MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB401

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010180	TTATT	2	10	31451	31460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010180	AGGTA	2	10	41542	41551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010180	ATTAT	2	10	42389	42398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010180	AAGAA	2	10	43063	43072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010180	AAGCA	2	10	44659	44668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010180	AGAGT	2	10	49228	49237	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010180	TCCTT	2	10	56097	56106	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010180	AATTC	2	10	60415	60424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010180	AAAGA	2	10	63493	63502	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010180	AAACA	2	10	63671	63680	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010180	GAAGG	2	10	64345	64354	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010180	TAAAT	2	10	67215	67224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010180	AATAA	2	10	68965	68974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010180	TATTT	2	10	69160	69169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010180	ATTTT	2	10	72030	72039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010180	TTAAA	2	10	75540	75549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010180	AACTA	2	10	77697	77706	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010180	ATTTA	2	10	80194	80203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010180	TTTTA	2	10	81925	81934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010180	TAAAG	2	10	82049	82058	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010180	CATGC	2	10	91336	91345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010180	GAAGA	2	10	97680	97689	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010180	GGAAT	2	10	97955	97964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010180	TTCTA	2	10	101598	101607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010180	AGATA	2	10	103933	103942	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010180	TTCGG	2	10	105373	105382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010180	AAAGT	2	10	106452	106461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010180	CATTA	2	10	106560	106569	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010180	GTAAT	2	10	106597	106606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010180	AAGTG	2	10	116121	116130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010180	AGAGA	2	10	117467	117476	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010180	TGAAT	2	10	122209	122218	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010180	CAAAA	2	10	122604	122613	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010180	ATTAC	2	10	123314	123323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010180	CTCTC	2	10	124938	124947	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_010180	CTTAC	2	10	125590	125599	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010180	ATCTT	2	10	125681	125690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010180	AACAA	2	10	129531	129540	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010180	TCTTA	2	10	129782	129791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010180	ATTAA	2	10	130423	130432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010180	TTTTA	2	10	130508	130517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010180	TAATT	2	10	130646	130655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010180	CATTT	2	10	132045	132054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010180	ATTAT	2	10	133112	133121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010180	AATTA	2	10	137265	137274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010180	TTTAG	2	10	143647	143656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010180	TTTAA	2	10	144009	144018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010180	TAAAA	2	10	153176	153185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010180	ATATT	2	10	158723	158732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010180	CTAAA	2	10	158990	158999	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010180	GAATT	2	10	160195	160204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010180	AAATG	2	10	160319	160328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010180	TTTAG	2	10	160474	160483	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010180	CCTTT	2	10	162507	162516	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010180	CTTTT	2	10	164203	164212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010180	TATTT	2	10	164814	164823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010180	AAGTT	2	10	165916	165925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010180	TGATT	2	10	166041	166050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010180	ATTTT	2	10	168781	168790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010180	AAAAT	2	10	174057	174066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010180	ACTTA	2	10	175161	175170	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010180	GTTCA	2	10	175218	175227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010180	TATTT	2	10	182549	182558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010180	ACTTT	2	10	183371	183380	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010180	TTAAA	2	10	186773	186782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010180	TCTCC	2	10	189049	189058	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_010180	GATGA	2	10	191008	191017	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010180	TTTAT	2	10	192704	192713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010180	ATAAA	2	10	195951	195960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010180	TGATT	2	10	196254	196263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010180	AAATT	2	10	197140	197149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010180	TAAAA	2	10	199080	199089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010180	TTAAA	2	10	199228	199237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010180	AAATA	2	10	200948	200957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010180	TATAT	2	10	201090	201099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010180	TTATA	2	10	202303	202312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010180	TTCTT	2	10	202322	202331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010180	TCAAT	2	10	206514	206523	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010180	CGCAT	2	10	207013	207022	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_010180	ATTTT	2	10	209096	209105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010180	AATTA	2	10	209256	209265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010180	ATAAA	2	10	209287	209296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010180	TGATA	2	10	209376	209385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010180	AATTT	2	10	210437	210446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010180	TAAAT	2	10	210825	210834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010180	AAATC	2	10	210955	210964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010180	TAATA	2	10	212226	212235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010180	GTAAT	2	10	213763	213772	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010180	TATTG	2	10	254229	254238	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010180	TTATA	2	10	254508	254517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010180	CTTTT	2	10	254914	254923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010180	AACAA	2	10	256383	256392	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010180	TTTTG	2	10	256418	256427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010180	ATGAA	2	10	261032	261041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010180	ATTAT	2	10	261042	261051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010180	ACTTC	2	10	261490	261499	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_010180	AAGAT	2	10	261842	261851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010180	ATCTT	2	10	261863	261872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010180	CTTTT	2	10	263034	263043	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010180	TTTTG	2	10	266631	266640	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010180	TTATA	2	10	271244	271253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010180	TAATT	2	10	276693	276702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010180	AAATT	2	10	276721	276730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010180	ATTGT	2	10	276907	276916	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010180	TAATA	2	10	277169	277178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010180	GTAAA	2	10	277713	277722	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010180	ATATG	2	10	285380	285389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010180	GAAAT	2	10	285470	285479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010180	TGTCT	2	10	289845	289854	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010180	TAACA	2	10	289875	289884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010180	TTTAC	2	10	290138	290147	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010180	TATAT	2	10	296137	296146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010180	TACTT	2	10	296390	296399	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010180	AGGGG	2	10	296507	296516	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010180	AATGA	2	10	299522	299531	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010180	GAAAA	2	10	300251	300260	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010180	TTTTA	2	10	301286	301295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010180	TATCT	2	10	304190	304199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010180	TTATC	2	10	304200	304209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010180	TGATA	2	10	308931	308940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010180	TAAAT	2	10	309760	309769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010180	TATTT	2	10	311600	311609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010180	AAAAT	2	10	312642	312651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010180	ATATC	2	10	320796	320805	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010180	GAAGG	2	10	320863	320872	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010180	TAGTG	2	10	326533	326542	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010180	TTTAA	2	10	326746	326755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010180	AAAAG	2	10	332029	332038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010180	ATTTT	2	10	332451	332460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010180	TTAAT	2	10	332863	332872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010180	AAAGA	2	10	334980	334989	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010180	TGTAA	2	10	335833	335842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010180	TAAAA	2	10	339517	339526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010180	AGGGG	2	10	341072	341081	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010180	TAAAT	2	10	344020	344029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010180	ATTTT	2	10	344631	344640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010180	TAAAG	2	10	344976	344985	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010180	AACTT	2	10	349851	349860	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010180	ATTGT	2	10	352470	352479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010180	TAATC	2	10	352904	352913	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010180	ATTAA	2	10	356026	356035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010180	GAAGT	2	10	356966	356975	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010180	TAATT	2	10	361248	361257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010180	AGTAT	2	10	364167	364176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010180	CTTTA	2	10	369168	369177	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010180	AGAAA	2	10	370501	370510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010180	AAATT	2	10	371206	371215	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010180	GTTTT	2	10	372506	372515	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010180	TAACC	2	10	378057	378066	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_010180	GGTTA	2	10	378489	378498	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010180	ACTAC	2	10	383110	383119	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_010180	ACAAT	2	10	385511	385520	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_010180	TAGTC	2	10	390251	390260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_010180	AAACG	2	10	390303	390312	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.