MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010581	CAC	2	6	1087226	1087231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_010581	AAT	2	6	1087292	1087297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_010581	TCAA	2	8	1087339	1087346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_010581	TTC	2	6	1087365	1087370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_010581	AGC	2	6	1087416	1087421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_010581	GC	3	6	1087420	1087425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_010581	ATTT	2	8	1087537	1087544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010581	GTATTT	2	12	1087570	1087581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010581	ATTCC	2	10	1087652	1087661	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_010581	TGA	2	6	1087673	1087678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010581	A	6	6	1087697	1087702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010581	TGC	2	6	1087708	1087713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_010581	TCA	2	6	1087952	1087957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010581	TC	3	6	1088054	1088059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_010581	GAT	2	6	1088090	1088095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010581	TCT	2	6	1088971	1088976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_010581	TGA	2	6	1090043	1090048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010581	TGG	2	6	1090052	1090057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010581	CGA	2	6	1090076	1090081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_010581	CGAT	2	8	1090087	1090094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_010581	AAG	2	6	1090099	1090104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010581	CAT	2	6	1091147	1091152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_010581	T	6	6	1091620	1091625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_010581	AG	3	6	1091629	1091634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010581	CTC	2	6	1091650	1091655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_010581	ATGA	2	8	1091663	1091670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010581	TGC	2	6	1091675	1091680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_010581	ATC	2	6	1092730	1092735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_010581	GA	3	6	1092801	1092806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_010581	CGA	2	6	1092825	1092830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_010581	ATA	2	6	1092860	1092865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010581	TTAG	2	8	1092911	1092918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010581	GC	3	6	1093319	1093324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_010581	TCT	2	6	1093340	1093345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_010581	GGC	2	6	1093407	1093412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_010581	GC	3	6	1093623	1093628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_010581	GAA	2	6	1093646	1093651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010581	TTC	2	6	1093658	1093663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_010581	GGA	2	6	1093693	1093698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010581	TGCG	2	8	1093729	1093736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_010581	TCC	2	6	1093797	1093802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_010581	CGT	2	6	1093844	1093849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_010581	GAG	2	6	1095197	1095202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010581	TTG	2	6	1095233	1095238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_010581	A	6	6	1095268	1095273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010581	TGA	2	6	1095373	1095378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010581	CAA	2	6	1096800	1096805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_010581	GCC	2	6	1096838	1096843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_010581	AGT	2	6	1096902	1096907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010581	TGA	2	6	1097064	1097069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010581	GA	4	8	1097068	1097075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010581	CGG	2	6	1097967	1097972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_010581	CCG	2	6	1097980	1097985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_010581	AGA	2	6	1099074	1099079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010581	GTT	2	6	1099138	1099143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010581	GTC	2	6	1099164	1099169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_010581	GTC	2	6	1099853	1099858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010581	TAG	2	6	1099859	1099864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010581	GGC	2	6	1099927	1099932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010581	CCA	2	6	1099998	1100003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_010581	ATG	2	6	1101438	1101443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010581	TAT	2	6	1101449	1101454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010581	TATT	2	8	1101473	1101480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010581	TA	3	6	1101551	1101556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010581	GTC	2	6	1101574	1101579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_010581	CCAAT	2	10	1101611	1101620	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3067	NC_010581	AGGTC	2	10	1101656	1101665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_010581	CTGA	2	8	1101670	1101677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_010581	GGC	2	6	1101696	1101701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_010581	ACAA	2	8	1101754	1101761	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_010581	TGA	2	6	1102329	1102334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010581	GGCTGC	2	12	1102373	1102384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_010581	ATCG	2	8	1102416	1102423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_010581	GCG	2	6	1102427	1102432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_010581	CGC	2	6	1102466	1102471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_010581	AGGGA	2	10	1102477	1102486	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_010581	GGCG	2	8	1104841	1104848	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_010581	ATG	2	6	1104949	1104954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010581	GC	3	6	1104970	1104975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_010581	GCTG	2	8	1104995	1105002	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_010581	AGC	2	6	1105295	1105300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_010581	CCT	2	6	1105318	1105323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_010581	CAT	2	6	1105360	1105365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_010581	GAA	2	6	1105429	1105434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010581	GACG	2	8	1105437	1105444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_010581	AGGGC	2	10	1105493	1105502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3087	NC_010581	CAG	2	6	1105506	1105511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_010581	