	528225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010627	AGC	2	6	528261	528266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_010627	TGG	2	6	528306	528311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010627	TGAA	2	8	528365	528372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_010627	GTC	2	6	528431	528436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_010627	GGAT	2	8	528443	528450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_010627	GCT	2	6	528461	528466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_010627	GCA	2	6	530828	530833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_010627	GCC	2	6	530863	530868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_010627	GTA	2	6	530903	530908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010627	ATG	2	6	533599	533604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010627	CGT	2	6	533722	533727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_010627	CACGC	2	10	533764	533773	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3084	NC_010627	TC	3	6	533793	533798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_010627	GA	3	6	533804	533809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010627	CGG	2	6	533864	533869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_010627	GCG	2	6	534008	534013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_010627	GAA	2	6	534028	534033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010627	GAA	2	6	534052	534057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010627	CGG	2	6	534116	534121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_010627	GCG	2	6	534201	534206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_010627	AAC	2	6	534261	534266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_010627	TCG	2	6	534343	534348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_010627	TGC	2	6	534410	534415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_010627	CG	3	6	534433	534438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_010627	CTG	2	6	534439	534444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_010627	GCA	2	6	534467	534472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_010627	GC	3	6	534479	534484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_010627	GCC	2	6	535670	535675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_010627	AAG	2	6	535881	535886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010627	ACT	2	6	535977	535982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_010627	ATAGC	2	10	535987	535996	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3103	NC_010627	CGAA	2	8	535997	536004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_010627	CGG	2	6	536026	536031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_010627	CGA	2	6	536078	536083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_010627	GCCA	2	8	536084	536091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_010627	GC	3	6	536114	536119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_010627	ACC	2	6	536126	536131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_010627	CAG	2	6	536169	536174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_010627	GTG	2	6	536175	536180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010627	CG	3	6	536238	536243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_010627	CAGT	2	8	536262	536269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_010627	ACG	2	6	536305	536310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_010627	TGC	2	6	537649	537654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_010627	CAT	2	6	537670	537675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_010627	CCT	2	6	539149	539154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_010627	TGC	2	6	542337	542342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_010627	GTCG	2	8	542350	542357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_010627	A	6	6	542409	542414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010627	CAAA	2	8	542471	542478	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_010627	ACG	2	6	543356	543361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_010627	TCA	2	6	543565	543570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_010627	TGG	2	6	543732	543737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010627	GCTGC	2	10	543742	543751	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3125	NC_010627	CAAT	2	8	543761	543768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_010627	ATG	2	6	543871	543876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010627	GCG	2	6	543975	543980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_010627	ACCG	2	8	544127	544134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_010627	GT	3	6	545160	545165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010627	GAA	2	6	545188	545193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010627	TGC	2	6	545260	545265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_010627	AGGA	2	8	545351	545358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010627	GCG	2	6	545425	545430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_010627	GCA	2	6	545436	545441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3263	NC_010627	ATG	2	6	560708	560713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3401	NC_010627	GCA	2	6	583975	583980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3402	NC_010627	ACC	2	6	584002	584007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3403	NC_010627	GCA	2	6	584021	584026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3404	NC_010627	ATC	2	6	584047	584052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3405	NC_010627	CA	3	6	584066	584071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3406	NC_010627	TCCT	3	12	584115	584126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3407	NC_010627	TCAC	2	8	584127	584134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3423	NC_010627	CGA	2	6	587045	587050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3432	NC_010627	TCG	2	6	588198	588203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3433	NC_010627	TACA	2	8	588262	588269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3434	NC_010627	GGC	2	6	588675	588680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3440	NC_010627	CCA	2	6	588832	588837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3442	NC_010627	TGT	2	6	588913	588918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3446	NC_010627	GCT	2	6	590534	590539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3448	NC_010627	GCG	2	6	590660	590665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3462	NC_010627	CGT	2	6	592383	592388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.