MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia MC0-3 chromosome 3

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010512	CCACGA	2	12	44205	44216	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010512	GCACGA	2	12	57950	57961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010512	CTATTC	2	12	87166	87177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010512	ATAAAA	2	12	120788	120799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010512	ACCGAT	2	12	126508	126519	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010512	CGCGGC	2	12	152160	152171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010512	GACGGA	2	12	206563	206574	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010512	ACGCGT	2	12	236090	236101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010512	CGCCGT	2	12	265015	265026	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010512	GCGCCC	2	12	283350	283361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010512	CTGATC	2	12	311836	311847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010512	GCCGGC	2	12	326437	326448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010512	CGAACG	2	12	326843	326854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010512	GCTGGC	2	12	333158	333169	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010512	CTTCGA	2	12	366960	366971	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010512	TCCGCA	2	12	394395	394406	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010512	CGGCCC	2	12	394419	394430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010512	CGATGA	2	12	452832	452843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010512	GACCGC	2	12	458778	458789	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010512	AGATCG	2	12	488266	488277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010512	AACCCG	2	12	513893	513904	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010512	CGCTGA	2	12	529167	529178	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010512	TAGAAA	2	12	529792	529803	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010512	CCATGC	2	12	530018	530029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010512	TGGCGC	2	12	538407	538418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010512	TCGCCA	2	12	541359	541370	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010512	TCAAGG	2	12	588442	588453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010512	CCGGCA	3	18	635500	635517	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010512	GAATGC	2	12	670818	670829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010512	TGCTGG	2	12	689506	689517	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010512	GCCCCG	2	12	692051	692062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010512	CGGCGC	2	12	693307	693318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010512	TCGCGG	2	12	724875	724886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010512	GAAAAC	2	12	760569	760580	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010512	GCGTGC	2	12	767397	767408	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010512	GTATCG	2	12	774758	774769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010512	TAGCGG	6	36	867427	867462	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010512	CGTCGA	2	12	870390	870401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010512	TCGATG	2	12	872807	872818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010512	GTCGGC	2	12	878339	878350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010512	CCGGCC	2	12	878683	878694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010512	CGATTG	2	12	881466	881477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010512	GTCGAC	3	18	881851	881868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010512	CGACCA	2	12	882132	882143	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010512	GTCGAC	3	18	882643	882660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010512	ACGTCG	2	12	882776	882787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010512	TCGACC	2	12	884263	884274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010512	TCGACC	2	12	884323	884334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010512	ACTTCG	2	12	884503	884514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010512	TCGACC	2	12	884635	884646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010512	TCGACG	2	12	884710	884721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010512	CACGGT	2	12	884955	884966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010512	TCGACG	2	12	885505	885516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010512	TCGACC	3	18	885607	885624	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010512	TCGACG	2	12	885667	885678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010512	TCGACG	2	12	885721	885732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010512	TCGACT	2	12	885823	885834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010512	TCGACC	2	12	885877	885888	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010512	TCGACG	2	12	885937	885948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010512	TCGACT	2	12	886081	886092	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010512	TCGACC	2	12	886237	886248	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010512	TCGACC	2	12	886327	886338	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010512	TCGACC	2	12	886429	886440	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010512	TCGACC	3	18	886627	886644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010512	GCACTC	2	12	887032	887043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010512	TCGACC	2	12	887539	887550	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010512	GTCGAC	2	12	887607	887618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010512	GTGAAC	2	12	887953	887964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010512	GTTTAC	2	12	922374	922385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010512	TTTCCG	2	12	1007503	1007514	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010512	GTCGGC	2	12	1161337	1161348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010512	CGCCGG	2	12	1189624	1189635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010512	CCATGC	2	12	1206956	1206967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010512	CCCGGC	2	12	1214455	1214466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010512	CGGTCG	2	12	1221777	1221788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.