MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 chromosome 2

Total Repeats: 1258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010623	CTTG	2	8	634	641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010623	CGGC	2	8	7278	7285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010623	TGCG	2	8	8708	8715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010623	GCGT	2	8	10372	10379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010623	GCGG	2	8	10464	10471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010623	TGAA	2	8	10478	10485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010623	GCCG	2	8	12668	12675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010623	TCGT	2	8	13915	13922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010623	AGTG	2	8	14105	14112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010623	CGGC	2	8	14254	14261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010623	CGGC	2	8	14611	14618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010623	GTCA	2	8	23714	23721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010623	CTTT	2	8	25629	25636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010623	TTTC	2	8	25648	25655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010623	TGTC	2	8	25770	25777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010623	GCCT	2	8	26268	26275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010623	GCCA	2	8	39089	39096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010623	CGGG	2	8	39101	39108	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010623	CGCC	2	8	46032	46039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_010623	CGAT	2	8	54948	54955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010623	ATTC	2	8	54961	54968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010623	GTGC	2	8	62206	62213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010623	AAGG	2	8	62242	62249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010623	CTGC	2	8	62511	62518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010623	GCCC	2	8	62745	62752	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_010623	TCCG	2	8	67279	67286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010623	CCGA	2	8	67654	67661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010623	GCTC	2	8	73588	73595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010623	AGGC	2	8	73617	73624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010623	GTCG	2	8	73806	73813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010623	CGGC	2	8	74313	74320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010623	CGGG	2	8	74598	74605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010623	GCGA	2	8	75124	75131	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010623	CAGC	2	8	77969	77976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010623	AGGC	2	8	78065	78072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010623	GGTC	2	8	78690	78697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010623	TACC	2	8	79191	79198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010623	TCGC	2	8	79296	79303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010623	CGAT	2	8	80617	80624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010623	GCGA	2	8	80721	80728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010623	CCTT	2	8	85650	85657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010623	CTGC	2	8	85675	85682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010623	TCCG	2	8	85922	85929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010623	GGAG	2	8	86873	86880	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010623	CCGG	2	8	96736	96743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010623	CGAA	2	8	98017	98024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010623	TTCG	2	8	98044	98051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010623	ACCA	2	8	99984	99991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010623	GCTC	2	8	101909	101916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010623	TGAC	2	8	101992	101999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010623	ACGT	2	8	102102	102109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010623	ACTC	2	8	102529	102536	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010623	CAAC	2	8	103257	103264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010623	CTAG	2	8	103457	103464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010623	CAAA	2	8	104631	104638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010623	TTTC	2	8	105797	105804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010623	TGTA	2	8	107093	107100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010623	TAAT	2	8	107108	107115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010623	TTGC	2	8	111620	111627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010623	CATC	2	8	122481	122488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010623	TGGC	2	8	122494	122501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010623	CATC	2	8	122764	122771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010623	TGGC	2	8	122777	122784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010623	ATCA	2	8	124234	124241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010623	TTGA	2	8	125909	125916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010623	GGAT	2	8	126128	126135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010623	ACAG	2	8	126671	126678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010623	CTGC	2	8	126703	126710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010623	AGTC	2	8	126719	126726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010623	GGCC	2	8	127262	127269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010623	GTTA	2	8	127889	127896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010623	GCAG	2	8	137352	137359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010623	CGGT	2	8	139591	139598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010623	GTCG	2	8	139925	139932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010623	GCAT	2	8	140175	140182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010623	CTAT	2	8	141953	141960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010623	TTCG	2	8	143798	143805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010623	TGAC	2	8	143889	143896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010623	GCGG	2	8	143922	143929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010623	CCCG	2	8	143951	143958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_010623	GATA	2	8	145708	145715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010623	TCTT	2	8	145725	145732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010623	ACGT	2	8	145890	145897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010623	TCGA	2	8	147467	147474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010623	GACG	2	8	147846	147853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010623	AAAG	2	8	147930	147937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010623	ACCG	2	8	148066	