MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010553	CAAAA	2	10	15957	15966	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010553	TCGCG	2	10	31532	31541	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010553	CGCTT	2	10	34267	34276	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010553	CTGCG	2	10	35891	35900	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010553	AACGG	2	10	38056	38065	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010553	GACTT	2	10	38767	38776	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010553	TCACT	2	10	38804	38813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010553	GACTT	2	10	43974	43983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010553	TCACC	2	10	64965	64974	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010553	TCACC	2	10	65019	65028	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010553	AGGTG	2	10	65429	65438	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010553	GGCGG	2	10	70558	70567	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010553	GCGCC	2	10	70570	70579	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_010553	CCAGC	2	10	70971	70980	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010553	CATGG	2	10	71139	71148	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010553	CTCGC	2	10	75102	75111	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_010553	GCGCC	2	10	85186	85195	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_010553	TGCGT	2	10	87050	87059	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010553	TCGGC	2	10	103865	103874	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010553	TCGGC	2	10	105005	105014	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010553	TCGGC	2	10	106163	106172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010553	CACGG	2	10	110543	110552	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010553	TGGCG	2	10	110710	110719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010553	AAGCA	2	10	121839	121848	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010553	CCGGC	2	10	122987	122996	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_010553	GGCAC	2	10	125035	125044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010553	CGGCG	2	10	141700	141709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010553	CTCGG	2	10	143105	143114	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010553	GCCAA	2	10	143314	143323	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_010553	GGGTG	2	10	145288	145297	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010553	GAAAG	2	10	145480	145489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010553	CGTCT	2	10	145588	145597	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_010553	TGGGT	2	10	146883	146892	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010553	TTTTA	2	10	146898	146907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010553	TGCGC	2	10	147968	147977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010553	GCGTC	2	10	155371	155380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010553	AGTCG	2	10	162338	162347	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010553	GCACG	2	10	172316	172325	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010553	TTTTG	2	10	181620	181629	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010553	CGGAT	2	10	201861	201870	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010553	GCATC	2	10	202151	202160	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010553	GCCGC	2	10	204797	204806	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_010553	TTGGA	2	10	208680	208689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010553	GGCGA	2	10	213258	213267	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010553	CGGGC	2	10	213332	213341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010553	GCTCG	2	10	219114	219123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_010553	CCGAG	2	10	227547	227556	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010553	TGAAA	2	10	227828	227837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010553	TAGAC	2	10	233925	233934	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010553	TAAAA	2	10	243356	243365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010553	CGCGC	2	10	279582	279591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_010553	TACGG	2	10	279842	279851	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.