MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010581	AGG	2	6	2097367	2097372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010581	GCGA	2	8	2100464	2100471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_010581	AAGC	2	8	2100645	2100652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_010581	ATC	2	6	2100739	2100744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_010581	TCA	2	6	2100884	2100889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_010581	T	6	6	2100913	2100918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010581	CCT	2	6	2100920	2100925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_010581	GT	3	6	2100980	2100985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_010581	TCG	2	6	2103603	2103608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_010581	T	6	6	2103811	2103816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_010581	GAAC	2	8	2103875	2103882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_010581	TGA	2	6	2103900	2103905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010581	GAA	2	6	2104015	2104020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_010581	CGC	2	6	2105234	2105239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_010581	AGG	2	6	2105240	2105245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010581	CTTTC	2	10	2108161	2108170	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6017	NC_010581	TCA	2	6	2108174	2108179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_010581	CAA	2	6	2108556	2108561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_010581	AATC	2	8	2108576	2108583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_010581	A	6	6	2109976	2109981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_010581	T	6	6	2110962	2110967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010581	AG	5	10	2110977	2110986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_010581	TAA	2	6	2112305	2112310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010581	GAAG	2	8	2112318	2112325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_010581	TCT	2	6	2113571	2113576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_010581	CAT	2	6	2113577	2113582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_010581	GTT	2	6	2113596	2113601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_010581	ATG	2	6	2113636	2113641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010581	ATCA	2	8	2113650	2113657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_010581	TTA	2	6	2113658	2113663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_010581	AT	3	6	2113693	2113698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_010581	ATG	2	6	2113721	2113726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_010581	GGA	2	6	2115020	2115025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_010581	TAGC	2	8	2115090	2115097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_010581	TGC	2	6	2115108	2115113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_010581	TGA	2	6	2115183	2115188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_010581	TGT	2	6	2115199	2115204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010581	CT	3	6	2115288	2115293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_010581	GCC	2	6	2115308	2115313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_010581	ATG	2	6	2115408	2115413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_010581	CG	3	6	2115423	2115428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_010581	ATG	2	6	2116727	2116732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010581	GAC	2	6	2116806	2116811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_010581	GAG	2	6	2116901	2116906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_010581	TCA	2	6	2116930	2116935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_010581	ATGA	2	8	2116957	2116964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_010581	CCG	2	6	2116985	2116990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_010581	ATC	2	6	2117067	2117072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_010581	CTTG	2	8	2117124	2117131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_010581	TGCC	2	8	2117143	2117150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_010581	CGG	2	6	2117507	2117512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_010581	CGCC	2	8	2117518	2117525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6053	NC_010581	GAT	2	6	2117545	2117550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_010581	TTA	2	6	2117602	2117607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010581	GAC	2	6	2119552	2119557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_010581	GTTT	2	8	2119565	2119572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010581	GGA	2	6	2119591	2119596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010581	GTC	2	6	2119606	2119611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_010581	CCT	2	6	2120485	2120490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_010581	AGA	2	6	2120524	2120529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010581	ATC	2	6	2120539	2120544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_010581	CAT	2	6	2120672	2120677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_010581	AGC	2	6	2120698	2120703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_010581	AAG	2	6	2120717	2120722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_010581	GGC	2	6	2120731	2120736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_010581	CAAG	2	8	2120757	2120764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_010581	CCG	2	6	2120766	2120771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_010581	GAG	2	6	2120797	2120802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_010581	CTG	2	6	2121597	2121602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_010581	CCT	2	6	2121643	2121648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_010581	AAG	2	6	2121664	2121669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010581	GCG	2	6	2121685	2121690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_010581	TCC	2	6	2121707	2121712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_010581	GGT	2	6	2121768	2121773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_010581	GGT	2	6	2121786	2121791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_010581	ACCC	2	8	2121824	2121831	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6077	NC_010581	GAG	2	6	2122328	2122333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_010581	GT	3	6	2123777	2123782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_010581	TC	3	6	2123809	2123814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_010581	AAC	2	6	2123824	2123829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_010581	CAT	2	6	2123924	2123929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_010581	GTTC	2	8	2123953	2123960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_010581	CTT	2	6	2123976	2123981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_010581	AG	3	6	2124055	2124060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_010581	AGC	2	6	2124105	2124110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_010581	CT	3	6	2126589	2126594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_010581	TTG	2	6	2126608	2126613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_010581	TCC	2	6	2127698	2127703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_010581	GA	3	6	2129681	2129686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_010581	AGA	2	6	2129711	2129716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_010581	GT	3	6	