MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010581	CTT	2	6	521786	521791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010581	GGC	2	6	521856	521861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_010581	ATC	2	6	521891	521896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_010581	GGCG	2	8	521949	521956	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_010581	ATTT	2	8	521994	522001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010581	TCT	2	6	522022	522027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_010581	ATC	2	6	522053	522058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010581	CTG	2	6	522071	522076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010581	GCT	2	6	522934	522939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_010581	TGCG	2	8	522978	522985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_010581	CT	4	8	523642	523649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_010581	GCA	2	6	523673	523678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_010581	TACGG	2	10	523682	523691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1514	NC_010581	GAG	2	6	523709	523714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010581	TGA	2	6	524661	524666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010581	AGGG	2	8	524678	524685	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010581	TGCTC	2	10	524698	524707	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1518	NC_010581	TC	3	6	524706	524711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_010581	TAG	2	6	527551	527556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010581	CG	3	6	528565	528570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_010581	CTTG	2	8	529106	529113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_010581	ATCCT	2	10	529955	529964	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1523	NC_010581	GAT	2	6	532434	532439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010581	GTC	2	6	532444	532449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_010581	CCG	2	6	532585	532590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_010581	GAACA	2	10	532655	532664	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_010581	CGCCT	2	10	532666	532675	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1528	NC_010581	TA	3	6	532692	532697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010581	GC	3	6	532704	532709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_010581	TTC	2	6	532786	532791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010581	GAT	2	6	532834	532839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010581	CGT	2	6	533366	533371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_010581	CCG	2	6	533412	533417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_010581	GAT	2	6	533563	533568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010581	ATTC	2	8	533576	533583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_010581	AGA	2	6	533588	533593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010581	TCGT	2	8	533630	533637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_010581	A	6	6	533644	533649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010581	GA	3	6	533753	533758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010581	CGTGT	2	10	533796	533805	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1541	NC_010581	CGC	2	6	533810	533815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_010581	AGG	2	6	534807	534812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010581	CTC	2	6	536329	536334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_010581	GAG	2	6	536342	536347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010581	A	7	7	536378	536384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010581	AGT	2	6	538061	538066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_010581	ATG	2	6	538095	538100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_010581	GAG	2	6	538240	538245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010581	AAT	2	6	541547	541552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010581	GGC	2	6	543815	543820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010581	ATA	2	6	543944	543949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010581	GTTT	2	8	544030	544037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010581	GAT	2	6	544038	544043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_010581	TTG	2	6	544075	544080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010581	GGT	2	6	544907	544912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010581	CGTTT	2	10	546175	546184	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1557	NC_010581	TTCCG	2	10	546222	546231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1558	NC_010581	GAA	2	6	546270	546275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010581	ATT	2	6	546356	546361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010581	GAC	2	6	546394	546399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_010581	T	6	6	546434	546439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_010581	GATT	2	8	546441	546448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010581	TCA	2	6	546450	546455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010581	T	6	6	546500	546505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010581	TCCT	2	8	546545	546552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_010581	GCC	2	6	546633	546638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_010581	CCT	2	6	546652	546657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_010581	AGG	2	6	546661	546666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010581	GGAA	2	8	546675	546682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010581	GATC	2	8	546756	546763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_010581	GCCC	2	8	546779	546786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1572	NC_010581	GCG	2	6	546823	546828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_010581	GGT	2	6	546835	546840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010581	GA	3	6	547232	547237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010581	GTT	3	9	547302	547310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010581	CG	3	6	551078	551083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_010581	GGC	2	6	551084	551089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_010581	CG	3	6	551102	551107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_010581	ATTT	2	8	551109	551116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010581	CAAG	2	8	551220	551227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_010581	GC	3	6	551232	551237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_010581	TCT	2	6	551842	551847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010581	TC	3	6	552220	552225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_010581	ATC	2	6	552798	552803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_010581	TCT	2	6	553614	553619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_010581	GAT	2	6	554275	554280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010581	AT	3	6	554298	554303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010581	CGT	2	6	554998	555003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_010581	TCA	2	6	557067	557072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_010581	GCT	3	9	557104	557112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_010581	CAG	2	6	557154	557159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_010581	ATCG	2	8	557571	557578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_010581	CAC	2	6	558019	558024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_010581	AAG	2	6	558965	558970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010581	CCT	2	6	558981	558986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_010581	GAT	2	6	558994	558999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010581	CAC	2	6	559025	559030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_010581	TGA	2	6	559058	559063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010581	TACTT	2	10	559064	559073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1600	NC_010581	CCA	2	6	564222	564227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_010581	GCC	2	6	564289	564294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_010581	CGA	2	6	564306	564311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_010581	CGA	2	6	564339	564344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_010581	GCC	2	6	564394	564399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_010581	ACG	2	6	564410	564415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010581	GAA	2	6	565132	565137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010581	TCT	2	6	565251	565256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_010581	GTG	2	6	565277	565282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010581	GCG	2	6	565292	565297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_010581	CGCGG	2	10	565342	565351	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1611	NC_010581	CG	3	6	566922	566927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_010581	TCC	2	6	567304	567309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_010581	GAA	2	6	567312	567317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010581	GCG	2	6	567348	567353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_010581	CTT	2	6	567372	567377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_010581	AG	3	6	567852	567857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010581	CGA	2	6	567900	567905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_010581	AAT	2	6	567906	567911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010581	CT	3	6	567937	567942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_010581	G	6	6	568025	568030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010581	A	6	6	568053	568058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010581	A	7	7	568075	568081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_010581	GCT	2	6	568088	568093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_010581	TGA	3	9	568107	568115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010581	CATT	2	8	568168	568175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_010581	GAT	2	6	569411	569416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010581	GCA	2	6	569428	569433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_010581	TG	3	6	569447	569452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010581	TCA	2	6	572335	572340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_010581	GTCTT	2	10	572348	572357	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_010581	GGC	2	6	572381	572386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_010581	T	6	6	572392	572397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_010581	GCG	2	6	575659	575664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_010581	GAGAA	2	10	575813	575822	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_010581	A	8	8	575908	575915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_010581	CCCG	2	8	575930	575937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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