MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010581	T	6	6	179681	179686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010581	GCC	2	6	179782	179787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_010581	GGC	2	6	179792	179797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_010581	GCC	2	6	179894	179899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_010581	TTGC	2	8	183605	183612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_010581	CGG	2	6	183648	183653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010581	GCG	2	6	183795	183800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010581	GAC	2	6	183820	183825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010581	GCCGT	2	10	183860	183869	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
510	NC_010581	GCAGC	2	10	183911	183920	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
511	NC_010581	TC	4	8	183923	183930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_010581	AGG	2	6	183970	183975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010581	GGCATA	2	12	183980	183991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_010581	TTC	2	6	184547	184552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010581	CTCG	2	8	184595	184602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_010581	AGA	2	6	184637	184642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010581	CAT	2	6	186003	186008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010581	AGA	2	6	186069	186074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010581	AAC	2	6	186959	186964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_010581	T	6	6	187000	187005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010581	T	6	6	187991	187996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010581	CG	3	6	188010	188015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_010581	CCT	2	6	188075	188080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_010581	CT	3	6	188091	188096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_010581	AAG	2	6	188142	188147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010581	CG	3	6	189610	189615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_010581	GCG	2	6	190394	190399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_010581	TAT	2	6	195285	195290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010581	TAT	2	6	195300	195305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010581	TCA	2	6	195400	195405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010581	AGAGAA	2	12	195421	195432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010581	GATC	2	8	195441	195448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_010581	CGG	2	6	195459	195464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010581	G	6	6	195718	195723	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010581	CGAA	2	8	195758	195765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_010581	A	6	6	195841	195846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010581	ACG	2	6	197083	197088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_010581	CGC	2	6	197178	197183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_010581	GCG	2	6	197250	197255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010581	TGG	2	6	197288	197293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010581	AGCGC	2	10	197316	197325	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
542	NC_010581	AGTC	2	8	197336	197343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_010581	TGCG	2	8	197347	197354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_010581	AGG	2	6	197359	197364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010581	GCG	2	6	197382	197387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_010581	TTTG	2	8	197429	197436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010581	GAT	2	6	197460	197465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010581	GGC	2	6	197468	197473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010581	GCC	2	6	197477	197482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_010581	GACA	2	8	197520	197527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_010581	CT	4	8	197569	197576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_010581	ATCAG	2	10	197589	197598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
553	NC_010581	TTC	2	6	197669	197674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010581	AATG	2	8	200798	200805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010581	GAA	2	6	200842	200847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010581	TTC	2	6	200878	200883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010581	GCGG	2	8	202029	202036	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
558	NC_010581	CGTT	2	8	202095	202102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_010581	TCT	2	6	202168	202173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010581	CGA	2	6	202274	202279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010581	GCG	2	6	203320	203325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010581	ATT	3	9	203381	203389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010581	T	9	9	203412	203420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010581	GTAAA	2	10	203421	203430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010581	TTC	2	6	203441	203446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010581	AG	4	8	203466	203473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010581	GGCTT	2	10	205214	205223	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
568	NC_010581	TC	3	6	206252	206257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_010581	ATC	2	6	206261	206266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010581	GGA	2	6	206340	206345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010581	AGA	2	6	209157	209162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010581	GGA	2	6	209204	209209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010581	TAT	2	6	212332	212337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010581	GC	3	6	212377	212382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_010581	ATT	2	6	212386	212391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010581	CGC	2	6	212443	212448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_010581	CCTC	2	8	212474	212481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
578	NC_010581	ACA	2	6	215199	215204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_010581	GAC	2	6	215240	215245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010581	TCC	2	6	216270	216275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010581	TTG	2	6	216280	216285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010581	TTTATA	2	12	216287	216298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010581	GAAT	2	8	216303	216310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010581	GTC	2	6	216323	216328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010581	GAT	2	6	216366	216371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010581	AATC	2	8	216401	216408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_010581	GAA	2	6	216499	216504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010581	TTTC	2	8	216529	216536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_010581	TGCA	2	8	216565	216572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_010581	A	6	6	216576	216581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010581	TGAT	2	8	216592	216599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010581	T	6	6	216667	216672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010581	TCC	2	6	217989	217994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_010581	TCA	2	6	218045	218050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010581	TTTGCG	2	12	218074	218085	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
