MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia MC0-3 chromosome 1

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010508	GGCCGA	2	12	75792	75803	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010508	GAATCT	2	12	100749	100760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010508	TCGCCG	2	12	105266	105277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010508	CTTTCC	2	12	105401	105412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010508	CGTTTT	2	12	106643	106654	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010508	CGGCTC	2	12	193868	193879	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010508	GCCCAA	8	48	193882	193929	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010508	TGCGGG	2	12	214812	214823	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010508	TTTTGC	2	12	250586	250597	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010508	GCCGGC	2	12	282460	282471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010508	GAGGCA	2	12	316766	316777	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010508	CGCGGG	2	12	326019	326030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010508	GCAGAT	2	12	352044	352055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010508	TTTTTG	2	12	387982	387993	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010508	CCGCGT	2	12	414281	414292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010508	GGCCGC	2	12	440569	440580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010508	AAATCG	2	12	461719	461730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010508	TGAAGC	2	12	462088	462099	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010508	GGCGCG	2	12	509748	509759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010508	CAAAAA	2	12	518459	518470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010508	CGCGGC	2	12	535941	535952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010508	GCCAGG	2	12	550931	550942	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010508	GGCGTT	2	12	609752	609763	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010508	CGGCCC	2	12	623964	623975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010508	GCAGGA	2	12	648492	648503	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010508	CCGTCG	2	12	684773	684784	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010508	CGGCGA	2	12	709911	709922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010508	GATTCG	2	12	710638	710649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010508	GCCGGG	2	12	710707	710718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010508	TCAAAT	2	12	762058	762069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010508	GCCGGC	2	12	770936	770947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010508	GTAAAA	2	12	778137	778148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010508	CGCGGC	2	12	867690	867701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010508	CGTTGT	2	12	877973	877984	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010508	CAACGC	8	48	879891	879938	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010508	AAATCG	2	12	885714	885725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010508	GGCGAC	2	12	993564	993575	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010508	GCAATT	2	12	1009596	1009607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010508	AAAAAG	2	12	1061995	1062006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010508	CGGATG	2	12	1082228	1082239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010508	GGGCCG	2	12	1125313	1125324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010508	GGCGCG	2	12	1134966	1134977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010508	TTGCGC	2	12	1178053	1178064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010508	TTTTGT	2	12	1188342	1188353	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010508	GCCGCA	2	12	1204310	1204321	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010508	CGGAGG	2	12	1212128	1212139	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010508	CGGGCG	2	12	1239113	1239124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010508	AACGTG	2	12	1249815	1249826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010508	CAAAAC	2	12	1260677	1260688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010508	CGGAAA	2	12	1285637	1285648	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010508	GCCGGG	2	12	1341643	1341654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010508	TGATCC	3	18	1360242	1360259	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010508	CGCTCG	2	12	1408840	1408851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010508	TGGCAA	2	12	1424759	1424770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010508	GCGTCG	2	12	1474864	1474875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010508	CGGTGG	2	12	1487448	1487459	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010508	GAGAAG	2	12	1588428	1588439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010508	CCGCGC	2	12	1628084	1628095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010508	ACGTAT	2	12	1658134	1658145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010508	ATCTGA	2	12	1682343	1682354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010508	ATGCGC	2	12	1714400	1714411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010508	TGCGCC	2	12	1718791	1718802	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010508	CACCGG	2	12	1776836	1776847	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010508	CCTTTC	2	12	1784578	1784589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010508	TTCTGC	2	12	1824746	1824757	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010508	GACGGC	2	12	1828468	1828479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010508	TGCGCG	2	12	1828754	1828765	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010508	CGGGCG	2	12	1840334	1840345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010508	AACAGG	2	12	1857269	1857280	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010508	CGCGTC	2	12	1873123	1873134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010508	GCCGCA	2	12	