MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010581	CCG	2	6	357434	357439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_010581	TC	3	6	357554	357559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_010581	TGA	2	6	357622	357627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010581	TCGC	2	8	358056	358063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_010581	TGG	2	6	358113	358118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010581	TCT	2	6	358129	358134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010581	CTT	2	6	358170	358175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010581	T	6	6	358174	358179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010581	TTG	2	6	358212	358217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010581	GCTG	2	8	358228	358235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_010581	TCT	2	6	358261	358266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010581	CGC	2	6	358302	358307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_010581	C	6	6	358307	358312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1014	NC_010581	GCCGA	2	10	358346	358355	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_010581	GGC	2	6	358362	358367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010581	CTC	3	9	361277	361285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_010581	CCAA	2	8	361614	361621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_010581	GAG	2	6	361672	361677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010581	CGA	2	6	361698	361703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010581	TAT	2	6	361798	361803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010581	GCC	2	6	362336	362341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_010581	TC	3	6	362370	362375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_010581	GC	3	6	362482	362487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_010581	CTC	2	6	362613	362618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_010581	CGC	2	6	362978	362983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_010581	GT	3	6	363066	363071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010581	GCT	2	6	364104	364109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010581	AGGG	2	8	364213	364220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010581	GC	3	6	364841	364846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_010581	CT	3	6	364863	364868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_010581	GCG	2	6	364937	364942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_010581	ATG	3	9	364945	364953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010581	GAT	2	6	366301	366306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010581	CGG	2	6	366331	366336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010581	CCTA	2	8	366341	366348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_010581	CGA	2	6	366368	366373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010581	GGGC	2	8	367893	367900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_010581	GTC	2	6	367962	367967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010581	TGA	2	6	368417	368422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010581	GGTGT	2	10	368428	368437	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010581	CGG	2	6	368476	368481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010581	CCGA	2	8	368563	368570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_010581	CCT	2	6	368659	368664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_010581	T	6	6	368673	368678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010581	TTCT	2	8	368682	368689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_010581	AG	3	6	368719	368724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010581	GAG	2	6	369797	369802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010581	GCT	2	6	370470	370475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_010581	TCG	2	6	371964	371969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010581	GC	3	6	372105	372110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_010581	CAA	2	6	372114	372119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010581	CCG	2	6	375589	375594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_010581	GAC	2	6	375614	375619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010581	TCA	2	6	375705	375710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010581	AATT	2	8	376265	376272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010581	CGT	2	6	376298	376303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010581	GCT	2	6	376370	376375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_010581	GTT	2	6	378656	378661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010581	CCG	2	6	379316	379321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_010581	GGAC	2	8	379423	379430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_010581	CCG	2	6	379481	379486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_010581	T	6	6	379502	379507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010581	TCC	2	6	379570	379575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_010581	AATC	2	8	380624	380631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_010581	AAG	2	6	380749	380754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010581	CTT	2	6	380775	380780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010581	CTT	2	6	381731	381736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_010581	TAT	2	6	381936	381941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010581	TC	3	6	382633	382638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_010581	CGGA	2	8	382739	382746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_010581	GC	3	6	384381	384386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_010581	TGC	2	6	385942	385947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010581	A	6	6	385996	386001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010581	TCA	2	6	386065	386070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_010581	TTCA	2	8	386091	386098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_010581	AGG	2	6	386121	386126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010581	TCAA	2	8	386162	386169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_010581	AAC	2	6	386640	386645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010581	CAA	2	6	386654	386659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_010581	CT	3	6	386782	386787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_010581	CTG	2	6	388000	388005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_010581	GCAG	2	8	388055	388062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_010581	GCAT	2	8	388200	388207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_010581	GCA	2	6	388229	388234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_010581	TG	3	6	388274	388279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010581	AT	3	6	388347	388352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010581	AGGG	2	8	388368	388375	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010581	GCG	2	6	389240	389245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010581	CAT	2	6	389266	389271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_010581	TGCG	2	8	389339	389346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_010581	TCT	2	6	389390	389395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010581	TGA	2	6	389413	389418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010581	GAAT	2	8	389464	389471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010581	GCG	2	6	389557	389562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_010581	CGT	2	6	389574	389579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010581	GCG	2	6	390395	390400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010581	GAA	2	6	390417	390422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010581	AAGG	2	8	390431	390438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010581	GA	3	6	390446	390451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010581	GTC	2	6	391157	391162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010581	CGCAT	2	10	391165	391174	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1102	NC_010581	GC	3	6	391177	391182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_010581	AC	3	6	391223	391228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_010581	AAG	2	6	391272	391277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010581	TTG	2	6	392347	392352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010581	GAAT	2	8	392513	392520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010581	GTTCG	2	10	392531	392540	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_010581	AAG	2	6	392555	392560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010581	CAA	2	6	392562	392567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_010581	ATG	2	6	392582	392587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010581	TGT	2	6	392618	392623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010581	A	6	6	392693	392698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010581	GAA	2	6	392699	392704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010581	AAT	2	6	392705	392710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010581	CAC	2	6	392826	392831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_010581	GTC	2	6	392866	392871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_010581	TCC	2	6	392927	392932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_010581	GTGA	2	8	393020	393027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010581	TCTG	2	8	394139	394146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_010581	GATT	2	8	394174	394181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010581	TTCA	2	8	394207	394214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_010581	GGC	2	6	396159	396164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_010581	CT	3	6	396167	396172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_010581	CAT	2	6	396948	396953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_010581	GAT	2	6	396970	396975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010581	GAA	2	6	398320	398325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010581	GAA	2	6	398331	398336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010581	CCAGA	2	10	398359	398368	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_010581	AAGT	2	8	398386	398393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010581	T	6	6	398429	398434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010581	TAT	2	6	398446	398451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010581	AGGC	2	8	398485	398492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_010581	ACA	2	6	398626	398631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_010581	CGT	2	6	398634	398639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_010581	TCT	2	6	398727	398732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_010581	GCAC	2	8	399914	399921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_010581	A	6	6	400975	400980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_010581	GCC	2	6	489734	489739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_010581	TTG	2	6	489805	489810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_010581	CATG	2	8	489818	489825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_010581	TCT	2	6	489851	489856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_010581	TGA	2	6	489890	489895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_010581	TAA	2	6	494920	494925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1444	NC_010581	CGG	2	6	499055	499060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1445	NC_010581	CG	3	6	499065	499070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1449	NC_010581	CG	3	6	500361	500366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1465	NC_010581	GCGAT	2	10	503884	503893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1500	NC_010581	GCA	2	6	521725	521730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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