596	NC_010581	ATA	2	6	218144	218149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010581	GC	3	6	218168	218173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_010581	T	6	6	221465	221470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010581	GGC	2	6	221502	221507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010581	TTG	2	6	221532	221537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010581	TAT	2	6	221545	221550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010581	CTG	2	6	222791	222796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010581	ACA	2	6	223451	223456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010581	CGAA	2	8	223466	223473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_010581	TAT	2	6	224019	224024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010581	GTC	2	6	224044	224049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010581	GCTTC	2	10	224080	224089	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
608	NC_010581	GT	3	6	224304	224309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010581	ATA	2	6	224327	224332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010581	A	6	6	224359	224364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010581	T	6	6	224379	224384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010581	T	6	6	224429	224434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010581	TTG	2	6	224521	224526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010581	A	6	6	224541	224546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010581	TTC	2	6	224553	224558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010581	GCCAA	2	10	224568	224577	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
617	NC_010581	GGC	2	6	232290	232295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010581	CAG	2	6	234423	234428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010581	ATC	2	6	234457	234462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010581	TCG	2	6	234554	234559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010581	CG	3	6	234558	234563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_010581	GGT	2	6	234570	234575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010581	TGA	2	6	234589	234594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010581	AATG	2	8	235968	235975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010581	TTC	2	6	236048	236053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010581	CG	3	6	237940	237945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_010581	CG	3	6	237977	237982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_010581	CG	3	6	237992	237997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_010581	GAG	2	6	238055	238060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010581	GCG	2	6	238069	238074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010581	CGTG	2	8	240517	240524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
632	NC_010581	CTT	2	6	240562	240567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_010581	CGG	2	6	240571	240576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010581	CCA	2	6	240586	240591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_010581	GAT	2	6	240597	240602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010581	TGTT	2	8	240617	240624	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010581	ATC	2	6	240740	240745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_010581	TGC	2	6	240769	240774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_010581	GAAATA	2	12	240824	240835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010581	AT	3	6	240854	240859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_010581	T	8	8	240859	240866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_010581	GGC	2	6	240877	240882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_010581	CGA	2	6	241007	241012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_010581	TCA	2	6	241060	241065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_010581	GCGG	2	8	241079	241086	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
646	NC_010581	GTG	2	6	241106	241111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
647	NC_010581	CTT	2	6	241173	241178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_010581	AG	3	6	241190	241195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
649	NC_010581	TCA	2	6	241287	241292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_010581	CCG	2	6	241295	241300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_010581	TGC	2	6	241331	241336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_010581	GTG	2	6	241423	241428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
653	NC_010581	GAA	2	6	241441	241446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
654	NC_010581	GC	3	6	242498	242503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
655	NC_010581	TGA	2	6	242552	242557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
656	NC_010581	TTTC	2	8	243513	243520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
657	NC_010581	GC	3	6	243574	243579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
658	NC_010581	GCTT	2	8	243624	243631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
659	NC_010581	GA	3	6	243633	243638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
660	NC_010581	GC	3	6	243657	243662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
661	NC_010581	ATCGG	2	10	243665	243674	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
662	NC_010581	TCC	2	6	243692	243697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
663	NC_010581	GGA	2	6	245896	245901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
664	NC_010581	GCG	2	6	245919	245924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_010581	GCG	2	6	246001	246006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_010581	GGA	2	6	246009	246014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
667	NC_010581	TTC	2	6	248190	248195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_010581	CAT	2	6	249392	249397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_010581	ATT	3	9	250390	250398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_010581	GGC	2	6	250439	250444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
676	NC_010581	TAG	2	6	250468	250473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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682	NC_010581	AAG	2	6	250783	250788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
683	NC_010581	CT	3	6	250808	250813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
684	NC_010581	TCT	2	6	251838	251843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
685	NC_010581	CT	3	6	251842	251847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
686	NC_010581	CGG	2	6	251872	251877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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715	NC_010581	CGT	2	6	261296	261301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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768	NC_010581	TATTC	2	10	282552	282561	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
769	NC_010581	GCTCT	2	10	282563	282572	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
770	NC_010581	ATC	2	6	282601	282606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_010581	GCCA	2	8	282747	282754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
772	NC_010581	TGA	2	6	282764	282769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
773	NC_010581	GAG	2	6	282807	282812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
774	NC_010581	CTG	2	6	282815	282820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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