MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 chromosome 2

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010623	CAGACC	2	12	77342	77353	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010623	TTCCCA	2	12	77354	77365	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010623	ACGCAC	2	12	101872	101883	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010623	CGTGAT	2	12	102611	102622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010623	ATCGAC	2	12	147521	147532	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010623	AGTCAT	2	12	156645	156656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010623	TGCGTA	2	12	187331	187342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010623	AACGAC	2	12	213968	213979	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010623	TACGGT	2	12	219241	219252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010623	CGCAGT	2	12	224162	224173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010623	CAAGCG	2	12	257419	257430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010623	TTTTGC	3	18	307148	307165	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010623	ACCGCT	2	12	342677	342688	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010623	GATCGT	2	12	381673	381684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010623	GTTTTG	2	12	410469	410480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010623	TCCCAG	2	12	467014	467025	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010623	TTCGCT	2	12	485910	485921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010623	GATCAG	2	12	488220	488231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010623	ACCATC	2	12	488356	488367	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010623	ACGAAA	2	12	509910	509921	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010623	AAGTAC	2	12	511351	511362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010623	CGATGC	2	12	543318	543329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010623	GCTTTC	3	18	570105	570122	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010623	AAACCG	2	12	570790	570801	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010623	GACCGT	2	12	576721	576732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010623	CAGCGT	2	12	584708	584719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010623	CACGAC	2	12	585090	585101	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010623	ACGGGA	2	12	586550	586561	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010623	CTTCCT	2	12	589569	589580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010623	TGCGCT	2	12	596969	596980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010623	CATCGC	2	12	597978	597989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010623	GGAATG	2	12	604630	604641	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010623	AGCAAC	2	12	615763	615774	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010623	GGGCGC	2	12	646688	646699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010623	AGCGGA	2	12	704461	704472	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010623	CGCGCA	2	12	790577	790588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010623	TTGTGA	2	12	828584	828595	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010623	CGACCT	2	12	850559	850570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010623	TTTGGC	2	12	919130	919141	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010623	GAGGGC	2	12	946883	946894	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010623	ACGTCG	2	12	958800	958811	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010623	ATGCGT	4	24	973395	973418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010623	CCTCTC	2	12	1081972	1081983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010623	GCGGCA	2	12	1133362	1133373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010623	GAATGA	2	12	1152988	1152999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010623	CGCCGT	2	12	1155187	1155198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010623	AACGAA	2	12	1165255	1165266	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010623	GCGCAA	2	12	1191937	1191948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010623	GCGTGC	2	12	1201885	1201896	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010623	CCAACG	2	12	1247199	1247210	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010623	CTTCGC	2	12	1267970	1267981	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010623	GCGTTT	2	12	1286857	1286868	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010623	TGGTTT	2	12	1293196	1293207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010623	GGGCCG	2	12	1322111	1322122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010623	GCCGTT	2	12	1366108	1366119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010623	AGCGAA	6	36	1436743	1436778	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010623	CAAAAC	2	12	1436781	1436792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010623	ACCAAA	2	12	1436831	1436842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010623	GCGCGA	3	18	1468655	1468672	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010623	CCGCAG	2	12	1473656	1473667	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010623	TGATTC	2	12	1490773	1490784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010623	AGCAAA	11	66	1494739	1494804	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010623	TGCTTT	2	12	1502225	1502236	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010623	GCGCTG	2	12	1507629	1507640	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010623	GACGTG	2	12	1646250	1646261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010623	CGAGGC	2	12	1660572	1660583	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010623	GCGCTC	2	12	1681779	1681790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010623	CAAAGG	2	12	1725927	1725938	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010623	TGGCAT	2	12	1749625	1749636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010623	ACTGTC	2	12	1786450	1786461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010623	CGCGGC	2	12	1789180	1789191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010623	TGGTTT	2	12	1791227	1791238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010623	CGCTTT	2	12	1791239	1791250	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010623	TTTCGC	2	12	1791254	1791265	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010623	AACCAA	2	12	1808910	1808921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010623	ACGCAC	2	12	1815394	1815405	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010623	TACAGG	2	12	1838905	1838916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010623	GACGCG	2	12	1875169	1875180	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010623	CGATGC	2	12	1877609	1877620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010623	ATCGTC	2	12	1883216	1883227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010623	TTTTCG	2	12	1933948	1933959	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010623	GAATAA	2	12	1957004	1957015	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010623	ACGGTC	2	12	1985975	1985986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010623	AACTTC	2	12	1994766	1994777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010623	CAAATA	2	12	2022127	2022138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010623	GCGGCA	2	12	2026112	2026123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010623	GCCTTG	2	12	2075310	2075321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010623	ACGGAA	2	12	2099067	2099078	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010623	GGTCGA	2	12	2154351	2154362	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010623	CCGGTG	2	12	2220285	2220296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010623	GCAAAA	4	24	2227859	2227882	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010623	ATCGAT	2	12	2236912	2236923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010623	GCATCC	2	12	2368437	2368448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010623	GGAAGG	2	12	2385568	2385579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010623	TCGCGA	2	12	2430677	2430688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010623	TCCTTT	2	12	2502350	2502361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010623	ACCATT	2	12	2512552	2512563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010623	TACCGT	2	12	2533250	2533261	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010623	GGCGCG	2	12	2600937	2600948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010623	CGAGCG	2	12	2664128	2664139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010623	CGTCGC	2	12	2683532	2683543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010623	CGCTGT	2	12	2685660	2685671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.