MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010553	GGGT	2	8	9532	9539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010553	ATGG	2	8	11734	11741	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010553	AGGT	2	8	11791	11798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010553	GTAA	2	8	13307	13314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010553	AGCG	2	8	13365	13372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010553	ACCG	2	8	17665	17672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010553	GTTG	2	8	22016	22023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010553	GATA	2	8	24603	24610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010553	GCCG	2	8	25980	25987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010553	GATG	2	8	28547	28554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010553	TGTC	2	8	29084	29091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010553	TGCA	2	8	31380	31387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010553	CGAG	2	8	31987	31994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010553	CAAA	2	8	34564	34571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010553	TCGC	2	8	38638	38645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010553	CGCC	2	8	43257	43264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_010553	CGGG	2	8	43832	43839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010553	GACC	2	8	45066	45073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010553	CTTG	2	8	65485	65492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010553	CCGA	2	8	68192	68199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010553	CAGG	2	8	72592	72599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010553	CGCC	2	8	75263	75270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_010553	CCCT	2	8	78000	78007	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_010553	GAAA	2	8	78048	78055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010553	CAAG	2	8	78510	78517	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010553	ATCG	2	8	78807	78814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010553	GAGG	2	8	78843	78850	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010553	ACCT	2	8	80017	80024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010553	CAGA	2	8	82601	82608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010553	CCAC	2	8	82671	82678	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_010553	CTGG	2	8	85876	85883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010553	GGCT	2	8	85953	85960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010553	CACG	2	8	87074	87081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010553	CTCG	2	8	90398	90405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010553	TGGC	2	8	90417	90424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010553	GCGA	2	8	98601	98608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010553	TCGC	2	8	101107	101114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010553	CCCG	2	8	102248	102255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_010553	ACGG	2	8	102479	102486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010553	GCTG	2	8	102610	102617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010553	GCGA	2	8	102819	102826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010553	GTAG	2	8	102830	102837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010553	CATA	2	8	102904	102911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010553	TTTA	2	8	103080	103087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010553	GAAT	2	8	103143	103150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010553	GTGG	2	8	103161	103168	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010553	CATG	2	8	103274	103281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010553	CGTC	2	8	103583	103590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010553	TGGT	2	8	109481	109488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010553	GCGA	2	8	109517	109524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010553	CTGA	2	8	109526	109533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010553	TCCG	2	8	109537	109544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010553	GTTG	2	8	110423	110430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010553	GGTA	2	8	110878	110885	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010553	AAAT	2	8	114606	114613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010553	ATGT	2	8	115904	115911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010553	GTGC	2	8	117735	117742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010553	GCTT	2	8	117743	117750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010553	AAAG	2	8	117843	117850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010553	CGAA	2	8	118080	118087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010553	GATA	2	8	122394	122401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010553	CGAA	2	8	123081	123088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010553	GTAA	2	8	126346	126353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010553	CATT	2	8	128318	128325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010553	TCGG	2	8	128504	128511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010553	AGCG	2	8	132731	132738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010553	GCAA	2	8	132752	132759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010553	CGGT	2	8	132849	132856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010553	GCAA	2	8	135401	135408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010553	ATCG	2	8	135651	135658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010553	GAGG	2	8	135687	135694	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010553	TCCT	2	8	137141	137148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010553	ATAA	2	8	137455	137462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010553	GCTG	2	8	141685	141692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010553	CGCA	2	8	143026	143033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010553	ACTA	2	8	143200	143207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010553	CGAT	2	8	143633	143640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010553	CTCG	2	8	143821	143828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010553	GCAG	2	8	143891	143898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010553	CTCG	2	8	143954	143961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010553	ATCA	2	8	143966	143973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010553	CGGT	2	8	144095	144102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010553	GCGG	2	8	144137	144144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010553	GCTC	2	8	144247	144254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010553	GATC	2	8	144453	144460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010553	CGGC	2	8	144821	144828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010553	CGGC	2	8	144842	144849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010553	