MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_010581	GCC	2	6	3919541	3919546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12002	NC_010581	GCT	2	6	3919573	3919578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_010581	GCCC	2	8	3919690	3919697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12004	NC_010581	TGGC	2	8	3919857	3919864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12005	NC_010581	AG	3	6	3919868	3919873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_010581	TTCA	2	8	3921891	3921898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12007	NC_010581	CATCC	2	10	3923222	3923231	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12008	NC_010581	CGA	2	6	3927770	3927775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_010581	ATG	2	6	3927778	3927783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_010581	CGA	2	6	3927892	3927897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_010581	CCG	2	6	3927959	3927964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12012	NC_010581	GCT	2	6	3928051	3928056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_010581	AGGGA	2	10	3928070	3928079	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_010581	GAAG	2	8	3928104	3928111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_010581	GGGAT	2	10	3928207	3928216	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_010581	TGA	3	9	3928284	3928292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_010581	GCC	2	6	3928346	3928351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12018	NC_010581	GC	3	6	3928362	3928367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12019	NC_010581	GCGG	2	8	3928375	3928382	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12020	NC_010581	ATG	2	6	3928413	3928418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_010581	TACA	2	8	3928472	3928479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12022	NC_010581	TGC	2	6	3928481	3928486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_010581	GTC	2	6	3928513	3928518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_010581	TCCGT	2	10	3928585	3928594	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12025	NC_010581	CCA	2	6	3928634	3928639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12026	NC_010581	ACG	2	6	3928727	3928732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12027	NC_010581	TGA	2	6	3928807	3928812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_010581	AAC	2	6	3928831	3928836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_010581	ACC	2	6	3928922	3928927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12030	NC_010581	CAGG	2	8	3928978	3928985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12031	NC_010581	CG	3	6	3929037	3929042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12032	NC_010581	CCA	2	6	3929085	3929090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12033	NC_010581	GGT	2	6	3929145	3929150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_010581	ACC	2	6	3929198	3929203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12035	NC_010581	GCC	2	6	3929415	3929420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12036	NC_010581	CTC	3	9	3929451	3929459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12037	NC_010581	CCT	2	6	3929591	3929596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12038	NC_010581	TC	3	6	3929643	3929648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12039	NC_010581	GCC	2	6	3929732	3929737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12040	NC_010581	CTTT	2	8	3930103	3930110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12041	NC_010581	GCT	2	6	3930119	3930124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_010581	CCT	2	6	3930135	3930140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12043	NC_010581	GTT	2	6	3930142	3930147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_010581	GTT	2	6	3930209	3930214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_010581	ACG	2	6	3930224	3930229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12046	NC_010581	GT	3	6	3930246	3930251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_010581	C	6	6	3930309	3930314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12048	NC_010581	TTGG	2	8	3930400	3930407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_010581	TCC	2	6	3930463	3930468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_010581	CGA	2	6	3930530	3930535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12051	NC_010581	CCT	2	6	3930650	3930655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_010581	TCG	2	6	3930698	3930703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_010581	GAG	2	6	3930752	3930757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_010581	TCGC	2	8	3930924	3930931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12055	NC_010581	ACT	2	6	3930933	3930938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12056	NC_010581	GCC	2	6	3931347	3931352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12057	NC_010581	A	6	6	3931380	3931385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_010581	ACTG	2	8	3931448	3931455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12059	NC_010581	TGG	2	6	3931659	3931664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_010581	CGA	2	6	3931683	3931688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12061	NC_010581	GCC	2	6	3931796	3931801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12062	NC_010581	GCT	2	6	3931853	3931858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_010581	TGG	2	6	3931864	3931869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_010581	GC	4	8	3931909	3931916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12065	NC_010581	AC	3	6	3931951	3931956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12066	NC_010581	GAA	2	6	3932014	3932019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12067	NC_010581	GGC	2	6	3932031	3932036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12068	NC_010581	ATC	2	6	3932115	3932120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12070	NC_010581	GT	3	6	3932269	3932274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12071	NC_010581	GT	3	6	3932437	3932442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_010581	ATG	2	6	3932533	3932538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12073	NC_010581	CACGA	2	10	3932588	3932597	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12074	NC_010581	GAC	2	6	3932601	3932606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12075	NC_010581	GCA	2	6	3932613	3932618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12077	NC_010581	CATC	2	8	3932845	3932852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12078	NC_010581	GCC	2	6	3932935	3932940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12079	NC_010581	AAC	2	6	3933115	3933120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12080	NC_010581	GCT	2	6	3933145	3933150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12083	NC_010581	ATC	2	6	3933338	3933343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12084	NC_010581	TCG	2	6	3933363	3933368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12085	NC_010581	GCC	2	6	3933570	3933575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12086	NC_010581	CGTT	2	8	3933578	3933585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12087	NC_010581	ACT	2	6	3933639	3933644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12090	NC_010581	CCG	2	6	3933768	3933773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12091	NC_010581	TCTT	2	8	3933784	3933791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12092	NC_010581	ACC	2	6	3933861	3933866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12093	NC_010581	GCG	2	6	3933938	3933943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12094	NC_010581	A	6	6	3934000	3934005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_010581	AG	3	6	3934084	3934089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12096	NC_010581	CTC	2	6	3934138	3934143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12097	NC_010581	GA	3	6	3934156	3934161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12098	NC_010581	AATC	2	8	3934197	3934204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12099	NC_010581	ATG	2	6	3934207	3934212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12101	NC_010581	TTC	2	6	3935258	3935263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12102	NC_010581	ATTC	2	8	3935288	3935295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12106	NC_010581	CG	3	6	3941832	3941837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12107	NC_010581	AC	3	6	3941876	3941881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12108	NC_010581	GCA	2	6	3941904	3941909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12109	NC_010581	TGC	2	6	3941935	3941940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_010581	ATC	2	6	3941962	3941967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_010581	GCAA	2	8	3944398	3944405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12112	NC_010581	GTC	2	6	3944406	3944411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_010581	CAA	2	6	3944443	3944448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_010581	ATT	2	6	3944559	3944564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_010581	GCG	2	6	3944604	3944609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12116	NC_010581	GCGA	2	8	3944642	3944649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12117	NC_010581	TGG	2	6	3944761	3944766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12118	NC_010581	AGC	2	6	3944799	3944804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12119	NC_010581	TCC	2	6	3944836	3944841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12120	NC_010581	AGC	2	6	3944905	3944910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12121	NC_010581	CCG	2	6	3944920	3944925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12122	NC_010581	TCCC	2	8	3944930	3944937	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12123	NC_010581	AATC	2	8	3945176	3945183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12124	NC_010581	AATG	2	8	3945683	3945690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_010581	TTC	2	6	3945763	3945768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12126	NC_010581	TGC	2	6	3946317	3946322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12128	NC_010581	GA	3	6	3947984	3947989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12251	NC_010581	GCA	2	6	4002905	4002910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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