1877996	1878007	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010508	GCCATG	2	12	1890979	1890990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010508	GCGCGG	2	12	1892663	1892674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010508	TGCCGA	2	12	1893397	1893408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010508	GCGAAT	2	12	1894897	1894908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010508	CTTGAC	2	12	1914178	1914189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010508	TTCGAT	2	12	1941301	1941312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010508	TGCAGA	2	12	1965153	1965164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010508	TCCCGC	2	12	1973102	1973113	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010508	GCGACC	2	12	1989350	1989361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010508	CGCCGG	2	12	2004516	2004527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010508	CGGGCA	2	12	2012729	2012740	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010508	CGCATG	2	12	2017947	2017958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010508	CGGGTC	2	12	2028865	2028876	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010508	GCCGAT	2	12	2048128	2048139	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010508	TGAACG	2	12	2061004	2061015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010508	GTGAAG	2	12	2078195	2078206	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010508	GCCCGT	2	12	2097995	2098006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010508	CGGCCG	2	12	2114011	2114022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010508	TTTTCG	2	12	2116604	2116615	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010508	CCGGGC	2	12	2152804	2152815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010508	CATGCC	2	12	2157522	2157533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010508	GTCGAC	2	12	2214793	2214804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010508	CGCCGG	2	12	2214876	2214887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010508	TCGATA	2	12	2218513	2218524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010508	GCCCGG	2	12	2286626	2286637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010508	GAAAAA	2	12	2328318	2328329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010508	GCACAG	2	12	2361880	2361891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010508	AAAACG	2	12	2379392	2379403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010508	TCGAGC	2	12	2379589	2379600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010508	GAAAAT	2	12	2415515	2415526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010508	GGCGCA	2	12	2437675	2437686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010508	ACAACC	2	12	2470499	2470510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010508	CGCCTC	2	12	2479701	2479712	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010508	TTCTCA	2	12	2489555	2489566	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010508	CCCCGC	2	12	2491108	2491119	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
107	NC_010508	ATCGGA	2	12	2547470	2547481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010508	CCCGCG	2	12	2592583	2592594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010508	CCGGCG	2	12	2598058	2598069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010508	GCCAGC	2	12	2633580	2633591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010508	GCTCGC	2	12	2652352	2652363	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010508	GCGCTC	2	12	2696383	2696394	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010508	GCCCGC	2	12	2754535	2754546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010508	GGAGAT	2	12	2774730	2774741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010508	GCGGCC	2	12	2833123	2833134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010508	CTTTTT	2	12	2847374	2847385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010508	CGAATT	2	12	2935426	2935437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010508	CGACAA	2	12	2979138	2979149	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010508	AAATAC	2	12	2997159	2997170	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010508	TTCGAA	2	12	3014990	3015001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010508	CCGGAA	2	12	3028866	3028877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010508	AGCGCC	2	12	3040689	3040700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010508	TCGAAG	2	12	3100478	3100489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010508	TTTTTC	2	12	3135207	3135218	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010508	CCGCAC	2	12	3135854	3135865	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010508	AAATCG	2	12	3145239	3145250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010508	TCGCGC	2	12	3159839	3159850	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010508	TGTCGA	2	12	3172706	3172717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010508	CGGCGC	2	12	3176697	3176708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010508	ACGTCA	2	12	3218738	3218749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010508	GCCGGA	2	12	3300711	3300722	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010508	CTGAAA	2	12	3305233	3305244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010508	GCCGAC	2	12	3311224	3311235	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010508	CGCGGC	2	12	3320148	3320159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010508	TGTCGG	2	12	3382093	3382104	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_010508	CCTCGT	2	12	3406428	3406439	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010508	CCGGGC	2	12	3420538	3420549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010508	GCGTGC	2	12	3431321	3431332	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010508	TTTTCG	2	12	3434869	3434880	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_010508	CGGCCG	2	12	3448146	3448157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010508	GGGCCG	2	12	3527527	3527538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.