148073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010623	ATGC	2	8	149622	149629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010623	CCGG	2	8	149787	149794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010623	CCAA	2	8	150865	150872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010623	GACG	2	8	152549	152556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010623	CGTC	2	8	152835	152842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010623	GTCA	2	8	153062	153069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010623	CTCA	2	8	156796	156803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010623	GATC	2	8	158155	158162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010623	GCGG	2	8	158769	158776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010623	TCGT	2	8	158812	158819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010623	AGCG	2	8	162175	162182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010623	GCGG	2	8	162822	162829	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010623	CCAA	2	8	163400	163407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010623	CCAG	2	8	164362	164369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010623	CCGC	2	8	164990	164997	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_010623	GTGC	2	8	167157	167164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010623	CATG	2	8	167271	167278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010623	GAAG	2	8	167355	167362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010623	CACT	2	8	169725	169732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010623	CTTT	2	8	170045	170052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010623	CGTG	2	8	174350	174357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010623	GTTT	2	8	188060	188067	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010623	GCAA	2	8	189002	189009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010623	CAGC	2	8	194000	194007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010623	TCAG	2	8	194136	194143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010623	GTCA	2	8	194233	194240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010623	CAAA	2	8	194356	194363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010623	TGAT	2	8	202095	202102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010623	TACC	2	8	204841	204848	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010623	ATCG	2	8	208810	208817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010623	CCGC	2	8	208876	208883	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_010623	CCCG	2	8	210897	210904	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_010623	CCGA	2	8	214096	214103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010623	TGCT	2	8	214160	214167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010623	ACAT	2	8	216556	216563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010623	ACAA	2	8	223084	223091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010623	TGCT	2	8	225395	225402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010623	CGGT	2	8	225422	225429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010623	CCAG	2	8	236015	236022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010623	CGCT	2	8	236049	236056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010623	AAAG	2	8	237293	237300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010623	AAAG	2	8	237306	237313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010623	CCGG	2	8	241163	241170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010623	TTGA	2	8	242511	242518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010623	TGCG	2	8	246420	246427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010623	GATG	2	8	248258	248265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010623	GTGG	2	8	249482	249489	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010623	GAAA	2	8	249493	249500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010623	CCAG	2	8	249667	249674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010623	GGAA	2	8	251452	251459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010623	ACCG	2	8	251502	251509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010623	ACCG	2	8	255024	255031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010623	ACGG	2	8	261172	261179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010623	CAAT	2	8	264032	264039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010623	GGCG	2	8	264106	264113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010623	ACGC	2	8	264180	264187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010623	CTTT	3	12	264315	264326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010623	AAAG	3	12	264338	264349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010623	ACGG	2	8	273299	273306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010623	CGCA	2	8	275460	275467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010623	TGCA	2	8	275751	275758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010623	GCGG	2	8	278462	278469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010623	CGGC	2	8	278576	278583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_010623	GTTT	2	8	278616	278623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010623	CGTT	2	8	278653	278660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010623	TGCA	2	8	280747	280754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010623	GCCC	2	8	282839	282846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
155	NC_010623	TCCG	2	8	286667	286674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NC_010623	GACG	2	8	292043	292050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_010623	CGTC	2	8	292058	292065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_010623	CTGC	2	8	292069	292076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_010623	AGTC	2	8	292320	292327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_010623	TTAA	2	8	293130	293137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010623	TGCA	2	8	294734	294741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_010623	GAAA	2	8	294963	294970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_010623	GCGT	2	8	303257	303264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_010623	CGCC	2	8	303267	303274	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
171	NC_010623	CGTC	2	8	303288	303295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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177	NC_010623	AGCG	2	8	311747	311754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_010623	GACC	2	8	347165	347172	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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234	NC_010623	CCAT	2	8	484879	484886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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261	NC_010623	ATTG	2	8	530369	530376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_010623	CTGG	2	8	1048793	1048800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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