MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY01

Total Repeats: 6312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010625	TTTC	2	8	408020	408027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_010625	CGG	2	6	408060	408065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_010625	GCG	2	6	408079	408084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_010625	GGC	2	6	408118	408123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_010625	GTC	2	6	409303	409308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_010625	GTG	2	6	409364	409369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010625	GCG	3	9	409377	409385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010625	CTC	2	6	409426	409431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_010625	TAG	2	6	409434	409439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010625	CGC	2	6	409474	409479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_010625	CG	3	6	409598	409603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_010625	CGG	2	6	409651	409656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_010625	GCA	2	6	409994	409999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010625	AGT	2	6	410785	410790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010625	GTCGG	2	10	411701	411710	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_010625	TGA	2	6	411740	411745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010625	ATCT	2	8	411753	411760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_010625	GGC	2	6	412713	412718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010625	CAA	3	9	414689	414697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010625	TCA	2	6	414725	414730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_010625	CG	3	6	415026	415031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_010625	CGA	2	6	415055	415060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_010625	GCG	2	6	415187	415192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_010625	TG	3	6	415196	415201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010625	CAC	2	6	415238	415243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_010625	ATG	2	6	415829	415834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010625	CGT	2	6	416341	416346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_010625	GGC	2	6	416361	416366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_010625	GCC	2	6	416378	416383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_010625	GC	4	8	416407	416414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_010625	GGC	2	6	416439	416444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_010625	TGC	2	6	416555	416560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_010625	CGC	2	6	416641	416646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_010625	CACGT	2	10	419431	419440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1535	NC_010625	TA	3	6	419737	419742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010625	TTGCA	2	10	419784	419793	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_010625	ACC	2	6	419857	419862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_010625	CGA	2	6	419875	419880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_010625	GCAC	2	8	419938	419945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_010625	ATC	2	6	419961	419966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_010625	TCG	2	6	419978	419983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_010625	TGT	2	6	419997	420002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010625	GCC	2	6	420057	420062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_010625	GTCG	2	8	420078	420085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_010625	TGCGAC	2	12	420107	420118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_010625	AGC	2	6	420208	420213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_010625	CGC	2	6	420227	420232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_010625	CGG	2	6	420257	420262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_010625	CGT	2	6	420284	420289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_010625	CGT	2	6	420295	420300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010625	TTC	2	6	420347	420352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_010625	GAA	2	6	420370	420375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010625	CGG	2	6	420418	420423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_010625	GCG	2	6	420450	420455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_010625	CGG	2	6	424751	424756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_010625	CGGA	2	8	424839	424846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_010625	CGC	2	6	424847	424852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_010625	GC	3	6	424885	424890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_010625	ATC	2	6	424998	425003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_010625	TTG	2	6	427293	427298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010625	GCTG	2	8	427309	427316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_010625	CGGC	2	8	427398	427405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_010625	ACCT	2	8	427452	427459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_010625	CTTC	2	8	427470	427477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_010625	GT	3	6	427506	427511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010625	CCG	2	6	427556	427561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_010625	TGC	2	6	427591	427596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_010625	TTC	2	6	427614	427619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_010625	GCG	2	6	428067	428072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_010625	CGG	2	6	428089	428094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_010625	GAA	2	6	428150	428155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010625	A	7	7	428154	428160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010625	GACC	2	8	428209	428216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_010625	TGA	2	6	428245	428250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010625	GGT	3	9	428633	428641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010625	CGAT	2	8	428661	428668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_010625	GCC	2	6	428702	428707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_010625	ACC	2	6	428737	428742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_010625	CCG	2	6	428754	428759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_010625	CCGA	2	8	428832	428839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_010625	ACC	2	6	428858	428863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_010625	AGC	2	6	428879	428884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010625	CGC	2	6	429318	429323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_010625	GCA	2	6	429625	429630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_010625	ATG	2	6	429647	429652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_010625	CGGCG	2	10	429660	429669	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1587	NC_010625	CGC	2	6	430372	430377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_010625	GC	5	10	430390	430399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_010625	CGC	2	6	430438	430443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_010625	CGG	2	6	430448	430453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_010625	TC	3	6	431153	431158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_010625	CGT	2	6	431218	431223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_010625	TGC	2	6	431253	431258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_010625	GC	3	6	431257	431262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_010625	CTTC	2	8	431263	431270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_010625	CG	3	6	431308	431313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_010625	CGG	2	6	431345	431350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_010625	AGGT	2	8	431358	431365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010625	A	7	7	431408	431414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010625	TGT	2	6	431452	431457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_010625	GCC	2	6	432390	432395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_010625	CG	3	6	432397	432402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_010625	AGT	2	6	437583	437588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010625	GAG	2	6	439024	439029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010625	CTT	2	6	444403	444408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010625	GGC	2	6	444435	444440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_010625	GCC	2	6	444447	444452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_010625	CG	3	6	448339	448344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_010625	TG	3	6	448356	448361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010625	TCG	2	6	450524	450529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_010625	GC	3	6	451522	451527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_010625	TTGA	2	8	452835	452842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010625	CT	3	6	454195	454200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_010625	TG	3	6	454201	454206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010625	CGGA	2	8	454333	454340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_010625	GCG	2	6	460294	460299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_010625	GTTC	2	8	460301	460308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_010625	GTT	2	6	466455	466460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010625	CGC	2	6	466485	466490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_010625	CTT	2	6	466589	466594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_010625	TTC	2	6	466604	466609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_010625	GC	3	6	467057	467062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_010625	AGCC	2	8	467064	467071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_010625	GC	4	8	473230	473237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_010625	CGTC	2	8	473258	473265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_010625	GAAG	2	8	473269	473276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010625	TC	3	6	474354	474359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_010625	GCAA	2	8	474395	474402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_010625	ACGA	2	8	476460	476467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_010625	ATT	2	6	479399	479404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_010625	ATG	2	6	479434	479439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010625	GC	3	6	479483	479488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_010625	GCG	3	9	479527	479535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_010625	GCG	2	6	479555	479560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_010625	GC	3	6	479564	479569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_010625	GACCA	2	10	480245	480254	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1637	NC_010625	CCGGC	2	10	480265	480274	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1638	NC_010625	GCG	2	6	480292	480297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_010625	A	6	6	480387	480392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1640	NC_010625	GCGT	2	8	480412	480419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1641	NC_010625	ATG	2	6	480432	480437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1643	NC_010625	GT	3	6	483768	483773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1646	NC_010625	GGCG	2	8	488332	488339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1648	NC_010625	CG	3	6	488412	488417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1649	NC_010625	GCC	2	6	488434	488439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1650	NC_010625	GCT	2	6	489596	489601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1653	NC_010625	CGG	2	6	489787	489792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1654	NC_010625	GC	3	6	489918	489923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1655	NC_010625	T	6	6	489973	489978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1682	NC_010625	GAC	3	9	503996	504004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1768	NC_010625	TGA	2	6	539399	539404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1770	NC_010625	CTC	2	6	539453	539458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1908	NC_010625	GAC	2	6	603752	603757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1910	NC_010625	CGG	2	6	603914	603919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1911	NC_010625	CA	3	6	603931	603936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1913	NC_010625	CGCTG	2	10	604055	604064	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2000	NC_010625	CG	3	6	635495	635500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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