MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	ATTC	2	8	9172	9179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010580	CATT	2	8	9758	9765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010580	GCAC	2	8	15224	15231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010580	GCAT	2	8	15558	15565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010580	CTTC	3	12	24934	24945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010580	CCAT	2	8	29293	29300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010580	AATA	2	8	30193	30200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010580	TACA	2	8	35162	35169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010580	TTGC	2	8	35193	35200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010580	AGGA	2	8	37487	37494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010580	GCTT	2	8	38884	38891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010580	CTTC	2	8	39128	39135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010580	AGGC	2	8	39189	39196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010580	CAGC	2	8	39246	39253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010580	GGCA	2	8	40387	40394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010580	GGCT	2	8	41906	41913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010580	TCTG	2	8	41987	41994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010580	CGTG	2	8	42128	42135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010580	GCAT	2	8	42525	42532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010580	TGAA	2	8	43930	43937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010580	GCGG	2	8	43940	43947	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010580	CCCT	2	8	47585	47592	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_010580	GCCT	2	8	47636	47643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010580	AAGG	2	8	54205	54212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010580	CGGC	2	8	55078	55085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010580	TCCC	2	8	55107	55114	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_010580	TCTT	2	8	55118	55125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010580	CGGC	2	8	56695	56702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010580	TCTT	2	8	56728	56735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010580	CATG	2	8	58590	58597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010580	CTGG	2	8	58638	58645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010580	TTGT	2	8	58678	58685	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010580	CTTT	2	8	63696	63703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010580	TTGA	2	8	67572	67579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010580	GGGA	2	8	67628	67635	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010580	ATCG	2	8	68037	68044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010580	CGAG	2	8	68186	68193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010580	TGAT	2	8	68718	68725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010580	GTCT	2	8	69071	69078	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010580	ATTG	2	8	71054	71061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010580	GGCG	2	8	71183	71190	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010580	GCTC	2	8	71783	71790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010580	TCGA	2	8	74766	74773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010580	TTGC	2	8	74857	74864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010580	TCTA	2	8	79272	79279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010580	TCGC	2	8	82729	82736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010580	AGAT	2	8	88413	88420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010580	GGAA	2	8	88463	88470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010580	TGGA	2	8	88580	88587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010580	TCCA	2	8	91129	91136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010580	CGGT	2	8	94354	94361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010580	CATA	2	8	94635	94642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010580	AATG	2	8	94705	94712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010580	TCGG	2	8	95529	95536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010580	AAAT	2	8	96687	96694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010580	CATG	2	8	97328	97335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010580	GGCG	2	8	98193	98200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010580	CCGG	2	8	98261	98268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010580	GACG	2	8	98431	98438	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010580	TGGC	2	8	98498	98505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010580	TGAT	2	8	101001	101008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010580	ATCG	2	8	101332	101339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010580	GCCA	2	8	101452	101459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010580	CAGA	2	8	101484	101491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010580	CACG	2	8	102050	102057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010580	TTCC	2	8	102592	102599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010580	AGAT	2	8	102714	102721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010580	ATAA	2	8	102722	102729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010580	ATTT	2	8	109280	109287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010580	CTGG	2	8	109412	109419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010580	TTCA	2	8	123388	123395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010580	CAGA	2	8	123502	123509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010580	CCTT	2	8	123724	123731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010580	ATCC	2	8	126041	126048	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010580	CAAA	2	8	126810	126817	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010580	TCGT	2	8	128208	128215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010580	CCTT	2	8	128309	128316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010580	TGGC	2	8	128800	128807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010580	CATA	2	8	129576	129583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010580	GCCG	2	8	129726	129733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010580	CGAT	2	8	131578	131585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010580	CCAG	2	8	132760	132767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010580	CAAT	2	8	134781	134788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010580	AACC	2	8	135012	135019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010580	GCAG	2	8	136698	136705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010580	AATG	2	8	137452	137459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010580	CGAA	2	8	137584	137591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010580	ATTC	2	8	139200	139207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010580	AAAG	2	8	139856	139863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010580	GAAC	2	8	140641	140648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010580	TCAA	2	8	140722	140729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010580	CATG	2	8	147009	147016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010580	TCCT	2	8	147133	147140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010580	TCAG	2	8	147444	147451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010580	AAAG	2	8	147463	147470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010580	TTCG	2	8	147866	147873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010580	GTGG	2	8	148070	148077	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010580	CGAT	3	12	148560	148571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010580	CAAA	2	8	149660	149667	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010580	AGAA	2	8	150167	150174	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010580	TGTT	2	8	153600	153607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010580	AGCG	2	8	167095	167102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010580	ATTG	2	8	171657	171664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010580	TCCT	2	8	173900	173907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010580	CTTT	2	8	178258	178265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010580	CTTC	2	8	178329	178336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010580	TACC	2	8	181456	181463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.