MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY01

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010625	CGATTT	2	12	14905	14916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010625	ATCGAC	2	12	77349	77360	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010625	ACAGCC	14	84	77377	77460	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010625	TCGTTC	2	12	86776	86787	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010625	GCAAAA	2	12	88984	88995	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010625	GGCAAG	2	12	109085	109096	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010625	TCTGAC	2	12	114168	114179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010625	ATCTGC	2	12	160478	160489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010625	GTCGCC	2	12	168162	168173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010625	GCTTCG	2	12	185096	185107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010625	CGCATC	2	12	218001	218012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010625	GCTTTT	3	18	225393	225410	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010625	AACAAA	2	12	239391	239402	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010625	GTCGGC	2	12	253775	253786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010625	GTCGAG	2	12	254138	254149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010625	CGGGTC	2	12	257052	257063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010625	CGACGT	2	12	329812	329823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010625	CGCCCG	2	12	337822	337833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010625	GTCCAT	2	12	339794	339805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010625	TCCGCA	2	12	339971	339982	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010625	TCGCCT	2	12	367152	367163	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010625	TCGTAG	2	12	380208	380219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010625	TATGCA	2	12	383400	383411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010625	TTGCCG	2	12	383844	383855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010625	ATCAGT	2	12	386130	386141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010625	GTTTCG	2	12	387136	387147	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010625	TGCGCC	2	12	389670	389681	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010625	GCCTGC	2	12	389682	389693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010625	GCACCA	2	12	389821	389832	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010625	GCACCA	3	18	389836	389853	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010625	GCACCC	2	12	389893	389904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010625	ACCAGC	4	24	389925	389948	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010625	CCAGAG	3	18	389950	389967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010625	CCAGAG	2	12	389974	389985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010625	CCAGAG	2	12	389992	390003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010625	GCACCC	4	24	390163	390186	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010625	GCACCA	2	12	390187	390198	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010625	GCGACG	2	12	390683	390694	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010625	TGCGAC	2	12	420107	420118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010625	AATCGG	2	12	539158	539169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010625	CGCTCG	2	12	541134	541145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010625	ACCAGC	2	12	544231	544242	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010625	CCAGCG	2	12	544554	544565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010625	CAGGCG	2	12	617921	617932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010625	TCGCCA	2	12	617956	617967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010625	CGTTGG	2	12	706314	706325	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010625	GGTCCA	2	12	731262	731273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010625	TGCCAT	2	12	731565	731576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010625	GAGGGC	2	12	733367	733378	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010625	TGCGCC	2	12	771417	771428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010625	CCCCTT	2	12	776418	776429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010625	TGCTTC	2	12	823323	823334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010625	CATGGC	2	12	825901	825912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010625	AATGCG	2	12	827215	827226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010625	GCCCCC	2	12	856475	856486	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
56	NC_010625	GCTCAT	2	12	858269	858280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010625	CGCCGA	2	12	862180	862191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010625	GCGACG	2	12	863748	863759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010625	CACCGG	2	12	920718	920729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010625	CCCTTT	2	12	934910	934921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010625	GGCGCG	2	12	941532	941543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010625	GAAAAA	2	12	950086	950097	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010625	AAATCG	2	12	956477	956488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010625	ACACCG	2	12	973141	973152	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010625	GCAGCC	2	12	986284	986295	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010625	TCGCAT	2	12	989636	989647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010625	TTGCGC	2	12	991670	991681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010625	CGGCGC	2	12	996868	996879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010625	GGCAGC	2	12	1096351	1096362	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010625	TTGCGT	2	12	1133376	1133387	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010625	CCGGTT	2	12	1237756	1237767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010625	GCACTC	6	36	1238835	1238870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010625	TGGGAT	2	12	1240032	1240043	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010625	TTCGCG	2	12	1246999	1247010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010625	TCAGCT	2	12	1281664	1281675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010625	GAGCAA	2	12	1298797	1298808	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010625	ATTGAA	2	12	1307429	1307440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010625	CGACAT	2	12	1317693	1317704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010625	GACAAC	2	12	1333014	1333025	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010625	GCGTCG	2	12	1334248	1334259	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010625	CGGCGT	2	12	1358698	1358709	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010625	CATGAT	2	12	1399262	1399273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010625	GTCGGC	2	12	1401428	1401439	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010625	GATTGA	2	12	1402615	1402626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010625	GATGGT	2	12	1440397	1440408	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010625	TCGCCT	2	12	1457775	1457786	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010625	GCTGGC	2	12	1463100	1463111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010625	TCCGCG	2	12	1466099	1466110	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010625	GTCATC	2	12	1535996	1536007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010625	AAATCT	2	12	1580571	1580582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010625	AGCGAG	2	12	1590413	1590424	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010625	CTCGCC	2	12	1590507	1590518	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010625	GTCTGC	2	12	1660286	1660297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010625	CACCGC	2	12	1671479	1671490	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010625	CCGTGC	2	12	1693415	1693426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010625	CGTCAC	2	12	1707690	1707701	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010625	GGGGCG	2	12	1738249	1738260	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010625	CGTCAT	2	12	1739703	1739714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010625	TTAAAT	2	12	1747683	1747694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010625	TCGGCA	2	12	1761638	1761649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010625	AAAGCG	2	12	1788866	1788877	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010625	CAGCGG	2	12	1853054	1853065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010625	CCGCGG	2	12	1862639	1862650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010625	TCGCGC	2	12	1863244	1863255	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010625	GGCAAG	2	12	1879329	1879340	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.