CTTT	2	8	145096	145103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010553	CATT	2	8	145125	145132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010553	TTGG	2	8	145383	145390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010553	GCCG	2	8	145404	145411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010553	CCGA	2	8	145704	145711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010553	AACA	2	8	146874	146881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010553	AACC	2	8	148743	148750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010553	CCCG	2	8	148841	148848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_010553	TTTG	2	8	149596	149603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010553	CGAT	2	8	149655	149662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010553	GCCG	2	8	149895	149902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010553	GCGG	2	8	152472	152479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010553	GCCC	2	8	154619	154626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_010553	CGGC	2	8	154867	154874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010553	CGAA	2	8	154950	154957	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010553	GCCG	2	8	155008	155015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010553	GGTC	2	8	155323	155330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010553	GATC	2	8	155335	155342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010553	CGAT	2	8	155469	155476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010553	ACAA	2	8	155501	155508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010553	ATTT	2	8	155849	155856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010553	CATC	2	8	156338	156345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010553	GGGC	2	8	157385	157392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010553	GCTG	2	8	157426	157433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010553	CGAA	2	8	157495	157502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010553	GCTG	2	8	157745	157752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010553	CGAA	2	8	157813	157820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010553	CCTG	2	8	159298	159305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010553	CCGA	2	8	159497	159504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010553	CAAC	2	8	160063	160070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010553	CATC	2	8	160135	160142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010553	ATGC	2	8	160159	160166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010553	TCGG	2	8	162249	162256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010553	TTCA	2	8	167491	167498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010553	AGAT	2	8	169979	169986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010553	TCGA	2	8	172365	172372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010553	AATT	2	8	197780	197787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010553	GGCT	2	8	197912	197919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010553	GTTC	2	8	197946	197953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010553	ACGA	2	8	202022	202029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010553	CCGA	2	8	202060	202067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010553	GGCG	2	8	202197	202204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010553	CATC	2	8	202762	202769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010553	GCGG	2	8	203347	203354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010553	CAGA	2	8	205029	205036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010553	GTTC	2	8	208560	208567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010553	GACC	2	8	208825	208832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010553	CGGT	2	8	208865	208872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010553	GATG	2	8	213938	213945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010553	CAAC	2	8	214869	214876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010553	CGTG	2	8	215012	215019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010553	TTGC	2	8	216037	216044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010553	CGTT	2	8	216642	216649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010553	AGCA	2	8	218287	218294	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010553	CACG	2	8	218424	218431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010553	GTCG	2	8	218774	218781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010553	CGGC	2	8	221623	221630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010553	GCCG	2	8	221640	221647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010553	GCCG	2	8	222118	222125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010553	CCGG	2	8	227653	227660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010553	GCCG	2	8	228895	228902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010553	TTTC	2	8	230606	230613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010553	GGCT	2	8	232015	232022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010553	CGTG	2	8	232527	232534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010553	CTGC	2	8	232544	232551	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010553	TGCT	2	8	242695	242702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010553	ACGA	2	8	243141	243148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_010553	CGAC	2	8	243241	243248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NC_010553	CGTC	2	8	260347	260354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_010553	GTTT	2	8	260526	260533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010553	AAAT	2	8	260534	260541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010553	GTTT	2	8	278210	278217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010553	CGCT	2	8	278374	278381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_010553	ATCC	2	8	278423	278430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_010553	CGGC	2	8	278983	278990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_010553	CAGC	2	8	279260	279267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_010553	GCCG	2	8	279441	279448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_010553	CTGG	2	8	279593	279600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
166	NC_010553	CGGC	2	8	279728	279735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_010553	GGAA	2	8	279952	279959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010553	GGGC	2	8	280553	280560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
169	NC_010553	CGAC	2	8	282853	282860	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_010553	TTCG	2	8	284036	284043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_010553	CCTT	2	8	284092	284099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_010553	CGGC	2	8	294282	294289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_010553	ACCT	2	8	296762	296769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.