MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010581	CTG	2	6	2453427	2453432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_010581	CTTT	2	8	2453586	2453593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_010581	TTGC	2	8	2453684	2453691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7004	NC_010581	A	6	6	2454940	2454945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_010581	CTCA	2	8	2454956	2454963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_010581	CATT	2	8	2454967	2454974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7007	NC_010581	GAT	2	6	2455061	2455066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_010581	GGA	2	6	2455077	2455082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_010581	TCC	2	6	2455084	2455089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_010581	TGA	2	6	2455208	2455213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_010581	TGCA	2	8	2455755	2455762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7012	NC_010581	GAAAA	2	10	2455804	2455813	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_010581	TCAA	2	8	2463399	2463406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7014	NC_010581	ACG	2	6	2465014	2465019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_010581	AGA	2	6	2468371	2468376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_010581	GA	3	6	2468375	2468380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_010581	GCCA	2	8	2468458	2468465	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7018	NC_010581	ATG	2	6	2468479	2468484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_010581	GAG	2	6	2468498	2468503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_010581	CGT	2	6	2468697	2468702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_010581	GAA	2	6	2468707	2468712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_010581	CGG	2	6	2468763	2468768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_010581	CCG	2	6	2468773	2468778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_010581	GATG	2	8	2468938	2468945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_010581	AGGG	2	8	2468947	2468954	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_010581	CGTC	2	8	2472045	2472052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7027	NC_010581	CGGC	2	8	2473268	2473275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_010581	AGAAAT	2	12	2473278	2473289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_010581	GAT	2	6	2473293	2473298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_010581	CCCT	2	8	2473314	2473321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7031	NC_010581	CTT	2	6	2473602	2473607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_010581	ACTCG	2	10	2474630	2474639	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7033	NC_010581	AGC	3	9	2474705	2474713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_010581	GAGTC	2	10	2474790	2474799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7035	NC_010581	ATT	2	6	2474804	2474809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_010581	GAG	2	6	2474845	2474850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_010581	GTT	3	9	2478304	2478312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_010581	TC	3	6	2478358	2478363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_010581	CCCA	2	8	2478385	2478392	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7040	NC_010581	CCGG	2	8	2478490	2478497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_010581	TCGG	2	8	2480671	2480678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_010581	CA	3	6	2480685	2480690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7043	NC_010581	T	6	6	2480728	2480733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_010581	CA	4	8	2480811	2480818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_010581	ACC	2	6	2480848	2480853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_010581	CGG	2	6	2480861	2480866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_010581	T	6	6	2480894	2480899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_010581	GCCC	2	8	2480934	2480941	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7049	NC_010581	TCT	2	6	2487707	2487712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_010581	TCA	2	6	2488098	2488103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_010581	ATC	3	9	2489150	2489158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_010581	TCA	2	6	2489193	2489198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_010581	GAC	2	6	2489241	2489246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_010581	CAAC	2	8	2491690	2491697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7055	NC_010581	TGAT	2	8	2491725	2491732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_010581	CCG	2	6	2491761	2491766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_010581	TCG	2	6	2491823	2491828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_010581	CGA	2	6	2491839	2491844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_010581	TCC	2	6	2491847	2491852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_010581	TTTC	2	8	2491901	2491908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7061	NC_010581	A	6	6	2491917	2491922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_010581	GGC	2	6	2491923	2491928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_010581	CGC	2	6	2491943	2491948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_010581	GCAA	2	8	2494478	2494485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7065	NC_010581	AAG	2	6	2494552	2494557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_010581	TTG	2	6	2494605	2494610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_010581	AG	3	6	2494624	2494629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_010581	ATC	2	6	2495909	2495914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_010581	ATG	2	6	2495965	2495970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_010581	TGGC	2	8	2495975	2495982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7071	NC_010581	AACC	2	8	2496014	2496021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7072	NC_010581	C	6	6	2496049	2496054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7073	NC_010581	CGT	2	6	2496079	2496084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_010581	TCG	2	6	2496292	2496297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_010581	A	6	6	2496302	2496307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_010581	CGC	2	6	2496351	2496356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7077	NC_010581	CGA	2	6	2496375	2496380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_010581	GTCTT	2	10	2497103	2497112	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7079	NC_010581	CTGAG	2	10	2497115	2497124	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7080	NC_010581	CG	3	6	2497229	2497234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_010581	TGC	2	6	2497249	2497254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_010581	CG	3	6	2497298	2497303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7083	NC_010581	CGG	2	6	2497309	2497314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_010581	ATC	2	6	2497328	2497333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_010581	GAA	2	6	2497342	2497347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_010581	GA	3	6	2497350	2497355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_010581	AG	3	6	2497415	2497420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_010581	TC	4	8	2497452	2497459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7089	NC_010581	ATG	2	6	2497543	2497548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7091	NC_010581	T	6	6	2497670	2497675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_010581	GAA	2	6	2497840	2497845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_010581	TCAA	2	8	2499289	2499296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7094	NC_010581	CG	3	6	2499335	2499340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7095	NC_010581	GCC	3	9	2499352	2499360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7096	NC_010581	CA	3	6	2499408	2499413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7097	NC_010581	TCA	2	6	2499463	2499468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7099	NC_010581	GCA	2	6	2499587	2499592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_010581	A	6	6	2499592	2499597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_010581	TCG	2	6	2499654	2499659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_010581	CAA	2	6	2499696	2499701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_010581	CAATCG	2	12	2501927	2501938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_010581	CAC	2	6	2501943	2501948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_010581	TCC	2	6	2505001	2505006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7106	NC_010581	CAC	2	6	2505025	2505030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7107	NC_010581	CGG	2	6	2505035	2505040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_010581	AGG	2	6	2505074	2505079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_010581	TA	3	6	2505090	2505095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_010581	GAT	2	6	2505119	2505124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_010581	CAT	2	6	2506765	2506770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_010581	GAT	2	6	2506832	2506837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_010581	GAA	2	6	2506888	2506893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_010581	TCC	2	6	2507030	2507035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_010581	CCGG	2	8	2507447	2507454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_010581	CCG	2	6	2508379	2508384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_010581	CGC	2	6	2508408	2508413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_010581	AGCC	2	8	2508503	2508510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7119	NC_010581	A	6	6	2508529	2508534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_010581	ATCTTT	2	12	2508599	2508610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7121	NC_010581	TGG	2	6	2510584	2510589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_010581	ATC	2	6	2511316	2511321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_010581	GATC	2	8	2511419	2511426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7124	NC_010581	CAA	2	6	2511477	2511482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_010581	CG	3	6	2511503	2511508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_010581	ACC	2	6	2511520	2511525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7127	NC_010581	TGC	3	9	2511566	2511574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_010581	GCA	2	6	2511587	2511592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_010581	CGCA	2	8	2511599	2511606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7130	NC_010581	GGC	2	6	2511695	2511700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_010581	ATT	2	6	2511713	2511718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7242	NC_010581	CGAG	2	8	2564671	2564678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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