ATC	2	6	1105548	1105553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_010581	TCG	2	6	1105816	1105821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_010581	ATT	2	6	1105822	1105827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010581	TGT	2	6	1105834	1105839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010581	GGC	2	6	1105880	1105885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_010581	GGC	2	6	1105906	1105911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_010581	CTTG	2	8	1105914	1105921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_010581	GAC	2	6	1105971	1105976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_010581	TGC	2	6	1105992	1105997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_010581	A	6	6	1106057	1106062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_010581	TCA	2	6	1106087	1106092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_010581	CAG	2	6	1106103	1106108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_010581	AGC	2	6	1106119	1106124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_010581	GCG	2	6	1106133	1106138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_010581	GAACTG	2	12	1107090	1107101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3103	NC_010581	ATT	2	6	1107112	1107117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010581	TTC	2	6	1107124	1107129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_010581	GAT	2	6	1107194	1107199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010581	TGG	2	6	1107263	1107268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010581	TCAA	2	8	1107384	1107391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_010581	CGGC	2	8	1107512	1107519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_010581	AAT	2	6	1107543	1107548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010581	ATCA	2	8	1107556	1107563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_010581	ACGC	2	8	1107585	1107592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_010581	GC	3	6	1107600	1107605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_010581	TGCG	2	8	1107609	1107616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_010581	GCG	2	6	1109272	1109277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_010581	CGGA	2	8	1109348	1109355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_010581	CGT	2	6	1109372	1109377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_010581	CTT	2	6	1110655	1110660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_010581	GAC	2	6	1110682	1110687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_010581	ATG	2	6	1110706	1110711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010581	CTTGCA	2	12	1110741	1110752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_010581	GA	3	6	1111667	1111672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010581	ATT	2	6	1112278	1112283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_010581	TCAA	2	8	1112293	1112300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_010581	AG	3	6	1112307	1112312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010581	AGG	2	6	1112362	1112367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_010581	AT	3	6	1114593	1114598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010581	GCGG	2	8	1114602	1114609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_010581	GCC	2	6	1114620	1114625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_010581	AGA	2	6	1114638	1114643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010581	ATG	2	6	1114678	1114683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010581	GTCT	2	8	1114717	1114724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_010581	CCA	2	6	1114747	1114752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_010581	GCCT	2	8	1119128	1119135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_010581	TCG	2	6	1119143	1119148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_010581	TTG	2	6	1119228	1119233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3143	NC_010581	ACC	2	6	1124325	1124330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3144	NC_010581	TGA	2	6	1125591	1125596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_010581	TGA	2	6	1125644	1125649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3152	NC_010581	GAAGG	2	10	1128784	1128793	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3243	NC_010581	ATGGC	2	10	1168316	1168325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3244	NC_010581	AAG	2	6	1168327	1168332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3246	NC_010581	TCTT	2	8	1168354	1168361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3247	NC_010581	CCG	2	6	1168371	1168376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3249	NC_010581	GACCC	2	10	1168409	1168418	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3250	NC_010581	CATC	2	8	1169134	1169141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3251	NC_010581	TAA	2	6	1169217	1169222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_010581	CGAA	2	8	1169243	1169250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3254	NC_010581	GGGC	2	8	1170391	1170398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3255	NC_010581	ATTC	2	8	1170456	1170463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3256	NC_010581	CGA	2	6	1170505	1170510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_010581	GC	3	6	1170516	1170521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_010581	GA	3	6	1170524	1170529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_010581	A	6	6	1171177	1171182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3261	NC_010581	TG	3	6	1171278	1171283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_010581	TGG	2	6	1172508	1172513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3390	NC_010581	AATCA	2	10	1207694	1207703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3392	NC_010581	GC	3	6	1207851	1207856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3393	NC_010581	CG	3	6	1207912	1207917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3394	NC_010581	GGC	2	6	1208689	1208694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3395	NC_010581	GC	4	8	1208724	1208731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3396	NC_010581	CG	3	6	1208766	1208771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3397	NC_010581	AGA	2	6	1210100	1210105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3398	NC_010581	GA	3	6	1210942	1210947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_010581	CCGA	2	8	1212552	1212559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3400	NC_010581	TC	3	6	1212566	1212571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3401	NC_010581	CGG	2	6	1215289	1215294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3402	NC_010581	AG	3	6	1216978	1216983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3403	NC_010581	GTAT	2	8	1217023	1217030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3498	NC_010581	ACCG	2	8	1246731	1246738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3499	NC_010581	CTC	2	6	1246744	1246749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3500	NC_010581	ATG	2	6	1246760	1246765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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