2131130	2131135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010581	TGA	2	6	2131143	2131148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_010581	GCG	2	6	2131298	2131303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_010581	GAA	2	6	2131394	2131399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010581	GAAT	2	8	2131402	2131409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010581	CAA	2	6	2131500	2131505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_010581	TCA	2	6	2133693	2133698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_010581	CTTC	2	8	2133866	2133873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_010581	GCC	2	6	2133885	2133890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_010581	GCA	2	6	2134814	2134819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_010581	GT	3	6	2134861	2134866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_010581	CGC	2	6	2134949	2134954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_010581	CGA	2	6	2134973	2134978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_010581	A	6	6	2135015	2135020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_010581	GTTC	2	8	2136659	2136666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6106	NC_010581	C	8	8	2136670	2136677	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6107	NC_010581	T	6	6	2136745	2136750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_010581	AGC	2	6	2136753	2136758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_010581	ACCC	2	8	2136810	2136817	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6110	NC_010581	CGT	2	6	2136819	2136824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_010581	ATG	2	6	2136826	2136831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_010581	TGA	2	6	2136878	2136883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_010581	CTTT	2	8	2136900	2136907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_010581	GGC	2	6	2137138	2137143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_010581	TTGA	2	8	2137211	2137218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_010581	CCTT	2	8	2137305	2137312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_010581	ATC	2	6	2137343	2137348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_010581	TC	3	6	2137417	2137422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_010581	AAT	2	6	2137423	2137428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_010581	TCA	2	6	2137486	2137491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_010581	GCG	2	6	2137562	2137567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_010581	CGG	2	6	2137584	2137589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_010581	AGA	2	6	2137669	2137674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_010581	ACTG	2	8	2138383	2138390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_010581	CGA	2	6	2139227	2139232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_010581	TCA	2	6	2139236	2139241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_010581	CGC	2	6	2139249	2139254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_010581	TG	3	6	2140062	2140067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_010581	AT	3	6	2140224	2140229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_010581	TCG	2	6	2140291	2140296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_010581	ACGA	2	8	2140330	2140337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6132	NC_010581	TCAT	2	8	2140346	2140353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_010581	CAA	2	6	2140373	2140378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_010581	A	8	8	2140382	2140389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_010581	ACGGC	2	10	2140420	2140429	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6139	NC_010581	GCC	2	6	2140511	2140516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6141	NC_010581	CTC	2	6	2142124	2142129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6144	NC_010581	GGC	2	6	2144073	2144078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6145	NC_010581	CT	3	6	2144079	2144084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6146	NC_010581	CGCA	2	8	2144786	2144793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6148	NC_010581	CG	3	6	2145541	2145546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6149	NC_010581	CGT	2	6	2145554	2145559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6152	NC_010581	CT	3	6	2145786	2145791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6153	NC_010581	AACC	2	8	2145845	2145852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6154	NC_010581	AG	3	6	2151784	2151789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6159	NC_010581	CAT	2	6	2155073	2155078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6163	NC_010581	GCC	2	6	2156853	2156858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6164	NC_010581	CAA	2	6	2156875	2156880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6166	NC_010581	TGG	2	6	2159784	2159789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6168	NC_010581	A	6	6	2159923	2159928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6176	NC_010581	CCA	3	9	2163049	2163057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6181	NC_010581	A	6	6	2163287	2163292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6182	NC_010581	TTA	2	6	2163303	2163308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6230	NC_010581	TCCA	2	8	2174374	2174381	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6231	NC_010581	CT	3	6	2174430	2174435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6232	NC_010581	AAT	2	6	2175688	2175693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6238	NC_010581	TTCTC	2	10	2179095	2179104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6246	NC_010581	ATT	2	6	2186865	2186870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6248	NC_010581	GGC	2	6	2187089	2187094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6250	NC_010581	GAC	2	6	2187667	2187672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6252	NC_010581	AG	3	6	2188946	2188951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_010581	ATT	2	6	2189002	2189007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_010581	CGC	3	9	2193537	2193545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6257	NC_010581	GCGG	2	8	2193560	2193567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6258	NC_010581	AAAGC	2	10	2193633	2193642	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6259	NC_010581	GC	3	6	2193673	2193678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6260	NC_010581	GAT	2	6	2193697	2193702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_010581	A	7	7	2193803	2193809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6396	NC_010581	TTC	2	6	2252150	2252155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6397	NC_010581	TGCC	2	8	2252185	2252192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6398	NC_010581	A	6	6	2252204	2252209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_010581	TAT	3	9	2252247	2252255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6403	NC_010581	TATAAA	2	12	2259708	2259719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6407	NC_010581	ACC	2	6	2261631	2261636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6408	NC_010581	TGC	2	6	2261977	2261982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6428	NC_010581	CCGT	2	8	2268104	2268111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6432	NC_010581	TCA	2	6	2268565	2268570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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