MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010581	AGCG	2	8	1947470	1947477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_010581	GGC	2	6	1947479	1947484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_010581	GAT	2	6	1947562	1947567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_010581	CCA	2	6	1950331	1950336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_010581	CCG	2	6	1950357	1950362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_010581	ATT	2	6	1950508	1950513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_010581	ATG	2	6	1950563	1950568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_010581	TAA	2	6	1950674	1950679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010581	CCG	2	6	1950692	1950697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_010581	CTTT	2	8	1950714	1950721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_010581	CAA	2	6	1951269	1951274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_010581	ATC	2	6	1951433	1951438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_010581	T	6	6	1951441	1951446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_010581	TAAGCT	2	12	1951452	1951463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5515	NC_010581	TTC	2	6	1951607	1951612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_010581	ATCCC	2	10	1953154	1953163	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5517	NC_010581	CT	3	6	1953176	1953181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_010581	AATC	2	8	1953191	1953198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_010581	CAT	2	6	1953237	1953242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_010581	AAG	2	6	1953252	1953257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_010581	ACCTA	2	10	1953258	1953267	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5522	NC_010581	ATCC	2	8	1953290	1953297	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_010581	ACG	2	6	1953485	1953490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_010581	GAA	2	6	1953579	1953584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_010581	AGA	2	6	1953715	1953720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_010581	ATC	2	6	1953740	1953745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_010581	AG	4	8	1953778	1953785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_010581	CTT	3	9	1953882	1953890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_010581	TCT	2	6	1953899	1953904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_010581	CAA	2	6	1954018	1954023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_010581	GCG	2	6	1954790	1954795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_010581	CAG	2	6	1954820	1954825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_010581	CGA	2	6	1954829	1954834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_010581	CAGG	2	8	1954846	1954853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_010581	GAC	2	6	1954874	1954879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5537	NC_010581	ATC	2	6	1954967	1954972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_010581	AGGA	2	8	1956704	1956711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_010581	ATG	2	6	1959911	1959916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_010581	GCG	2	6	1959940	1959945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_010581	T	6	6	1959991	1959996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_010581	A	6	6	1960020	1960025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_010581	ACGAG	2	10	1960070	1960079	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5544	NC_010581	CGTCA	2	10	1960081	1960090	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5545	NC_010581	ATC	2	6	1961744	1961749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_010581	ATTC	2	8	1961791	1961798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_010581	AAT	2	6	1961799	1961804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_010581	CGT	2	6	1964752	1964757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_010581	CCG	2	6	1964783	1964788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_010581	TGG	2	6	1964840	1964845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_010581	GAA	2	6	1964880	1964885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5553	NC_010581	TCA	2	6	1965139	1965144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_010581	TGA	2	6	1965219	1965224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_010581	AAT	2	6	1965238	1965243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_010581	TCC	2	6	1965669	1965674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_010581	T	7	7	1967426	1967432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_010581	CG	3	6	1967556	1967561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_010581	GGC	2	6	1967585	1967590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_010581	TTC	2	6	1967599	1967604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_010581	CT	3	6	1967647	1967652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_010581	TGCC	2	8	1967663	1967670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_010581	AGG	2	6	1967737	1967742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_010581	ATCA	2	8	1968116	1968123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_010581	GCGTC	2	10	1968133	1968142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5566	NC_010581	CCG	2	6	1968192	1968197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_010581	TCCG	2	8	1968219	1968226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_010581	TGTC	2	8	1968240	1968247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_010581	GTT	2	6	1968302	1968307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5574	NC_010581	TTC	2	6	1968448	1968453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_010581	CG	3	6	1968474	1968479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5585	NC_010581	CTT	2	6	1971599	1971604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_010581	GAA	2	6	1971699	1971704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_010581	GC	3	6	1971787	1971792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_010581	GC	3	6	1971900	1971905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_010581	CTG	2	6	1971924	1971929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5597	NC_010581	AT	3	6	1978306	1978311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_010581	CAGA	2	8	1978439	1978446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_010581	GCCC	2	8	1978448	1978455	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5600	NC_010581	CTC	2	6	1978475	1978480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_010581	CAT	2	6	1978485	1978490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5603	NC_010581	AAGGC	2	10	1978553	1978562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5606	NC_010581	TAT	2	6	1979042	1979047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5611	NC_010581	TC	3	6	1984234	1984239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_010581	CCTG	2	8	1984244	1984251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_010581	ATT	2	6	1986627	1986632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_010581	ATT	2	6	1991853	1991858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_010581	TCC	2	6	1993179	1993184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_010581	AG	3	6	1993279	1993284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_010581	ACA	3	9	1993294	1993302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_010581	TCCCC	2	10	1993332	1993341	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5619	NC_010581	GTTTT	2	10	1993354	1993363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_010581	CAGA	2	8	1993377	1993384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5621	NC_010581	GCC	2	6	1993423	1993428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_010581	CTT	2	6	1993460	1993465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_010581	A	7	7	1993577	1993583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010581	A	6	6	1993609	1993614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010581	AAGAA	2	10	1993617	1993626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_010581	CGTC	2	8	1996324	1996331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5631	NC_010581	GAA	2	6	1996359	1996364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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