MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010581	TCA	2	6	1248392	1248397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_010581	TGA	2	6	1248453	1248458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_010581	CGG	2	6	1248942	1248947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_010581	CG	3	6	1248962	1248967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_010581	TGC	2	6	1249017	1249022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_010581	GTT	2	6	1249028	1249033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_010581	CTC	2	6	1249166	1249171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_010581	AG	3	6	1249199	1249204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_010581	TCA	2	6	1249276	1249281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_010581	TC	3	6	1249312	1249317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_010581	GCA	2	6	1249320	1249325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_010581	ATG	2	6	1249356	1249361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_010581	TTCC	2	8	1252056	1252063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_010581	GGC	2	6	1252066	1252071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_010581	CT	3	6	1253258	1253263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_010581	TG	3	6	1253297	1253302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_010581	TCG	2	6	1253339	1253344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_010581	A	6	6	1253377	1253382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_010581	AT	3	6	1253446	1253451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_010581	GGCGC	2	10	1254407	1254416	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3521	NC_010581	T	7	7	1255113	1255119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_010581	A	6	6	1255174	1255179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_010581	CG	3	6	1255181	1255186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_010581	ACA	2	6	1258255	1258260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_010581	CTT	2	6	1258274	1258279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_010581	CAA	2	6	1258295	1258300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_010581	ATG	2	6	1258393	1258398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_010581	AAT	2	6	1258443	1258448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_010581	GAT	2	6	1258449	1258454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_010581	TTGA	2	8	1258606	1258613	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_010581	TCCG	2	8	1258614	1258621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_010581	TCT	2	6	1258676	1258681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_010581	GGGC	2	8	1258764	1258771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_010581	GC	3	6	1258773	1258778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_010581	CGC	2	6	1258801	1258806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_010581	GCT	2	6	1258807	1258812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_010581	ATC	2	6	1258838	1258843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_010581	AGA	2	6	1266668	1266673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_010581	GTC	2	6	1266690	1266695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_010581	GCA	2	6	1266712	1266717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_010581	ATC	2	6	1266725	1266730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_010581	GGC	2	6	1266757	1266762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_010581	TTCA	2	8	1267716	1267723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_010581	GC	3	6	1267731	1267736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_010581	TTG	2	6	1267800	1267805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_010581	GAT	2	6	1267811	1267816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_010581	GGC	2	6	1271934	1271939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_010581	CAA	2	6	1271941	1271946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_010581	CG	3	6	1271988	1271993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_010581	CAT	3	9	1272075	1272083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_010581	GCT	2	6	1272225	1272230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_010581	GCC	2	6	1273159	1273164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_010581	A	6	6	1273212	1273217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_010581	GCA	2	6	1273231	1273236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_010581	AGT	2	6	1273329	1273334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_010581	A	6	6	1273340	1273345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_010581	TGTGG	2	10	1275899	1275908	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_010581	GGT	2	6	1275956	1275961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_010581	CCT	2	6	1276661	1276666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_010581	GGGAA	2	10	1277380	1277389	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_010581	GAG	2	6	1277394	1277399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_010581	T	6	6	1277450	1277455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010581	AGC	2	6	1277491	1277496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_010581	GCT	2	6	1277523	1277528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_010581	T	6	6	1277541	1277546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_010581	TCC	2	6	1277615	1277620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_010581	CAG	2	6	1279676	1279681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_010581	TCA	2	6	1279735	1279740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_010581	TCTT	2	8	1279777	1279784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_010581	TTA	2	6	1279785	1279790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010581	TA	3	6	1280104	1280109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010581	T	7	7	1280116	1280122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_010581	CT	3	6	1280169	1280174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_010581	AAT	2	6	1280186	1280191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010581	AT	3	6	1280215	1280220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_010581	ATC	2	6	1280258	1280263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_010581	ATGA	2	8	1280280	1280287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_010581	GGC	2	6	1280300	1280305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_010581	AAAC	2	8	1280381	1280388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_010581	TTA	2	6	1280442	1280447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_010581	ATGA	2	8	1280465	1280472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_010581	GCA	2	6	1280511	1280516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_010581	ATT	2	6	1281904	1281909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_010581	TTAA	2	8	1281911	1281918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_010581	GCG	2	6	1281943	1281948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_010581	GCG	2	6	1281989	1281994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_010581	GGA	2	6	1282044	1282049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_010581	GA	3	6	1282127	1282132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_010581	TGCA	2	8	1282137	1282144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_010581	CATC	2	8	1282147	1282154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_010581	GAG	2	6	1289973	1289978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_010581	CCG	2	6	1290285	1290290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_010581	GCTA	2	8	1290296	1290303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_010581	GGCA	2	8	1290409	1290416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_010581	AGA	2	6	1290471	1290476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_010581	ATA	2	6	1290494	1290499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_010581	TG	3	6	1290544	1290549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_010581	TTG	2	6	1293646	1293651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_010581	AAG	2	6	1293734	1293739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_010581	ATTG	2	8	1293754	1293761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_010581	GAG	2	6	1293769	1293774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_010581	TAT	2	6	1293817	1293822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_010581	GGC	2	6	1293833	1293838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_010581	CTG	2	6	1293851	1293856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_010581	GAAA	2	8	1295660	1295667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_010581	GTG	2	6	1295681	1295686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_010581	GAT	2	6	1297241	1297246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_010581	GCA	2	6	1297717	1297722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_010581	GAT	2	6	1297723	1297728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_010581	GAT	2	6	1297754	1297759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_010581	CTT	2	6	1297766	1297771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_010581	ACTG	2	8	1297827	1297834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_010581	TGA	2	6	1297837	1297842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_010581	GTC	2	6	1297852	1297857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_010581	GCGA	2	8	1297874	1297881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_010581	TCA	2	6	1297924	1297929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_010581	ATGCC	2	10	1297968	1297977	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3618	NC_010581	CCG	2	6	1298000	1298005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_010581	TGCT	2	8	1298027	1298034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_010581	AT	3	6	1298057	1298062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_010581	TTG	2	6	1298074	1298079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_010581	GC	3	6	1298099	1298104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_010581	AAT	2	6	1304273	1304278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_010581	TC	3	6	1305867	1305872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_010581	GCT	2	6	1305912	1305917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_010581	TCAA	2	8	1305975	1305982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_010581	CG	3	6	1306079	1306084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_010581	AGG	2	6	1306096	1306101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_010581	AAT	2	6	1306941	1306946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_010581	GCG	2	6	1307281	1307286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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